人类ES细胞神经诱导与VPA处理
建立人类NPCs模型并施加VPA处理,以观察其对神经分化的影响。
使用H8人ESC系进行神经诱导,形成神经玫瑰花结后,用1 mM VPA处理3天。
Glycolysis mediates neuron specific histone acetylation in valproic acid-induced human excitatory neuron differentiation.
包含体外人类ES细胞分化模型、原代小鼠神经干细胞实验、线粒体功能检测、ECAR代谢分析、Western blot、免疫细胞化学和ChIP等多层级验证。
人类胚胎干细胞系H8来源的神经祖细胞(NPCs) 小鼠原代神经干细胞
VPA处理浓度为1 mM,处理3天 2-DG处理剂量和时机:2-DG在VPA处理后3-5天添加 样本量:每次实验至少3批细胞 检测时间点:代谢分析在VPA处理后3天,分化评估在8天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立人类NPCs模型并施加VPA处理,以观察其对神经分化的影响。
使用H8人ESC系进行神经诱导,形成神经玫瑰花结后,用1 mM VPA处理3天。
检测VPA处理是否改变NPC增殖和向兴奋性或抑制性神经元分化。
通过免疫细胞化学和Western blot检测Pax6、Sox2、Ki67、Tuj-1、CaMKII、VGLUT2、DLX2和NKX2.1的表达。
探究VPA处理是否改变线粒体功能和糖酵解活性。
使用MitoSOX和TMRM染色检测线粒体超氧化物和膜电位;测量呼吸链复合物I、II、IV活性和ATP水平;通过ECAR测定和RT-PCR检测糖酵解相关基因表达。
验证糖酵解是否介导VPA诱导的兴奋性神经元分化。
在VPA处理后3-5天加入2-DG,随后检测神经祖细胞和神经元标志物的表达。
探究糖酵解是否影响VPA诱导的组蛋白乙酰化和神经元特异性转录因子表达。
通过Western blot检测H3ac和H3K9ac水平,免疫细胞化学和Western blot检测Ngn2和Mash1表达,ChIP检测H3K9ac在Ngn2和Mash1启动子上的结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | mTeSR1培养基 | STEMCELL Technologies | 85850 |
| Accutase | STEMCELL Technologies | 07920 | |
| 神经诱导 | STEMdiff SMADi 神经诱导试剂盒 | STEMCELL Technologies | 08582 |
| 细胞培养 | Matrigel基质胶 | Corning | 354277 |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 21103-049 | |
| DF12培养基 | Sigma-Aldrich | D8437 | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 脑源性神经营养因子 | Peprotech | 45002 | |
| 胶质细胞源性神经营养因子 | Peprotech | 45010 | |
| 药物处理 | 丙戊酸钠 | Sigma-Aldrich | P4543 |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | PlantChemMed Biology Co., Ltd. | PC-43587 | |
| 免疫细胞化学 | 兔抗Sox2抗体 | GeneTex | GTX101507 |
| 兔抗Pax6抗体 | GeneTex | GTX113241 | |
| 兔抗Ki67抗体 | GeneTex | GTX16667 | |
| 小鼠抗Tuj-1抗体 | GeneTex | GT11710 | |
| 兔抗Neurogenin 2抗体 | GeneTex | GTX129258 | |
| 小鼠抗CaMKII抗体 | Abcam | ab22609 | |
| 兔抗Mash1抗体 | Abcam | ab74065 | |
| 兔抗VGLUT2抗体 | Cell signaling technology | 71555 | |
| 兔抗组蛋白H3多克隆抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 594二抗 | Invitrogen | A-21207 | |
| 驴抗小鼠Alexa Fluor 594二抗 | Invitrogen | A-21203 | |
| 兔抗组蛋白H3乙酰化抗体 | Active Motif | 616378 | |
| 小鼠抗组蛋白H3K9乙酰化抗体 | Active Motif | 91104 | |
| 细胞核染色 | DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 |
| Western blot | 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Bioss | bs-0296G |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | Zhonghuihecai | PB002 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Thermo | 32106 | |
| RT-PCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio Inc. | RR047A |
| TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 | |
| 通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal Technology Co., Ltd. | RM21203 | |
| 线粒体染色 | MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 |
| 四甲基罗丹明甲酯 | Invitrogen | I34361 | |
| 线粒体功能检测 | 线粒体呼吸链复合物I活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0515 |
| 线粒体呼吸链复合物II活性检测试剂盒 | Solarbio | BC3235 | |
| 线粒体呼吸链复合物IV活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0945 | |
| ATP检测试剂盒 | Solarbio | BC0300 | |
| ECAR测定 | Seahorse XF-24细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Upstate | -- |
| 兔抗H3K9ac抗体 | Abcam | AB10812 | |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Beyotime | C1089 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| VPA处理 | VPA浓度、处理时间、处理起始时间点 阅读提示:Methods 2.2 |
| 2-DG处理 | 2-DG浓度、处理时间窗口 阅读提示:Methods 2.2 |
| 线粒体功能检测 | MitoSOX和TMRM浓度、孵育时间;呼吸链复合物活性及ATP检测试剂盒操作 阅读提示:Methods 2.5, 2.6 |
| ECAR测定 | 细胞接种密度、试剂添加顺序及浓度、测量循环参数 阅读提示:Methods 2.6 |
| ChIP | 抗体浓度、固定时间、超声条件、引物序列 阅读提示:Methods 2.8 |