重组M1蛋白制备与验证
获得纯化的重组M1蛋白并确认其无内毒素污染,为后续功能实验提供材料。
将编码M1的DNA克隆至pEXPR-IBA 103载体,转染ExpiCHO细胞,5天后收获并超声裂解,通过Strep-Tactin XT树脂纯化,并用内毒素检测试剂盒确认无内毒素。
Influenza viral matrix 1 protein aggravates viral pathogenicity by inducing TLR4-mediated reactive oxygen species production and apoptotic cell death.
包含体外细胞实验(BMDM、MLE-12等)、体内小鼠模型(C57BL/6、TLR4敲除)、病毒挑战实验、抗体验证实验及RNA-seq转录组分析,多层级验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 小鼠肺上皮细胞系(MLE-12) 小鼠模型(C57BL/6和TLR4敲除) 流感病毒PR8感染小鼠模型
M1蛋白的寡聚形式(>50 kDa)而非单体形式激活TLR4 rM1处理浓度15 μg/ml及处理时间 TLR4基因敲除对M1诱导炎症和细胞死亡的影响 rM1给药时间(感染前3天、同时、感染后3天)及剂量30 μg/只 抗M1血清或IgG给药方案(200 μl或15-200 μg,每日一次,持续3天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得纯化的重组M1蛋白并确认其无内毒素污染,为后续功能实验提供材料。
将编码M1的DNA克隆至pEXPR-IBA 103载体,转染ExpiCHO细胞,5天后收获并超声裂解,通过Strep-Tactin XT树脂纯化,并用内毒素检测试剂盒确认无内毒素。
检测M1蛋白能否激活宿主细胞中的炎症信号通路。
用rM1处理BMDM、MLE-12和BAL细胞,通过免疫印迹检测NF-κB和MAPK通路激活,ELISA检测促炎细胞因子和趋化因子,RNA测序分析炎症基因表达。
验证TLR4是否为M1的受体,并确认其介导M1诱导的炎症反应。
使用TLR4报告细胞检测M1的激活活性,免疫沉淀检测M1与TLR4的物理相互作用,并比较野生型与TLR4敲除BMDM对M1的反应。
验证M1是否通过ROS和胱天蛋白酶途径诱导细胞凋亡。
用rM1处理BMDM,检测促凋亡因子(Bim、Bak)、细胞色素c释放、胱天蛋白酶裂解及LDH释放,并用ROS抑制剂NAC和泛胱天蛋白酶抑制剂Z-VAD-FMK处理验证细胞死亡途径。
验证M1在体内是否诱导肺部炎症和细胞死亡。
通过鼻内注射rM1处理小鼠,检测肺部免疫细胞激活、细胞因子水平、ROS、LDH、白蛋白及组织病理学变化。
验证M1对流感病毒感染致命性的影响及抗M1抗体的保护作用。
在PR8流感病毒感染前、同时或感染后3天给予rM1,监测存活率和体重;用抗M1血清或纯化IgG处理感染小鼠,评估治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 重组蛋白表达 | ExpiCHO细胞 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 重组蛋白纯化 | Strep-Tactin XT树脂 | IBA Lifesciences | -- |
| 内毒素检测 | 内毒素检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 抗生素 | Gibco | -- | |
| MLE-12细胞 | ATCC | -- | |
| HEK-Blue TLR4细胞 | InvivoGen | -- | |
| L929细胞 | ATCC | -- | |
| 肺样本准备 | 胶原酶D | Gibco | -- |
| 脱氧核糖核酸酶I | Merck | -- | |
| 蛋白酶抑制剂 | Merck | -- | |
| Western blot | CETi裂解缓冲液 | TransLab | -- |
| PVDF膜 | Merck | -- | |
| Immobilon Forte Western HRP底物 | Merck | -- | |
| EZ-Capture II成像系统 | ATTO Corporation | -- | |
| 抗磷酸化SAPK/JNK抗体 | CST | 9255 | |
| 抗SAPK/JNK抗体 | CST | 9252 | |
| 抗磷酸化p44/42 MAPK抗体 | CST | 4370 | |
| 抗p44/42抗体 | CST | 4695 | |
| 抗磷酸化p38 MAPK抗体 | CST | 4511 | |
| 抗p38 MAPK抗体 | CST | 54470 | |
| 抗磷酸化IκB抗体 | CST | 2859 | |
| 抗IκBα抗体 | CST | 4812 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | CST | 3033 | |
| 抗COX1抗体 | CST | 9896 | |
| 抗COX2抗体 | CST | 12282 | |
| 抗iNOS抗体 | CST | 13120 | |
| 抗Bim抗体 | CST | 2933 | |
| 抗磷酸化Bad抗体 | CST | 5284 | |
| 抗Bak抗体 | CST | 12105 | |
| 抗caspase-3抗体 | CST | 9665 | |
| 抗caspase-6抗体 | CST | 9762 | |
| 抗caspase-7抗体 | CST | 8438 | |
| 抗caspase-9抗体 | CST | 9508 | |
| HRP标记抗小鼠IgG | CST | 7076 | |
| HRP标记抗兔IgG | CST | 7074 | |
| 抗Strep-tag II抗体 | Abcam | ab76949 | |
| 免疫沉淀 | Dynabeads磁珠 | Invitrogen | -- |
| 抗TLR4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-293072 | |
| 抗流感M1抗体 | Sino Biological | 40010-RP01 | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| CXCL1 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| CXCL10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| CCL2 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| CCL5 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| LDH检测 | CyQUANT LDH细胞毒性检测试剂盒 | Invitrogen | -- |
| ROS检测 | 体外ROS/RNS检测试剂盒 | Cell Biolabs Inc. | -- |
| RNA-seq | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| ND-2000分光光度计 | NanoDrop | -- | |
| 安捷伦2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| GeneChip Whole Transcript PLUS试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Affymetrix GeneChip小鼠ST 2.0芯片 | Affymetrix | -- | |
| GeneChip流体工作站450 | Affymetrix | -- | |
| GCS3000扫描仪 | Affymetrix | -- | |
| TLR报告基因检测 | HEK-Blue检测培养基 | InvivoGen | -- |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/CD32抗体 | BD Biosciences | -- |
| APC抗CD4抗体 | Thermo Fisher Scientific | 17-0042-82 | |
| PerCP-eFluor 710抗CD3e抗体 | Thermo Fisher Scientific | 46-0033-82 | |
| PE/Cyanine7抗CD45R抗体 | Thermo Fisher Scientific | 25-0452-82 | |
| PE抗Siglec-F抗体 | Thermo Fisher Scientific | 552126 | |
| PerCD-eFluor 710抗Ly6G抗体 | Thermo Fisher Scientific | 46-9668-82 | |
| Alexa Fluor 700抗MHC II类I-A/I-E抗体 | Thermo Fisher Scientific | 56-5321-80 | |
| eFluor 450抗F4/80抗体 | Thermo Fisher Scientific | 48-4801-82 | |
| APC/cyanine7抗CD45抗体 | BioLegend | 103116 | |
| APC抗CD11b抗体 | BioLegend | 101212 | |
| PE抗CD49b抗体 | BioLegend | 103506 | |
| FITC抗NK1.1抗体 | BD Biosciences | 553164 | |
| Gallios流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| FlowJo软件 | Becton, Dickinson and Company | -- | |
| 抗体制备 | pGX-10质粒 | -- | -- |
| IgG抗体纯化试剂盒 | Abcam | -- | |
| 白蛋白检测 | BCG白蛋白检测试剂盒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 重组M1蛋白制备 | M1基因序列(GenBank: CY147535.1),表达载体(pEXPR-IBA 103),宿主细胞(ExpiCHO),转染和纯化条件 阅读提示:材料与方法:重组M1蛋白 |
| 体外细胞处理 | rM1浓度(15 μg/ml)、处理时间(15分钟至48小时),细胞类型(BMDM、MLE-12、BAL细胞) 阅读提示:材料与方法:细胞培养;图1-3的图注 |
| TLR4验证 | TLR4报告细胞系,TLR4敲除小鼠来源的BMDM,免疫沉淀步骤(处理时间30分钟,抗体:anti-TLR4和anti-M1) 阅读提示:材料与方法:TLR报告细胞系检测;图2图注 |
| 体内实验 | 小鼠品系(C57BL/6,8-12周龄),rM1剂量(15或30 μg),给药途径(鼻内),时间点(6小时至3天) 阅读提示:材料与方法:实验方案;图4和图5图注 |
| 病毒感染与治疗 | 流感病毒PR8剂量(32 PFU),rM1处理时间(感染前3天、同时、感染后3天),抗M1血清剂量(200 μl)及给药方案(腹腔注射,每日一次,持续3天) 阅读提示:材料与方法:实验方案;图6和图7图注 |