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本研究通过联合单细胞空间数据分析，确定了肠道细胞、胃细胞与IM严重程度相关，干细胞显性IM与恶性细胞群相似的表达特征。其中SOX9在特定的细胞类型中（胃LYZ+细胞、肠道干细胞）中高表达。

本研究通过单细胞联合空间技术，绘制了小鼠整个大脑空间细胞图谱，并系统地分析了大脑中的神经元和非神经元细胞类型，确定了每种细胞类型的转录组和空间特异性之间的相关性

近日，一项源自重庆的大规模社区研究，宛如划破重重夜幕的璀璨曙光，为认知障碍的防治开辟出全新方向，带来了希望。

化疗耐药性可归因于肿瘤内的细胞-细胞网络，癌细胞与其他非癌细胞（癌症相关成纤维细胞，CAFs）通过细胞间相互作用，从而获得化疗耐药性

大脑中枢的边界涵盖了颅骨、脑膜、脉络丛及血管旁间隙等，而脑脊液则作为这一边界区域内重要的物质交换媒介。在中枢边界屏障稳定性受损的情况下，这些屏障可能转变为活跃的中枢-外周交互界面，促进疾病的发展。大脑作为原发性及转移性癌症的高风险区域，肿瘤的生长、免疫细胞的募集以及血管的异常改变，会形成了一个独特的病理性微生态系统，对中枢边界屏障稳定性产生潜在的影响。

通过单细胞RNA测序和SMI空间转录组技术，揭示了健康和疾病状态下滑膜组织中DC亚群的分布及其功能特征

在上一篇文章中，我们介绍了传统机器学习的基础知识和多种算法。在本文中，我们会介绍人工神经网络的原理和多种神经网络架构方法，供各位老师选择。

本研究通过多组学分析深入探讨了化疗对卵巢癌肿瘤微环境的影响，揭示了化疗后CD8+T细胞的衰竭与髓系细胞的相互作用在卵巢癌免疫逃逸中的重要作用。研究发现，在髓系细胞密集的区域，化疗不仅导致CD8+T细胞的显著浸润，

本研究利用 10x Visium HD平台，研究来自人结直肠癌CRC和正常邻近黏膜组织（NAT）FFPE样本，同时还通过Xenium，Visium CytAssist（V2）的检测数据对Visium HD 的结果进行了验证。

共聚焦显微镜以激光作为光源，激发组织细胞中荧光标记的分子和结构产生荧光信号，通过检测器收集信号从而进行高分辨率的成像。

热图在很多文章中都有出现，如何画出让人眼前一亮的热图？ComplexHeatmap包具有非常高的可定制性，无论是热图的颜色搭配、字体样式，还是聚类方式、注释信息，每一个细节都能按照您的想法精心雕琢。

传统机器学习，一般指不基于神经网络的算法，适合用于开发生物学数据的机器学习方法。尽管深度学习（一般指神经网络算法）是一个强大的工具，目前也非常流行，但它的应用领域仍然有限。

肝脏和肠道通过门静脉（PV）直接相连，门静脉是将肠道吸收的营养物直接输送到肝脏的血管。在正常情况下，肝脏的免疫系统能够抵御入侵的肠道细菌和相关物质，但目前对于肝脏免疫系统抵御炎症的确切机制尚不清楚。

在我们对单细胞数据进行一系列分析之后，有什么好的方式来展示这些分析结果呢？柱状图可能是您可选的一种方式。柱形图，一种能展示出很多种花样来可视化展示方式。

本研究首先通过RNA-seq以及ATAC-seq技术对12个JAK-STAT突变小鼠模型进行分析，确定了JAK-STAT信号通路在维持免疫细胞稳态中的核心调控地位

近日，Joseph J. Zhao 等研究团队在《Gastroenterology》期刊上发表了题为《Spatially Resolved Niche and Tumor Microenvironmental Alterations in Gastric Cancer Peritoneal Metastases》的文章。

类器官（Organoids）是一种体外培养的三维细胞结构，它们能够模拟真实器官的组织结构和部分功能。

皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）是一种皮肤中的T细胞克隆型恶性肿瘤，其中最常见的类型为蕈样真菌病（Mycosis fungoides）。

单细胞拷贝数变异（CNV）分析基于单细胞转录组数据，利用不同样本或不同细胞类型之间的基因表达量预测大规模染色体水平的CNVs，发现拷贝数异常的细胞，从而帮助推断肿瘤恶性细胞，为肿瘤异质性、克隆进化的研究奠定基础。

通过DSP技术分析4例HSCC患者的正常、肿瘤和淋巴组织中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的基因表达差异，揭示了与肿瘤发生和免疫微环境相关的关键基因变化。