上海生物芯片有限公司

3

手机商铺

qrcode
商家活跃:
产品热度:
  • NaN
  • 0.7000000000000002
  • 0.7000000000000002
  • 1.7000000000000002
  • 0.7000000000000002

上海生物芯片有限公司

入驻年限:3

  • 联系人:

    黄小姐

  • 所在地区:

    上海 浦东新区

  • 业务范围:

    医疗器械、试剂、细胞库 / 细胞培养、ELISA 试剂盒、技术服务、体外诊断

  • 经营模式:

    生产厂商 科研机构

在线沟通

公司新闻/正文

单细胞+空间组学技术助力化疗耐药性机制研究

155 人阅读发布时间:2025-02-12 14:05

编者按

化疗耐药性可归因于肿瘤内的细胞-细胞网络,癌细胞与其他非癌细胞(癌症相关成纤维细胞,CAFs)通过细胞间相互作用,从而获得化疗耐药性。因此,了解肿瘤内异质性和耐药性癌细胞的细胞-细胞网络对于确定化疗耐药性机制及治疗靶点至关重要。

卵巢透明细胞癌(OCCC)是一种预后不佳的妇科癌症,对于该疾病化学耐药性的机制尚不清楚。本研究通过结合单细胞和空间转录组学分析,综合分析肿瘤微环境以及癌症-非癌细胞间的相互作用网络,确定了一个化疗耐药性亚群HIF+OCCC亚群,该亚群定位于CAF聚集区,并与HIF-1ɑ激活相关。利用共培养技术,确定了HIF+癌细胞与癌症相关成纤维细胞(CAF)之间的反馈激活能够增强卵巢透明细胞癌的化疗耐药性。

 

文章详情 

图片
文章题目:Targeting PDGF signaling of cancer-associated fibroblasts blocks feedback activation of HIF-1ɑ and tumor progression of clear cell ovarian cancer
发表时间:2024.04
期刊名称:Cell Reports Medicine
影响因子:11.7
实验平台:10x 单细胞核测序(snRNA-seq);10x visium;多重免疫染色;共培养技术
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101532
图片

Fig.1 技术路线

 

 

 单细胞空间研究内容概述 

首先选择化疗敏感患者(n=5, OCC-S1–5)和化疗耐药患者(n=5, OCC-R1–5)进行单细胞核测序,共鉴定了4种主要的细胞类型,包括上皮癌细胞、CAFs、内皮细胞和免疫细胞。接下来,为了确定是否存在与化疗耐药相关的癌症亚群,研究者进一步对上皮癌细胞群进行聚类分群,将EpCAM+肿瘤群体分为6个亚群:Cancer#1-6。其中Cancer#2亚群生存期明显,与化疗抑制相关及不良预后联系有关。

 

图片

Fig.2 snRNA-seq

 

接下来,研究者利用10x Visium空间转录组技术确定Cancer#2亚群的空间定位(样本:化疗耐药患者样本(OCC-R2);化疗敏感患者(OCC-S3))。首先通过上皮癌细胞、CAFs、内皮细胞和免疫细胞的特异性marker空间表达结合降维聚类分群结果,将组织分为肿瘤细胞主导区域、CAF细胞主导区域以及混合区域,并与H&E染色结果中的癌细胞和CAFs细胞区域分布基本一致。然后通过STAR Methods整合单细胞空间数据,获得不同细胞亚群在每个spot点中的得分,结果显示Cancer#2亚群主要分布在肿瘤细胞和CAF细胞混合区域。这也与snRNA-seq结果一致,也说明了Cancer#2亚群和化疗耐药性之间的关联。

此外,研究者还发现化疗耐药肿瘤中HIF-1ɑ+癌细胞定位于CAF细胞附近。通过前人研究中的特征性marker,将CAF细胞亚群进一步分成不同亚群,发现myCAF的数量增加并且与化疗耐药有关。以上研究说明,HIF-1ɑ+肿瘤细胞与myCAF细胞共同构成了化疗耐药相关的癌症微环境。

图片

Fig.3 10x Visium空间转录组测序

 

 

 文章小结 

本研究通过结合单细胞分析和空间转录组学综合分析OCCC肿瘤微环境以及癌症-非癌细胞间的相互作用网络,从而确定化疗耐药性。研究鉴定了一个化疗耐药性亚群HIF+癌细胞亚群,主要定位于CAF聚集区,并与HIF-1ɑ激活相关。利用共培养技术,确定了HIF+癌细胞与癌症相关成纤维细胞(CAF)之间的反馈激活能够增强卵巢透明细胞癌的化疗耐药性。

上一篇

血中之钥:Simoa技术助力解锁认知衰退的生物密码

下一篇

项目文章:《Nature Cancer》首次揭示脑膜转移瘤中巨噬细胞硬脑膜-脑脊液迁移的动态过程及其调控机制

更多资讯

我的询价