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压力超负荷诱导的心肌肥大是心力衰竭的关键前驱病变，全球罹患人数超过6400万，严重威胁人类健康。尽管现有研究在经典炎症及纤维化通路方面取得诸多进展，但心肌重塑过程中细胞间相互作用的时空动态规律及关键代谢调控机制仍不清楚，尤其氨基酸代谢在其中的作用长期被忽视，导致靶向治疗策略发展受限。

原发性肝癌（PLC）是全球最常见且致死率高的恶性肿瘤之一，其发生与进展过程中呈现出显著的肿瘤异质性。不同肿瘤细胞亚群在转录状态、代谢特征及免疫调控方面均存在明显的异质性，这些差异往往决定着肿瘤的进展速度、治疗反应及患者预后。

当国家顶层设计锚定前沿科技，当生命健康成为全民共识，一项被写入十五五规划的“黑科技”，正悄然打破传统医疗的边界，它就是——器官芯片。

近日，国际顶刊《Nature》刊发深度报道：The age of animal experiments is waning. Where will science go next? 精准捕捉到全球生物医药领域的颠覆性变革：长期占据药物研发核心地位的动物实验，正逐步退出主流舞台，以器官芯片为核心的新方法学（NAMs）成为驱动行业向前的核心力量，为生物研发带来全新可能。

在肿瘤的发生、发展和治疗过程中，肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）扮演着至关重要的角色。TME是一个复杂而动态的生态系统，由多种细胞类型和非细胞组分共同构成，包括免疫细胞、成纤维细胞、血管内皮细胞、细胞外基质等

本研究基于单细胞空间转录组技术，在cSCC新辅助PD-1/PD-L1治疗背景下构建了六种空间生态位模型，证明肿瘤空间结构特征较传统PD-L1表达更能预测治疗反应，并揭示不同患者存在高度异质的免疫逃逸机制。研究结果提示，免疫治疗疗效不仅取决于单一分子表达水平，而是依赖于特定空间生态结构的存在与组合，为后续生物标志物开发与个体化治疗策略提供了新的方向。

经过前两期的梳理，TME内由TLS、血管周、干性T细胞生态位构成的“免疫激活轴”，以及由CAF、侵袭前沿、免疫排斥区构成的“免疫抑制网”，已形成清晰的互作框架。但一幅完整的肿瘤生态图谱，还需纳入代谢异质性、神经-免疫互作及微生物等维度。本期将解析最后三种关键生态位——缺氧生态位、神经免疫交界区和微生物驻留生态位。三者共同构成了TME中连接代谢、神经系统与外环境的重要接口，也为开发新型干预策略提供了跨界靶点。

在第一期中，我们系统梳理了TME内以免疫激活为核心的三类生态位。本期视角转向肿瘤的“防御工事”——CAF相关生态位、肿瘤侵袭前沿与免疫排斥生态位，它们常表现为物理屏障、代谢胁迫与空间隔离的格局。三者共同构成TME的“冷区”网络，直接关联治疗失败与疾病进展。

肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种以运动神经元进行性退化为特征的致命神经退行性疾病。大量研究表明，在疾病早期阶段，轴突功能障碍往往先于神经元胞体死亡发生，因此轴突被认为是ALS病理进程中最早受损的关键亚细胞区室。

肿瘤微环境（TME）是一个高度异质且动态的生态系统，由处于不同状态的免疫和基质细胞群体以及细胞外基质成分（ECM）共同构成，并在肿瘤进展和治疗反应过程中不断演化。已有研究揭示，TME 在空间上被划分成多个细胞生态位，这些生态位具有独特的细胞组成、分子特征与相互作用模式，且与免疫逃逸及肿瘤演进密切相关。本文将分三期，系统梳理这些功能生态位的组织特点、生物学意义及潜在临床价值。

1型糖尿病（T1D）的发生发展通常经历由正常（ND）到自身抗体阳性（AAB+）到临床确诊T1D的逐级演化过程。在这一过程中，胰岛β细胞的免疫攻击与功能衰竭被视为核心病理事件，但不同阶段的胰腺细胞类型是否共同参与病程推进、其基因调控网络是否发生方向性重写或偏移，尚缺乏系统性的空间与多组学证据。

在高分辨率空间转录组技术逐渐进入“数据丰富”时代的当下，真正的挑战已不再仅仅是获取数据，而是如何在复杂组织结构中清晰地理解和应用这些信息。napari-cosmx插件提供了一种回归真实组织空间进行观察和判断的有效方式。

ACT（Annotation of Cell Types）数据库是一个专为单细胞转录组数据“细胞类型注释”环节设计的在线一站式工具，由哈尔滨医科大学肖云课题组建立。该课题组手工整理了约 7000 篇文献中的 26000 多个细胞marker，构建出层次化的标记图谱。结合自开发的WISE（加权整合基因集富集）算法，将经典marker的普遍性与特定细胞类型的有序差异表达基因整合到该图谱中，完成细胞注释工作。

传统组学技术虽能获得分子信息，却无法保留组织的空间结构。空间组学让我们首次能在组织中原位解析分子表达的空间异质性：GeoMx DSP精准捕获特定区域的转录组特征，帮助鉴定结构特征标签；CosMx SMI将分辨率提升至“单细胞”水平，描绘每个细胞的基因表达与空间坐标。两项技术结合，既见森林（区域特征），又见树木（单细胞细节），为破解疾病机制提供了前所未有的立体视角。

BARICO 研究三年随访数据证实，代谢减重手术后38.6%的患者实现显著认知改善，这一获益与瘦素降低、脂联素及脑源性神经营养因子（Brain derived neurotrophic factor，BDNF）升高密切相关。单分子阵列（Single molecule array，SIMOA）技术以超高灵敏度突破局限，成为解析减重-认知关联的核心工具。

长期吸烟不仅是牙周炎的高危因素，更会以我们肉眼难以察觉的方式逐步侵蚀牙龈组织。本研究基于Visium HD空间转录组，对吸烟相关牙周炎（SP）患者的牙龈组织进行系统解析，构建了横跨上皮-基质-血管--免疫的空间病理网络。研究不仅描绘了细胞组成与结构的改变，还揭示了血管内皮与巨噬细胞的异常串扰是炎症升级的关键驱动，为吸烟诱导牙周组织破坏提供了关键机制证据，并指向潜在的靶点干预方向。

造釉细胞型颅咽管瘤（ACP）是位于鞍内或鞍上区的罕见颅内肿瘤，具有手术困难及严重术后并发症、高复发率等特点，迫切需要进一步研究ACP发展和复发的潜在机制，识别更多潜在的治疗靶点。

老年犬出现健忘、焦躁、昼夜颠倒？这些所谓的“老糊涂”，这可能是犬类认知功能障碍（Canine cognitive dysfunction syndrome，CCD）的早期信号。作为老年犬高发的神经退行性疾病，CCD诊断曾长期依赖主观行为量表，易漏诊、延误干预。单分子阵列（Single molecule array，Simoa）检测技术的出现，为CCD精准早期诊断带来了革命性突破。

动脉粥样硬化并非单纯的脂质沉积，而是一种免疫驱动的慢性炎症性疾病。尽管已有大量研究证实先天和适应性免疫参与病程，但免疫细胞在不同血管层次中的空间分布及其随病变进展的变化，

芯空一号快讯 | 为什么肾损伤会变成肾衰？关键细胞被首次锁定！VCAM1⁺/ICAM1⁺炎症型PT细胞揭示纤维化关键机制