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在本文中，我们会介绍机器学习领域的关键概念术语。在介绍时会尽量使用生物学事例，希望能帮助老师们更好地理解和掌握机器学习。

Bruker-NanoString团队在bioRxiv预印本上发表了一篇题为“使用空间分子成像技术对人FFPE组织进行整体编码蛋白基因亚细胞成像”的文章，研究人员使用CosMx Whole Transcriptome空间分子成像对不同FFPE组织及细胞系的基因表达实现了单细胞分辨率成像及分析。

为了克服现有实验方法的不足，“器官芯片”的创新实验体系开始崭露头角。这种培养容器内部空间更为精细，能够模拟人体组织中细胞间的相互作用和信息交流。

儿童期发病的系统性红斑狼疮（cSLE）患者相比成人更容易发展为狼疮性肾炎（cLN），且由于病程较长，累积肾脏损伤的风险更高。为了更深入地理解cLN的病理特征并开发精准的治疗策略，研究人员可使用单细胞RNA测序技术全面描述正常与病变组织中的细胞类型及状态

免疫荧光实验结合激光共聚焦显微成像技术，可以对细胞或组织中的特定蛋白质进行定位、定量和动态观察，特别是它们在三维空间中的分布。

在生命科学领域，生物学研究与机器学习的融合正成为推动科学拓展的关键力量。面对海量的生物数据，传统方法往往显得力不从心。

细胞因子是一类具有广泛生物学活性的小分子蛋白质，它们在体内相互促进或限制，形成极其复杂的免疫调节网络。因此对细胞因子含量的检测，在基础免疫研究、临床诊断、疗效判断等方面都具有重要价值。

人类染色体在遗传过程中，有时候会丢失或增加一部分，遗传学将这种DNA的增减现象称为拷贝数变异（CNV）。

高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）是最具侵袭性且死亡率最高的上皮性卵巢癌。尽管HGSOC肿瘤中存在T细胞和B细胞的浸润，且这种免疫细胞的浸润与较好的预后相关，但现有的免疫治疗方法仍未能有效利用这些细胞。

在皮肤病研究中，我们如何全面揭示细胞与组织微环境之间的复杂互动？空间多组学技术的兴起为这一挑战提供了前所未有的解决方案。

本研究利用单细胞转录组测序技术解析了PBC患者的分子机制，揭示了胆管细胞和肝星状细胞参与了肝脏炎症和纤维化的过程

这篇文章通过CosMx SMI、GeoMx DSP空间转录组学技术，深入分析了胶质母细胞瘤（GBM）在肿瘤核心和侵入性脑组织中的基因表达变化。研究发现，肿瘤核心的恶性细胞呈现出间充质样状态，而在侵入健康脑组织时，细胞逐渐转变为神经祖细胞样和少突胶质样状态。

免疫荧光技术，又称荧光抗体技术，是标记免疫技术中发展最早的一种。其基本原理是利用抗原抗体反应的高度特异性，将不影响抗原抗体活性的荧光色素标记在抗体（或抗原）上，与其相应的抗原（或抗体）结合后，在荧光显微镜下呈现一种特异性荧光反应。

Cell2location是桑格研究院（Sanger Institute）的Omer Ali Bayraktar团队于2022年所开发的单细胞-空间转录组整合工具

随着高通量测序技术的发展，生物学家能够获取大量的基因表达数据。

这篇文章利用CosMx™ SMI单细胞空间分子成像技术，对HIV感染小鼠模型的脾脏组织进行单细胞空间分析，揭示了HIV感染细胞的分布、类型和基因表达特征。

近日，上海生物芯片有限公司研发团队与上海交通大学窦红静教授团队、以色列希伯来大学Uri Raviv教授团队在中科院一区杂志Carbohydrate Polymers （IF=10.7）上联合发表论文“Dextran-based nanodrugs with mitochondrial targeting/glutathione depleting synergy for enhanced photodynamic therapy”。

本研究通过空间多组学分析，全面描述了肝癌微环境中的肿瘤基质和CAFs的特征。新发现了一个肝脏CAF亚群，以COL1A2、COL4A1、COL4A2、CTGF和FSTL1的表达为标志，并命名为F5-CAF。

亚细胞定位是指将生物大分子定位到细胞中的某个具体位置，有助于发现其作用。

采用肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）过继细胞治疗（ACT）可以消除或缩小转移性黑色素瘤，但其长期疗效仍仅限于一小部分患者