公司新闻

单细胞空间多组学技术掀起了生命科学研究的革命。这些技术不仅能够揭示细胞异质性，还能展示细胞在组织中的空间分布，为理解疾病的病理机制提供了全新视角。利用这些先进技术，研究人员首次全面解析了肛周克罗恩病瘘管（PCD）的复杂微环境。揭示了致病性Th17细胞和髓系细胞的关键贡献，并为抗TNF治疗的效果提供了全新解释。这项研究不仅深化了对PCD病理机制的理解，还展示了单细胞空间多组学技术在临床研究中的巨大潜力。

肝器官芯片同时支持多种肝实质/非实质细胞生长，通过微流控系统驱动培养基的连续灌注，能够确保这些细胞维持正常的生长、代谢以及在其他因素刺激后呈现应有的反应状态，从而达到模拟肝脏微小结构单元的生理或病理状态。

本研究利用单细胞转录组测序技术生成了超过17种免疫细胞类型对86种细胞因子反应的“免疫词典”

如何绘制有新意的韦恩图？很多韦恩图中圆圈大小是一致的，而eulerr包会根据集合大小确定圈的大小，使绘制的韦恩图更加精确。下面我们来看下使用eulerr包绘制的不同参数下的韦恩图。

最新发表于《Cell》的研究利用单细胞转录组测序技术，揭示了非小细胞肺癌中表达CCL19的成纤维网状细胞（FRCs）如何形成支持T细胞活动的独特微环境。

在肿瘤研究的前沿战场上，空间多组学技术正掀起一场革命。传统方法只能提供细胞类型的“快照”，而空间多组学技术则为我们打开了一扇通往微观世界的窗户，让我们能够以前所未有的精度和深度

单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）揭示了单个细胞的基因表达情况，单细胞ATAC测序技术（scATAC-seq）专注于单个细胞的染色质开放性，显现了细胞内的基因调控情况

本研究通过对PASC患者肺组织（n=3）样本进行10x Visium空间转录组学及其它高分辨率成像技术检测，系统性地研究在PASC中CD8+ T细胞和巨噬细胞之间的相互作用在驱动肺纤维化中的机制

中心（公司）超高分辨率激光共聚焦显微镜平台搭建的Leica Stellaris 5超高分辨率激光共聚焦系统，具有22mm均匀大视场及8K超高清扫描分辨率两大优势，同时搭载Power HyD检测器，可实现更高的光子探测效率。

本文使用SMI、CODEX等技术，系统地为数百名SCLC患者生成了宝贵的多组学数据，并基于此报告了单细胞水平上的肿瘤内异质性和免疫微环境的空间组织。

卵巢是女性生殖和激素分泌的重要器官，其功能在20至30岁达到顶峰，30岁后开始下降，50岁左右完全丧失功能。卵巢老化会导致一系列健康问题，如骨质疏松、心血管疾病和阿尔茨海默病。随着人类寿命的延长，延缓卵巢老化已成为一个重要的健康议题。

2024年刊登在nature methods上文章《 Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis 》打开了AI注释单细胞数据细胞类型的大门，文章中借助了大预言模型 GPT-4完成单细胞数据细胞类型注释，我们自主火爆全球的DeepSeek做单细胞数据的细胞注释会不会更牛？

为了探索能预测免疫检查点阻断（ICB）反应的生物标志物谱，研究者们已经开发了多种数据库和网络平台。

RNA速率（RNA Velocity）是一个描述基因表达状态随时间变化速率的概念。具体来说，它指的是已剪接mRNA（Spliced mRNA）和未剪接mRNA（Unspliced mRNA）的含量相对于时间的变化速率。

ComplexHeatmap包具有非常高的可定制性，上篇文章中我们了解了热图主体样式的一些调整，本次介绍的是热图注释。ComplexHeatmap包的注释功能非常强大，它可以在热图四周添加行或列的注释信息，如文本、色块、注释图片，注释颜色、大小、字体等。

本研究展示了来自30名非侵袭性和侵袭性阶段的肺癌腺癌患者的高分辨率空间转录组图谱。

本研究收集了来自肿瘤核心（TC）和周边脑组织（PTB）的配对样本，进行snRNA-seq和snATAC-seq分析。结果显示，从肿瘤核心浸润到周边脑组织的肿瘤细胞在转录组水平上更类似于少突胶质细胞前体细胞而非星形胶质细胞。

单细胞核RNA测序（snRNA-seq）技术以其很高的分辨率，解析了不同细胞类型的基因表达模式，揭示了共济失调-毛细血管扩张症（A-T）患者小脑和前额叶皮层中特异性的转录变化

本研究为胶质瘤细胞的空间分布形式提供了新的框架，并强调缺氧是这一框架的长期和核心的驱动因素。

现有常用的空间转录组降维聚类方法，如主成分分析（principal component analysis，PCA)、非负矩阵分解（non-negative matrix factorization，NMF）等，多是基于单细胞数据进行开发的，因此不一定完全适用于空间转录组数据。