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问
建立基因调控网络时的小问题
dxy_btpk2zd7
建议还是先看看GEO和基因表达的科普文章。GEO里的就是基因表达数据,有原始数据,有预处理过的。一般你最后拿到的应该是一个矩阵,行代表基因(通常会有2到5万),列是样本。你就从这个矩阵里挑基因出来,学习BN即可。当然,如何挑基因还是个很tricky的问题,也有很多方法。 关于重构基因调控网络,方法已经有很多。选取何种方法,关键取决于你想通过网络得到何种信息。BN十多年前就已经有所应用,听起来很fa
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问
寻找某基因-170到90序列时第一bp是CDS区起始密码atg中的A么?
bamboopiggy
启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。
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问
同种肿瘤不同细胞系之间比较某个lncRNA表达水平的话,该用什么内参
秋秋欣欣
我们组都是用的GAPDH ,结果也比较稳定
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问
茎环结构miRNA逆转录,是混合逆转录好,还是单管逆转录好?
哇哈哈哈321
做miRNA荧光定量,应该是单管逆转录好。
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问
如何检测细胞内的NADH
bamboopiggy
有专门的检测试剂盒,国产的都有。
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问
转投期刊咨询
府宅
期刊审稿偏慢,要4-8周,录取较难
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问
大家好,我是新手,最近做的WB结果,请大家点评谢谢谢谢!
bamboopiggy
你gapdh太强了,和你的目的条带分开显影,不要一起显,应该都会出来的。
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问
请教各位,内参不齐,怎么判断是转膜夹的问题还是上样量的问题呢
宁儿小贤
如果测过bca,调整过样品浓度的话就一般不是上样量的问题,看你的图不太像转膜夹的问题。
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问
请问显影膜上有黑点是什么原因?
宁儿小贤
膜上的黑点就是脏东西,膜很容易吸附其他物质,每次洗的时候时间长一点,多洗几次,镊子夹在同一个地方,尽量不要碰别的地方
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问
FLG跑WB一直跑不出来……
天一湖医者
可能原因:1、孵一抗的方法;2、抗体;3、曝光时间;4、转膜;5、手法不稳定;6、其他你根本没察觉到但对结果影响大的小毛病。
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问
细胞传代离心不下来
bamboopiggy
不是离心机的问题,感觉是你们细胞消化过了的样子,要不你镜下看看消化程度,然后收细胞。
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问
内参不齐这是什么原因?样品浓度是5
bamboopiggy
1 可能这个管家基因不适合在你的实验中做内参,换个内参,2,bca法测蛋白浓度还是有差异的,你可以根据这个内参,然后读个灰度值,再重新调一下内参
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问
针头过滤器求助
bamboopiggy
那种老式的滤器,需要自己组装的,但是现在大家基本都用一次性的了,自己组装的,弄不好会漏,还要自己高压灭菌比较麻烦,你可以问问一些中国的小的耗材公司可能会有。
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问
外泌体提取?提外泌体怎样才算的好?想请教大家一下。
府宅
WB检测可以发现样品中具有外泌体的标志物,可以一定程度上排除溶酶体、蛋白聚团、支原体等情。NTA粒径分析可以反应外泌体样品中粒子的群体特征,了解其纯度
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问
求教,大片段目的基因(6700bp)如何获取?
府宅
可以根据数据库选择表达量高的部位进行模板制备,这样的话,也比较容易扩增出来;可以分成两三段就可以了,选择合适的酶切位点;再次,选择高保真的聚合酶,这样扩增出来不容易出现突变,可以适当提高循环数,增大产量,可以设置梯度PCR,寻找最优的条件。
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问
蛋白纯化有活性无条带
bamboopiggy
你的酶活性太高了,可能蛋白浓度还不够wb检测的,那点点蛋白的酶活性就够了。
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问
怎么计算荧光共定位效率???
天一湖医者
在ImageJ菜单下Analyze,Plot Profile(快捷键Ctrl+K)可以找到Plot Profile工具。Plot Profile只适用于线(Line)和矩形(Rectangluar)选框,表示线段和矩形选框所经过的范围内的灰度变化: 对于仅含有红绿蓝三通道RGB格式荧光图片,可在ImageJ菜单下Image,Color,Split Channels,得到Red,Green,Blue
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问
真菌培养过程中所用培养基调整ph值后不易凝固
生如夏花zzh
酸度过高也可能导致培养基溶解。再试试看
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问
我做流式的时候,总是有非特异性染色,该如何避免
生如夏花zzh
排出一下是否有大量死细胞。重复性实验。
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问
求助PCR条带问题?
dxy_2cic6tye
用的多大浓度的胶?目的片段大的话,胶浓度应该低。另对照样本跑的怎么样?marker图谱是否正常
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