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我在寻找某个基因的启动子,根据NCB paper的报道,启动子在-170到90, 现在不知道这个第一bp是CDS区的ATG的A, 还是pubmed中mRNA编码区的第一个,求高手指点!
bamboopiggy
启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。转录起始点(TSS):转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。
哇哈哈哈321
后者,即便不知道这个,我们也可以推断,因为是启动子,启动子后面是SD序列或者koza序列,再之后才是ATG啊,假如+1以ATG的A开始,那么就包括了CDS的前面一段了,显然不符合要求。而mRNA的第一个碱基(其实更加准确是转录起始位点,因为会加G帽什么的,所以mRNA第一个碱基不是起始的)anyway,+1指的是开始转录的第一个碱基。
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