寻找某基因-170到90序列时第一bp是CDS区起始密码atg中的A么？

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dxy_btpk2zd7

2022-06-23

我在寻找某个基因的启动子，根据NCB paper的报道，启动子在-170到90，现在不知道这个第一bp是CDS区的ATG的A，还是pubmed中mRNA编码区的第一个，求高手指点！

2 个回答

bamboopiggy

2022-06-23

有帮助

启动子（promoter）：与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。转录起始点（TSS）：转录时，mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，通常为一个嘌呤。

哇哈哈哈321

2022-06-23

有帮助

后者，即便不知道这个，我们也可以推断，因为是启动子，启动子后面是SD序列或者koza序列，再之后才是ATG啊，假如+1以ATG的A开始，那么就包括了CDS的前面一段了，显然不符合要求。而mRNA的第一个碱基（其实更加准确是转录起始位点，因为会加G帽什么的，所以mRNA第一个碱基不是起始的）anyway，+1指的是开始转录的第一个碱基。