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问
对于小样本的代谢组,t检验可以不校正,或者调整阈值吗?
土井挞克树
小样本更需要校准,因为小样本误差较大
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问
可以推荐一些不同代谢组学标准数据库吗?
天一湖医者
常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD、LipidBlast、KEGG和Metlin等。
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问
找到差异代谢产物后,如何绘制代谢途径呢?就是如何找某个代谢产物在通路中的上下游呢?
天一湖医者
找到差异代谢物后,还需要挖掘和这些代谢物相关的代谢通路。可以采用MetaboAnalyst网站进行代谢通路分析(Metabolic pathway analysis),代谢通路分析分为富集分析(Enrichment analysis)和通路分析(pathway analysis)。通路分析中添加了通路拓扑分析(topology analysis),会输出通路在整体网络中的重要性(impact)。
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问
非靶向代谢组学和靶向代谢组学在应用上有何区别,选择依据是什么?数据处理可选择哪些软件?
天一湖医者
非靶向代谢组学可以全面、系统地分析源自生物体的所有代谢产物,是一种可以发现新生物标志物的无偏代谢组学分析。靶向代谢组学是对特定代谢产物的研究和分析。两者都有各自的优点和缺点,并且经常结合使用以发现和准确测定差异代谢物的含量,对后续代谢分子标记物的深入研究和分析。非靶向代谢组学和靶向代谢组学参与食品鉴定、疾病研究、动物模型验证、生物标志物发现、疾病诊断、药物开发、药物筛选、药物评估、临床研究、植物代
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问
HepG2细胞出现小亮点,怀疑是白色念珠菌,但24小时培养基仍是澄清的,数量增加。高倍镜下观察没有动,且板里存在黑胶虫污染
sswei
培养基不浑浊,就有可能是细胞碎片,这种一般是细胞死亡裂解导致,原因有:1.营养或培养条件不行,细胞死亡;2.黑胶虫污染。
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问
在反转录制备cDNA的第一阶段,加入引物和模板RNA以后,需要65°℃变性处理5分钟,有什么作用?为什么?
juyue2010
主要是为了打开RNA中的二级结构,产物引物于模版结合
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问
裂解液如何选择? 如何做泛素化的IP,条带怎么看
sswei
用于普通的Western、IP或co-IP,推荐使用Western及IP细胞裂解液,另外该裂解液裂解的产物也适合用于磷酸化蛋白的Western检测。对于某些特殊蛋白的IP,如果发现Western及IP细胞裂解液效果不是非常理想,可以尝试用RIPA裂解液(强、中或弱)或NP-40裂解液。如果发现IP的时候背景很高,即非特异的蛋白也被IP下来,则需要选用裂解强度较高的裂解液,例如RIPA裂解液(强或中
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问
黑胶虫污染,会影响动物造模实验吗
呵呵呵呵呵2333
黑胶虫污染会影响结果的准确性。
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问
单细胞测序是否需要生物学重复?一般需要多少个才可以?
sswei
临床样本在开展单细胞实验时,每组样本能至少达到6-8例;非临床样本开展单细胞转录组测序,每组样本数能至少达到5-6例。
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问
细胞消化的过了影响后续的功能试验吗
呵呵呵呵呵2333
会影响,细胞消化过了会影响试验
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问
细胞污染,被支原体污染
是TTT
可以高压灭菌加热培箱此方法更加方便:75%酒精擦拭培箱里面,将板子拆卸放入细胞操作台紫外灭菌半小时再重新装入细胞培基里面添加支原体抗生素预防支原体污染
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问
做细胞增殖实验,可以用丙酮作为药物溶剂吗? dmso溶解度太小,无法保证0.1%。
loveliufudan
丙酮可以用作药物溶剂,但需要注意以下几点:细胞对丙酮的敏感性较大,丙酮浓度过高会对细胞产生毒性作用,因此需要控制丙酮的浓度,一般建议不要超过0.5%。丙酮溶解药物的能力较差,需要根据药物的性质选择合适的溶剂。如果 DMSO 溶解度太小,可以考虑使用其他的溶剂,如甲醇、乙醇等。在实验过程中,应该设置合适的对照组,以评估丙酮对实验结果的影响。同时,还应该对丙酮进行空白对照实验,以确定是否会对实验结果产
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问
抗体纯化后的甘氨酸需要去除吗?甘氨酸的影响大吗?
是TTT
抗体纯化后的甘氨酸需要去除,甘氨酸的影响倒是不大,但是一般都会进行洗脱去除
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问
细胞铁死亡在光镜下能看到变化吗
dxy_mqg1dtg8
可以在投射电子显微镜下看线粒体的变化,发生铁死亡的细胞线粒体会变小,
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问
WB只能跑出来内参没有目的条带 求助
z流沙z
这种情况一般可能考虑抗体种属的问题,确认一下一抗二抗的种属正确
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问
HepG2细胞从边缘脱落,有什么可能的原因
是TTT
可能存在支原体污染,支原体污染是细胞培养过程中常见的污染。有两种方法可以检测:1.细胞培基里面添加一定量的支原体去除剂,观察细胞状态是否有所改善。2.有支原体检测试剂盒可以检测。
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问
coip结果分析-救救孩子吧!!!
是TTT
这种结果没有意义60的位置可能是重链,110没有条带你需要排除以下原因:一.跑input排除蛋白没有降解。二.确认A抗体说明书可以用来做co-ip。三.co-ip全程需要冰上或者4℃。四.co-ip完成以后,蛋白洗脱步骤是否无误。五.co-ip实验除了需要有实验组,还应该设置对照组,对照组应为同种属的iGg抗体去拉
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问
THP1细胞用PMA诱导分化成巨噬细胞后,还能继续增殖吗?
是TTT
理论上THP1细胞用PMA诱导分化成巨噬细胞后,增殖只是受到抑制,但是实际上基本不会再增殖。诱导前接种细胞细胞密度以1-2×10⒌为宜
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问
如何利用stata比较两组数据的相关性?
土井挞克树
建议你计算Pearson相关系数来看两组数据的相关性:具体命令格式:correlate(简写:cor或corr)[varlist][if][in][weight][,options]在Stata中,命令corr用于计算一组变量间的协方差或相关系数矩阵;命令pwcorr可用于计算一组变量中两两变量的相关系数,同时还可以对相关系数的显著性进行检验;option选项中加上sig可显示显著性水平:pwco
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问
链霉亲和素与生物素
是TTT
结合条件有三个:配体的种类,结合的程度,依附的部位生物素修饰的多肽正常连即可
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