组织，血清，血浆，尿液，细胞等样本前处理差异和注意事项

非靶向代谢组学研究中，针对不同样本类型的前处理差异和注意事项如下：

1. 组织样本：

样品破碎和提取：不同组织可能需要采用不同的破碎和提取方法，如机械破碎、液氮研磨、酸性/碱性溶液等。最佳方法应根据特定组织的特点和研究目的选择。

蛋白质去除：组织样本中通常含有较高的蛋白质含量，需要进行蛋白质去除步骤，以减少蛋白质对代谢物分析的干扰。常见的方法包括有机溶剂沉淀、醇沉淀等。

溶剂萃取：使用有机溶剂（如甲醇、乙腈）进行样品提取，以提取代谢物。

2. 血清和血浆样本：

血浆制备：血液样本需进行离心分离，分离血浆或血清。

血浆蛋白去除：血浆样本中的蛋白质会干扰代谢物的分析，需要进行蛋白质去除步骤，如醇沉淀、有机溶剂沉淀等。

血浆/血清样品冷藏：为了避免样品中代谢物的降解，血浆/血清样品通常需要冷藏保存，并尽量在冻存周期内完成分析。

3. 尿液样本：

样品净化：尿液样本中常含有较高的离子和有机物，可能干扰代谢物的分析。使用固相萃取（SPE）或其他净化方法，如离心滤膜、吸附剂等，进行样品净化。

pH调整：尿液的pH值对一些代谢物的稳定性和析出有影响，根据具体需求可能需要进行pH调整。

4. 细胞样本：

细胞提取：细胞样本需要经过细胞破碎和提取，以释放细胞内代谢物。常见的方法包括机械破碎、超声波破碎、冻融等。

蛋白质去除：细胞样本中的蛋白质会干扰代谢物的分析，需要进行蛋白

1.组织样本，最好用PBS（磷酸缓冲盐溶液，作为溶剂，起溶解保护试剂的作用）取完之后直接去血

2.对于体液标本，尽早进行实验，避免长时间冻存

组织样本建议使用冰冻切片进行DESI空间代谢组学实验；血浆和血清样本可以使用带有正压或负压的SPE装置；尿液样本处理较简单，直接使用有机溶剂稀释进样即可。详细操作可以参考nature protocol等文献中的描述