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问
我想问一下我做IP-ms后并没有检测到目标抗体蛋白,后面又做了IP-WB验证结果也是符合质谱的结果,这个是否能说明抗体有问题或者
赛默飞世尔科技
如果整个实验的操作步骤和实验设计没有问题的情况下,IP-MS和IP-WB结果都没有靶蛋白,说明目标蛋白表达量很低。但首先需要排除一下,IP过程中是否存在抗原结合水平低,抗原洗脱水平低等因素的影响。
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问
请问在Co-IP结果中,阴参也能IP下来是什么原因?已经增加了洗涤的次数,但是洗涤是颠倒混匀的。
土井挞克树
考虑是阴参受到了蛋白污染,或者抗体与某些组分非特异性结合产生了ip条带
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问
在我做COIP时,经常会出现IP组蛋白表达甚至超过了INPUT组,是什么原因?
土井挞克树
考虑是抗体特异度差,没有特异性检测到目的蛋白导致的
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问
IgG也有目的条带,但是比实验组的IP样品弱,怎么办
土井挞克树
igG条带弱可能是由于裂解液中的去垢剂浓度太高或配方过于剧烈、蛋白与蛋白之间的相互作用太弱或不太稳定等原因导致。相应的举措有:1、降低去垢剂浓度或更换去垢剂种类;2、受蛋白的亚细胞定位影响,则新选择裂解液配方来释放目的蛋白;3、选择亲和力更高的抗体以捕获更多的目的蛋白,从而捕获更多的相互作用蛋白;4、选择目的蛋白或相互作用蛋白含量高的样品进行免疫共沉淀实验。
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问
我想问下为什么我跑的input,Ip,IGg都有条带
赛默飞世尔科技
input和IP泳道条带可以根据分子量来判断一下是否为目的蛋白,igg泳道通常是会在25kd,50kd出现抗体轻重链干扰条带
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问
免疫共沉淀IP样品,洗不干净怎么办,
土井挞克树
可以用甘氨酸洗脱:甘氨酸洗脱1. 用10 mM的Tris-Cl缓冲液把Beads洗3次,3,000 g速度离心5 min,尽量吸尽洗涤液;2. 加入洗脱缓冲液(0.2 M Glycine, 0.15% NP40,pH 2.3),一般50 µL的beads 需加入75-100 µL洗脱buffer;3. 室温震荡洗脱 10 min;4. 2000 g离心2 min,吸取上清到新的EP管中;5. 重复
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问
洗涤液用TBS就可以吗,很多文献用什么NETN buffer
赛默飞世尔科技
不同的蛋白互做,其结合力是不同的。所以洗涤液不是通用的。常用PBS或TBS,如果出现非特异性条带,可以增加NaC l浓度,降低由离子静电引起的相互作用。或是加入低浓度的还原剂,打开由二硫键或亲和作用引起的结合。针对不同的样品,需要通过实验对洗脱液的成分进行优化。
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问
Flag beasds 拉下来的flag条带有拖尾现象怎么解决
赛默飞世尔科技
Flag条带有严重的拖尾现象,可能是蛋白发生了降解。每次操作好样品后快速至于冰上,离心保持4度。同时可以加一些蛋白酶抑制剂。
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问
Co-ip ,如何避免下拉抗体的污染
赛默飞世尔科技
免疫沉淀复合物是三部分组成的,Protein A(G)凝胶,抗体IgG分子,目标蛋白。SDS-PAGE后,这些成分都会一起转移到膜上。当检测抗体与捕获抗体物种来源相同的时候,二抗会识别捕获抗体的重链轻链分子,导致出现55kDa重链带,20-25kDa轻链带的干扰。避免这些杂信号的影响呢?常见的方法有捕获抗体、检测抗体采用不同来源物种,使用针对检测抗体物种的特异性二抗;如果有可能,捕获抗体采用没有恒
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问
某个基因已经敲除了,理论上蛋白没有表达,为什么还能拉下来蛋白
土井挞克树
可能是抗体特异度差,将杂质的结合误认为目的蛋白
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问
试剂盒去除不掉55的重链(频率很高)该如何解决
土井挞克树
可以在IP和WB实验中使用相同的抗体,如果目的条带在55kDa左右,可以通过选择与轻链特异性结合的二抗,来消除重链条带对目的蛋白检测的干扰。
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问
我做了几轮gst pulldown 拉不出来蛋白。可能有哪些原因呀
土井挞克树
1.选取的细胞中互作蛋白表达量很低;2.样品中含有的非特异蛋白过多3.样品中没有相互作用的蛋白质;4.样品中蛋白质浓度过低,肉眼难以观测到差异条带;
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问
用于Co-IP的适宜蛋白浓度和含量有推荐吗
土井挞克树
蛋白浓度一般在2-5ug/ul,每次5-10ul
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问
免疫共沉淀(Co-IP)实验目的蛋白高背景产生的原因及处理方法?
土井挞克树
目的蛋白高背景产生的原因有很多种,比如:1.有非特异性蛋白结合2.转移膜上的非特异性吸附针对有非特异性蛋白结合这种情况,我们可以在无血清培养液中裂解细胞,而对于转移摸上的非特异性吸附,我们就要注意实验的操作问题,一定要戴手套,用镊子夹取,以及不接触转移膜转移面。
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问
ip后蛋白分子量变化了(和input不在同一水平线上)是什么原因呢?
土井挞克树
首先要排除你的IP条带不是IgG的重链和轻链,再者排除你的一抗或者二抗没有污染,一般我们用新配的抗体理论上说IP的条带要和Input的一样。
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问
请问跑出来IgG泳道有和IP组一样目的条带大小的条带,且不是轻链重链的大小处,是什么原因呢?背景也很干净,没有杂带
loveliufudan
如果在免疫共沉淀(Co-IP)实验中,使用的IgG抗体出现与目的蛋白一样大小的条带,可能存在以下几个原因:免疫共沉淀实验中IgG抗体的浓度过高:如果使用的IgG抗体的浓度过高,可能会导致其在样品中非特异性地结合,从而产生与目的蛋白一样大小的条带。共沉淀的非特异性蛋白质:在样品中可能存在一些非特异性的蛋白质,这些蛋白质可能会与IgG抗体非特异性地结合,从而产生与目的蛋白一样大小的条带。良性异克隆:有
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问
flag beads 拉出来的flag条带有严重的拖尾现象是为什么?怎么解决?
土井挞克树
拖尾考虑是有样品裂解的问题,建议用新鲜的样品,最好是现煮现跑,不要过夜
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问
我跑出来的Co-IP,为什么IgG有很浓的条带
土井挞克树
ig G条带很浓可能是抗体特异性差的原因,建议更换特异度高的抗体
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问
请问IP抗体与IF抗体有什么区别?想做IP实验,但是没有目的蛋白的IP抗体,查了所有的公司,只有IF或者wb抗体,那么可以用IF
土井挞克树
不可以互用的,IF是荧光实验的抗体,Ip实验一定要用IP抗体
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问
(求助)大鼠CCD模型
loveliufudan
大鼠CCD模型的L形不锈钢棒通常需要根据实验需要进行定制,可以考虑以下几个途径:常规实验仪器供应商:大部分实验仪器供应商可以提供不同类型和规格的不锈钢棒,可以通过向供应商咨询和询价的方式了解相关信息。定制加工厂家:如果无法找到符合需求的标准规格不锈钢棒,可以考虑委托定制加工厂家制作符合实验需要的L形不锈钢棒。可以通过搜索相关加工厂家并进行询价等方式获取信息。个性化3D打印:使用3D打印技术可以根据
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