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科研学霸天团,48小时有问必答
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问
ip后蛋白分子量变化了(和input不在同一水平线上)是什么原因呢?
土井挞克树
首先要排除你的IP条带不是IgG的重链和轻链,再者排除你的一抗或者二抗没有污染,一般我们用新配的抗体理论上说IP的条带要和Input的一样。
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问
请问跑出来IgG泳道有和IP组一样目的条带大小的条带,且不是轻链重链的大小处,是什么原因呢?背景也很干净,没有杂带
loveliufudan
如果在免疫共沉淀(Co-IP)实验中,使用的IgG抗体出现与目的蛋白一样大小的条带,可能存在以下几个原因:免疫共沉淀实验中IgG抗体的浓度过高:如果使用的IgG抗体的浓度过高,可能会导致其在样品中非特异性地结合,从而产生与目的蛋白一样大小的条带。共沉淀的非特异性蛋白质:在样品中可能存在一些非特异性的蛋白质,这些蛋白质可能会与IgG抗体非特异性地结合,从而产生与目的蛋白一样大小的条带。良性异克隆:有
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问
flag beads 拉出来的flag条带有严重的拖尾现象是为什么?怎么解决?
土井挞克树
拖尾考虑是有样品裂解的问题,建议用新鲜的样品,最好是现煮现跑,不要过夜
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问
我跑出来的Co-IP,为什么IgG有很浓的条带
土井挞克树
ig G条带很浓可能是抗体特异性差的原因,建议更换特异度高的抗体
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问
请问IP抗体与IF抗体有什么区别?想做IP实验,但是没有目的蛋白的IP抗体,查了所有的公司,只有IF或者wb抗体,那么可以用IF
土井挞克树
不可以互用的,IF是荧光实验的抗体,Ip实验一定要用IP抗体
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问
请问老师,在病理状态下有些蛋白的作用是低亲和力的或者是短时间的结合,请问如何提高低亲和力活着短时作用的蛋白呢?
土井挞克树
可以使用交联剂增加蛋白间的亲和力和结合力,保证互作的检测
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问
蛋白丰度比较低,除了加大细胞投入量还有其他方法改进吗?
土井挞克树
蛋白丰度较低,可能是细胞裂解的不够充分,这时候需要更换裂解液,如果裂解充分建议还是增加细胞含量
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问
瞬时互作蛋白怎么交联
土井挞克树
可以选择紫外线交联,或者化学交联法。蛋白质通过交联方法可以稳定或永久连接相互作用复合物中的成分,有助于鉴别这些瞬时接触。
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问
交联剂的使用,是结合更容易和牢靠吗,感觉平时实验好像没用到
赛默飞世尔科技
交联剂主要是在相互作用较弱的蛋白互作检测中会用到,因为蛋白间相互作用较弱,很容易在样本制备过程中就破坏掉,所以这种情况下会推荐使用交联剂先固定住蛋白间的相互作用,以保证在后续CO-IP实验中被检测到。对于蛋白间相互作用比较强/稳定,在温和裂解液中不会破坏掉蛋白间的相互作用,这种情况就不需要用到交联剂。
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问
我想请问coip蛋白破碎离心后,浮在上层的白色物质会不会影响蛋白与珠子结合,有什么办法可以避免吸到白色物质吗?
土井挞克树
可以用吸管缓慢多次吸取掉白色物质,或者加pbs稀释,更容易清除一些
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问
免疫共沉淀-样品制备 哪些步骤是可以灵活调整的,比如哪一步可以暂停一下?
土井挞克树
一般建议尽快裂解,负八十度保存不要超过三个月,时间太长会造成蛋白降解
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问
裂解液成分中Triton x 100,NP-40,SDS,deoxycholate这几个哪些是CoIP比较适用的?为什么? 细
土井挞克树
我一般会选择Triton x 100,因为coip通常不需要那么强的裂解作用,其他几种容易裂解过度
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问
有适用于植物的IP裂解液产品吗
土井挞克树
可以选择植物RIPA裂解液,裂解效果比较强
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问
交联试剂盒里的细胞裂解液需要额外再加蛋白酶抑制剂么?
土井挞克树
一般是不需要的,裂解液中包含蛋白酶抑制剂,如果实验过程中蛋白降解太多,建议另外添加
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问
关于膜蛋白的Co-IP,有没有比较高效提取膜蛋白但是不破坏蛋白相互作用的裂解液呀
土井挞克树
这个可以考虑某些品牌新出的试剂盒,据说效果都不错,或者使用离心管柱法进行提取,能最大程度的保护蛋白性质不被破坏
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问
细胞裂解液用乙酰化抗体富集IP后,胶内酶解MS检测会不会丢失一些痕量修饰的蛋白
土井挞克树
又可能会少量丢失或降解,痕量修饰蛋白在酶解时可能有少量丢失
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问
老师用动物组织标本做COIP与细胞做COIP有什么区别?您更推荐哪个?
土井挞克树
胞内蛋白做coip一般选用细胞标本,胞外蛋白一般选择组织标本/
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问
老师:做COIP实验的时候,是必须选择平时所用的某特异的细胞,还是用工具细胞也可以?
土井挞克树
最好是特异细胞,特异度高的细胞可以避免分选误差。
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问
1.如遇组织标本,如何保证单细胞测序的细胞单一性? 2.如何就获得的数据进行深度挖掘? 3.如何平衡机体的个体差异与测序广泛性?
loveliufudan
1.针对组织标本进行单细胞测序时,保证细胞单一性的关键在于细胞的分离和捕获。通常采用酶消化、机械切割或磨碎等方法对组织样本进行分离和制备,然后通过流式细胞术、微流控芯片或微管阵列等技术将单个细胞捕获到反应管中进行测序。在这个过程中,需要注意以下几点:对组织样本进行消化或切割时,要尽量减少细胞的损伤和死亡,以避免影响单细胞测序的准确性。在捕获单个细胞时,要确保细胞的完整性和纯度,避免污染和杂交现象的
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问
细胞油红O染色一定要做成爬片吗
huarenqiang5
不是必须要进行爬片,但是建议进行爬片,因为直接在板里染板的话可能会导致染的不均匀,而影响观察从而导致结果有误。
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