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实验问答

23,119,425 科研人在看

科研学霸天团，48小时有问必答

问区分癌旁组织和癌组织可以实现活体上的定位么？还是现在只能组织切片

loveliufudan

区分癌旁组织和癌组织通常需要进行组织切片和病理学分析。这是目前常用的方法，可以通过显微镜观察和分析组织形态、细胞类型和病理变化来区分癌旁组织和癌组织。在活体上进行组织定位是一项复杂的任务，需要先对组织进行成像，然后进行实时的分析和判断。尽管有一些医学影像技术如超声、CT、MRI等能够提供体内组织的影像信息，但通常无法直接区分癌旁组织和癌组织。这些影像技术主要用于检测异常区域和指导进一步的诊断和治疗

3 回答890 围观

问如何提高desi-msi在组织精细结构中药物示踪的分辨率，喷雾溶剂的更换能否有效降低检测下限，如何实现对关注区域的定量分析

loveliufudan

要提高DESI-MSI)在组织精细结构中药物示踪的分辨率，可以考虑以下方法：优化喷雾角度和距离：调整DESI喷雾器的角度和距离，使其与样品表面的接触更加均匀。通过优化喷雾角度和距离，可以改善药物在组织表面的分布和信号强度，从而提高分辨率。优化喷雾溶剂组成：喷雾溶剂的组成对于DESI-MSI的性能至关重要。可以尝试不同类型的溶剂，如乙腈、甲醇、水等，以找到适合特定药物的最佳组合。溶剂的选择可能会影响

3 回答556 围观

问一级质谱仪和二级质谱仪有什么区别？以及如何选择合适的质谱仪

天一湖医者

区别：1、显示目标不同。一级质谱主要是给出目标物的分子量，GC-MS一级谱图可以定性分析，LCMS只能用于简单的分子量测定。一级质谱有的时候受仪器的分辨率影响，给出的质荷比不能准确定性，比如相同分子量的不同分子，在仪器分辨率不够足够高的时候很难区分。二级质谱可以看出目标物的部分碎片，可以对目标物的结构进行分析。一定程度上可以降低噪音，提高信噪比，从而提高灵敏度，从而也可以节省前处理步骤，可以更好地

3 回答2921 围观

问Waters的MSI仪器离子化模式相较于其他经典的MALDI、SIMS有什么优势

loveliufudan

Waters的MSI仪器采用离子化模式相较于传统的MALDI-MSI有以下一些优势：无需基质：传统的MALDI-MSI通常需要在样品表面施加基质，以促进样品中分析物的离子化和检测。而Waters的MSI仪器使用的离子化模式不需要基质，避免了基质对样品信号的干扰和制备过程的复杂性。多种离子化模式选择：Waters的MSI仪器支持多种离子化模式，如离子迁移、离子传输和离子化冷冻等。这些模式可以根据样品

3 回答460 围观

问对于小样本的代谢组，t检验可以不校正，或者调整阈值吗？

土井挞克树

小样本更需要校准，因为小样本误差较大

3 回答613 围观

问可以推荐一些不同代谢组学标准数据库吗？

天一湖医者

常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD、LipidBlast、KEGG和Metlin等。

3 回答819 围观

问找到差异代谢产物后，如何绘制代谢途径呢？就是如何找某个代谢产物在通路中的上下游呢？

天一湖医者

找到差异代谢物后，还需要挖掘和这些代谢物相关的代谢通路。可以采用MetaboAnalyst网站进行代谢通路分析（Metabolic pathway analysis），代谢通路分析分为富集分析（Enrichment analysis）和通路分析（pathway analysis）。通路分析中添加了通路拓扑分析（topology analysis），会输出通路在整体网络中的重要性（impact）。

3 回答1169 围观

问非靶向代谢组学和靶向代谢组学在应用上有何区别，选择依据是什么？数据处理可选择哪些软件？

天一湖医者

非靶向代谢组学可以全面、系统地分析源自生物体的所有代谢产物，是一种可以发现新生物标志物的无偏代谢组学分析。靶向代谢组学是对特定代谢产物的研究和分析。两者都有各自的优点和缺点，并且经常结合使用以发现和准确测定差异代谢物的含量，对后续代谢分子标记物的深入研究和分析。非靶向代谢组学和靶向代谢组学参与食品鉴定、疾病研究、动物模型验证、生物标志物发现、疾病诊断、药物开发、药物筛选、药物评估、临床研究、植物代

3 回答694 围观

问我的样本差异比较大的情况下，如何筛选生物标记物？

sswei

利用不同组学技术通过高通量筛选寻找不同疾病发生原因、早诊、预后、分型等不同层面的Biomarker，对同一种疾病的不同状态和过程进行精确分类，从而在此基础上对于疾病和特定患者设计个性化精准治疗方案。

3 回答191 围观

问检测scRNA-seq数据特定关键代谢基因在描述果蝇眼睛发育细胞凋亡的代谢方面是有效的，在单细胞分辨率中绘制代谢全景的方法有哪些

sswei

可用荧光显微图像和MALDI-成像（基质辅助激光解吸/电离）的特殊形式质谱结合使用。

3 回答253 围观

问在反转录制备cDNA的第一阶段，加入引物和模板RNA以后，需要65°℃变性处理5分钟，有什么作用？为什么？

juyue2010

主要是为了打开RNA中的二级结构，产物引物于模版结合

3 回答2097 围观

问细胞污染，被支原体污染

是TTT

可以高压灭菌加热培箱此方法更加方便:75%酒精擦拭培箱里面，将板子拆卸放入细胞操作台紫外灭菌半小时再重新装入细胞培基里面添加支原体抗生素预防支原体污染

9 回答1103 围观

问做细胞增殖实验，可以用丙酮作为药物溶剂吗？ dmso溶解度太小，无法保证0.1%。

loveliufudan

丙酮可以用作药物溶剂，但需要注意以下几点：细胞对丙酮的敏感性较大，丙酮浓度过高会对细胞产生毒性作用，因此需要控制丙酮的浓度，一般建议不要超过0.5%。丙酮溶解药物的能力较差，需要根据药物的性质选择合适的溶剂。如果 DMSO 溶解度太小，可以考虑使用其他的溶剂，如甲醇、乙醇等。在实验过程中，应该设置合适的对照组，以评估丙酮对实验结果的影响。同时，还应该对丙酮进行空白对照实验，以确定是否会对实验结果产

5 回答1812 围观

问抗体纯化后的甘氨酸需要去除吗？甘氨酸的影响大吗？

是TTT

抗体纯化后的甘氨酸需要去除，甘氨酸的影响倒是不大，但是一般都会进行洗脱去除

5 回答1281 围观

问细胞铁死亡在光镜下能看到变化吗

dxy_mqg1dtg8

可以在投射电子显微镜下看线粒体的变化，发生铁死亡的细胞线粒体会变小，

6 回答919 围观

问WB只能跑出来内参没有目的条带求助

z流沙z

这种情况一般可能考虑抗体种属的问题，确认一下一抗二抗的种属正确

6 回答1263 围观

问HepG2细胞从边缘脱落，有什么可能的原因

是TTT

可能存在支原体污染，支原体污染是细胞培养过程中常见的污染。有两种方法可以检测:1.细胞培基里面添加一定量的支原体去除剂，观察细胞状态是否有所改善。2.有支原体检测试剂盒可以检测。

5 回答428 围观

问coip结果分析-救救孩子吧！！！

是TTT

这种结果没有意义60的位置可能是重链，110没有条带你需要排除以下原因:一.跑input排除蛋白没有降解。二.确认A抗体说明书可以用来做co-ip。三.co-ip全程需要冰上或者4℃。四.co-ip完成以后，蛋白洗脱步骤是否无误。五.co-ip实验除了需要有实验组，还应该设置对照组，对照组应为同种属的iGg抗体去拉

5 回答303 围观

问THP1细胞用PMA诱导分化成巨噬细胞后，还能继续增殖吗？

是TTT

理论上THP1细胞用PMA诱导分化成巨噬细胞后，增殖只是受到抑制，但是实际上基本不会再增殖。诱导前接种细胞细胞密度以1-2×10⒌为宜

8 回答2591 围观

问链霉亲和素与生物素

是TTT

结合条件有三个:配体的种类，结合的程度，依附的部位生物素修饰的多肽正常连即可

3 回答1483 围观

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