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实验问答

23,119,406 科研人在看

科研学霸天团，48小时有问必答

问质谱成像技术的优点和缺点是否优点大于缺点。对人的依赖程度是否比较大？

loveliufudan

质谱成像技术具有许多优点和一些缺点。以下是其主要的优点和缺点：优点：分子级别的信息：质谱成像技术能够提供样品中分子的直接检测和定量分析，从而揭示复杂生物系统中的分子分布和亚细胞水平的化学信息。多种分析能力：质谱成像技术可以应用于各种类型的样品，包括生物组织、细胞、生物体液等。它可以用于分析药物、代谢产物、蛋白质、脂类等多种化学物质。空间分辨率高：质谱成像技术能够提供高分辨率的空间图像，可以对样品进

3 回答2053 围观

问质谱成像的最低灵敏度怎么确定

sswei

受制于目前市场上质谱技术的灵敏度限制，业界普遍认为有实用价值的成像空间分辨率是 10~30 微米。

4 回答565 围观

问色谱样品提纯需要注意的问题？

sswei

气相色谱仪分析前制备样品时需注意的几个问题：1、首先要考虑将被分析的样品中，可能干扰欲被测组分定量的物质要尽可能的分离出去。还要考虑通过样品制备使被测组分在试验样品中的含量得以提高即样品浓缩，以便最后的气相色谱仪分析。2、再一在制备样品时，要考虑欲分析样品中的被测组分是否流失，是否能100%定量地转入到制备好的，可用于色谱分析的实验用样品中去，这样才可以使分析结果准确无误。 3、另外要考虑实验用样

4 回答523 围观

问如果是动物实验样品采集，是给药之后12h取材好还是给药后2h后取材？

loveliufudan

一般而言，给药后1-2小时取材较常见，但具体取决于研究的目的和所研究的药物特性。以下是两种常见的取样时间选择：给药后1小时取材：这个时间点通常用于研究早期药物吸收、分布和早期生物学反应。在这个时间点，药物已经被吸收进入循环系统，并开始在体内分布和代谢，但可能尚未达到峰值浓度或完全平衡。这个时间点适用于了解药物的早期动力学和早期生物学效应。给药后2小时取材：这个时间点通常用于研究药物在体内的分布和稳

3 回答1031 围观

问K-means分析是如何确定有几类的，如何得到这些数据点的分布

loveliufudan

K-means聚类分析是一种无监督学习方法，用于将数据集划分为K个不同的簇或类别。确定K值（簇的数量）是K-means分析的一个重要问题，常见的方法包括以下几种：经验法则：根据经验法则选择K值。例如，基于领域知识或先前的经验，对研究对象的数量或特征有一定了解，可以初步估计出适合的K值。手肘法（Elbow Method）：通过绘制不同K值下的聚类结果的损失函数（如平方误差和）与K值的关系图，观察图形

3 回答548 围观

问请问：1）液相色谱质谱中，我们是先鉴定化学物然后分析，还是先分析，然后对感兴趣的峰进行代谢物的鉴定？2）如果在正离子模式和负离子

loveliufudan

1）液相色谱质谱（LC-MS）分析的流程可以根据具体的研究目的和样品特性来确定。一般而言，常见的做法是先进行分析，然后对感兴趣的色谱峰进行代谢物的鉴定。在液相色谱分析中，样品经过色谱柱分离后进入质谱仪进行质谱分析，生成质谱图。根据质谱图的特征峰，可以进行初步的化合物鉴定，如根据质荷比（m/z）和相对丰度进行初步的分析和组分识别。随后，对于感兴趣的色谱峰（如代谢物），可以进行更深入的鉴定。这可以通过

3 回答476 围观

问请问非靶数据根据什么降噪（区分同分异构体等相同名称不同出峰时间的物质），如果均一化？是峰面积总和的百分比吗？

loveliufudan

在非靶数据分析中，针对峰的降噪和峰面积均一化的处理通常基于以下方法：降噪：对于非靶数据，常常会有一些噪声或杂质引入，这可能包括仪器噪声、背景信号等。为了降低噪声的影响，常用的方法包括：平滑滤波：使用滤波算法（如移动平均、Savitzky-Golay等）对信号进行平滑处理，去除高频噪声。噪声阈值：设定一个合适的阈值，将峰高低于该阈值的峰认为是噪声，并将其排除或进行后续处理。区分同分异构体：如果存在相

3 回答365 围观

问血清样本量为500+，如何进行质控？是否有通用的非靶向代谢组样品（血清，尿液，组织，细胞）的前处理方式？脂质代谢组与非靶向代谢组

loveliufudan

在大样本量的非靶向代谢组学研究中，进行质控是非常重要的，以确保数据的质量和可靠性。以下是一些常见的质控策略和通用的前处理方式：质控样品（Quality Control Samples）：在样品批次中添加一定数量的质控样品，这些样品是经过特定处理或混合而成的，用于监控实验的稳定性和可重复性。质控样品应覆盖实验样品中的代谢物谱，并在实验过程中与样品一同处理和分析。内部标准物质（Internal Sta

3 回答263 围观

问组织，血清，血浆，尿液，细胞等样本前处理差异和注意事项

loveliufudan

非靶向代谢组学研究中，针对不同样本类型的前处理差异和注意事项如下：1. 组织样本：样品破碎和提取：不同组织可能需要采用不同的破碎和提取方法，如机械破碎、液氮研磨、酸性/碱性溶液等。最佳方法应根据特定组织的特点和研究目的选择。蛋白质去除：组织样本中通常含有较高的蛋白质含量，需要进行蛋白质去除步骤，以减少蛋白质对代谢物分析的干扰。常见的方法包括有机溶剂沉淀、醇沉淀等。溶剂萃取：使用有

3 回答1593 围观

问代谢组数据表格指标解读

loveliufudan

代谢组数据表格中的指标可以包括代谢物的相对丰度、峰面积或峰高等信息。解读这些指标需要结合具体的研究问题和分析目的，以及数据处理和统计方法。下面是一些常见的解读指南：1. 相对丰度：代谢物的相对丰度表示在不同样品中该代谢物的相对含量。相对丰度可以通过归一化处理（如总离子流量归一化）来消除样品间的变异性，并进行统计分析。较高的相对丰度可能表明该代谢物在该组样品中具有显著的变化。2. 峰面积或峰高：代谢

3 回答1657 围观

问联合分析时原始数据需要降维做相关吗？还是直接用原始数据?

loveliufudan

在联合分析中，原始数据可以根据具体情况选择是否进行降维。降维是将高维数据转换为低维表示的过程，旨在减少特征维度、消除冗余信息和提取主要特征。降维可以帮助减少计算复杂度、处理高维数据中的噪声和冗余，并且可能有助于更好地发现数据中的模式和关系。在联合分析中，如果原始数据的维度较高，且存在冗余信息或噪声，降维可以是一种有效的方法。常用的降维技术包括主成分分析（Principal Component An

3 回答157 围观

问代谢组学样品的处理注意事项及质控

loveliufudan

在代谢组学研究中，样品处理的注意事项和质控措施对于数据质量和可靠性至关重要。以下是一些常见的样品处理注意事项和质控措施：1. 样品采集：样品采集要注意避免污染和交叉污染。使用无菌技术和消毒方法，确保样品采集器具和容器的无菌和洁净。采集样品时注意避免氧化、光照和温度变化等可能导致代谢物分解或变化的因素。2. 样品存储：样品在采集后应尽快处理或冷藏储存，以防止代谢物的降解和变化。

3 回答2506 围观

问转录组和代谢组联合分析大概研究思路可以讲解一下吗？

loveliufudan

转录组和代谢组联合分析是一种综合利用转录组学和代谢组学数据的研究方法，旨在揭示基因表达与代谢物谱之间的关联关系，深入理解生物体的代谢调控机制。下面是一般的研究思路：1. 实验设计和样本采集：确定研究问题和目标，设计合适的实验组和对照组。选择适当的生物样品（如组织、细胞、血液等）进行采集，保证样品的质量和一致性。2. 转录组分析：提取RNA并进行转录组测序，获取基因表达谱的信息。

3 回答1039 围观

问请问如何将稳定同位素示踪和代谢组学联合起来？会不会更灵敏简便呢？

loveliufudan

将稳定同位素示踪和代谢组学联合起来可以提供更全面、详细的关于代谢通路和代谢物动态变化的信息。这种联合分析方法可以增强对代谢过程的理解，并提供关于代谢途径调控、代谢物转化和代谢通路的定量信息。下面是一般的方法流程：1. 实验设计：确定研究目标和问题，设计合适的实验组和对照组。确定稳定同位素标记的底物或代谢物，以及代谢组学分析的样品类型和条件。2. 稳定同位素示踪实验：选择适当的稳定

3 回答538 围观

问请问脂质代谢组学t检验做不出统计学差异可以用PCA图代替吗

loveliufudan

3 回答154 围观

问样本一次准备不齐，能先做一批，后面将多次结果整合在一起分析吗？

juyue2010

可以，不过每批次都需要有对照，产物归一化处理

3 回答429 围观

问wb细节问题求解？。？

balalaLy

可以两个一抗一起孵，或者先孵25的那个，再孵actin，最后孵两个二抗的混合液。不过，如果25那个蛋白表达低的话建议先孵这个，显影完之后再孵actin，以免actin条带太亮影响目的蛋白。上样量一般上20ug的蛋白量。

3 回答1066 围观

问从细菌内提取蛋白做wb实验，常用的内参是什么？

loveliufudan

在从细菌中提取蛋白进行Western blot实验时，常用的内参有两种：原核生物中的通用蛋白：在细菌中表达量较为稳定且广泛分布的蛋白，如GroEL、DnaK等，通常作为内参来校正不同实验条件下的蛋白质表达量变化。特定蛋白：如果实验中需要检测的蛋白与某个特定蛋白有相关性，例如同属于同一个代谢通路或同一功能模块，则可以选择该蛋白作为内参来校正不同样品之间的蛋白质表达量变化。

2 回答7040 围观

问细胞外通量和代谢组分析需要相对高的细胞数量，怎么完成从体外到体内的转化和从老鼠到人的验证？

土井挞克树

从体外到体内可以使用综合度高的模型，比如现在很火的综合度高的，体外环境模拟系统，可以较好实现体内到体外的转化。从细胞模型过度到动物模型，一般选择小鼠

2 回答332 围观

问请问大鼠的主动脉平滑肌细胞和主动脉血管平滑肌细胞是一个细胞类型吗？

生物医药资讯

大鼠的主动脉平滑肌细胞和主动脉血管平滑肌细胞属于同一类型的细胞,都是主动脉中的平滑肌细胞。主动脉是人体主要动脉之一,它起源于心脏的心脏左心室,向身体各部位供血。主动脉壁由三层组织构成:内膜、中膜和外膜。中膜主要由平滑肌细胞和弹性纤维组成,其中平滑肌细胞约占75%。这些平滑肌细胞的收缩和舒张可以调节主动脉的血流量和血压。因此,大鼠主动脉平滑肌细胞和大鼠主动脉血管平滑肌细胞都是构成主动脉中膜的平滑肌细

3 回答490 围观

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