• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购

        GO.分析 KEGG分析

        相关实验:基于 SPSS 的卡方检验

        user-title

        别出声

        请问图中 count 和ratio,以及-log P value怎么理解,代表的意义是什么,这幅图要如何理解比较合适。图片描述

        wx-share
        分享

        3 个回答

        user-title

        灵枢天问

        有帮助

        Count指富集在某一通路的基因数目,ratio只是为了区分通路的类似于重要性,log P-pvalue 是计算log10P值结果

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        在GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析中,通常会生成类似上述提供的表格或图谱来总结分析结果。

        在这个图中,"Count"代表在你的基因集合中与特定功能或通路相关的基因数目。比如,在这个例子中,与"apoptotic process"相关的基因数目是10,与"Wnt signaling pathway"相关的基因数目是15。

        "Ratio"代表在你的基因集合中与特定功能或通路相关的基因数目与该功能或通路中的预期基因数目之间的比例。比如,在这个例子中,"apoptotic process"的Ratio是1,说明在你的基因集合中,这个功能的基因数目与预期基因数目相当。

        "-log P-value"代表统计学上的显著性水平。这个值表示与特定功能或通路相关的基因在你的基因集合中的富集程度,以及这种富集程度是否显著。较高的-log P-value表示富集程度更显著。

        理解这个图时,你可以关注具有较高Count和Ratio的功能或通路,这意味着这些功能或通路在你的基因集合中更显著地富集。同时,你还可以注意那些具有较低-log P-value的功能或通路,这表明这些功能或通路在你的基因集合中的富集是具有统计学意义的。

        根据你提供的功能和通路,你可以观察到在你的基因集合中与细胞凋亡、细胞分化、细胞间黏附、炎症反应、MAPK级联、先天免疫反应、血管生成和Wnt信号通路等相关的基因富集。这些结果可以为你的研究提供有关这些生物学过程和通路在你的样本中的重要性和参与程度的线索。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        count是指数量,ratio是指比例

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序