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        预测靶蛋白的互作蛋白有哪些方法呢?除了打质谱

        相关实验:蛋白质相互作用检测

        user-title

        博尔赫斯不写诗

        预测靶蛋白的互作蛋白有哪些方法呢?除了打质谱

         

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        3 个回答

        user-title

        sswei

        有帮助

        Co-IP,GST-Pull down和酵母双杂交是研究蛋白互做最常用的三种方法,一般常用酵母双杂交来筛选,用Co-IP和GST pull down用来验证。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        一、免疫沉淀(IP)

        二、酵母双杂交系统

        三、免疫共沉淀(Co-IP)

        四、GST-Pull Down

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        除了质谱(蛋白质组学)方法之外,预测靶蛋白的互作蛋白还可以使用以下方法:

        1. 基于生物信息学的方法:利用已知的蛋白质相互作用数据库和算法,通过蛋白质序列、结构、功能等信息进行预测。例如,使用蛋白质互作数据库如STRING、BioGRID和Interactome等进行预测分析。

        2. 基于结构的方法:通过蛋白质的三维结构信息,如蛋白质结构预测、蛋白质复合物预测等来推断靶蛋白的互作蛋白。这包括基于蛋白质结构的模拟、蛋白质结构域与域之间的互作等方法。

        3. 基于基因组学的方法:通过基因组学数据,如基因表达数据、基因调控网络、共表达网络等,推断靶蛋白的互作蛋白。这些方法可以通过分析基因组学数据中的共现性、相关性和模式等信息来进行预测。

        4. 基于文献挖掘的方法:通过系统地分析已发表的科学文献中关于蛋白质相互作用的信息,利用文本挖掘和自然语言处理技术来推断靶蛋白的互作蛋白。这包括利用文献关系数据库如PubMed和文献挖掘工具如Textpresso等进行分析。

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