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科研学霸天团,48小时有问必答
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wb怎么根据内参调整上样量
whilt-shirt
先用Image J计算内参的灰度值,然后选择其中一个样本作为参照,用这个参照样本的灰度值除以其他各组样本的灰度值再乘以各组上样量,就得到最终各自的上样量
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问
样品体积增加后,对蛋白质的纯化效率有怎样的影响?
迟C迟
样品体积增加,是提取的样品量增加了吗?建议裂解液同步增加,裂解时间也需要延长,不然会影响蛋白纯化效率。
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问
免疫组化时染色比较弱 拍图不好看 怎么调整?
dxywode
小心处理组织样本,尽量保持组织细胞结构的完整性。如果组织的穿透力差,则要制备较薄的切片。调整好固定液的理想pH、固定时间和温度。可考虑用单抗(不是多抗),避免交叉反应。如果非特异性结合太强,则适当减少抗体的孵育时间。
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问
做WB曝光后目的蛋白位置出现2个相邻条带,但是抗体说明书上没有提过会有2条带情况,原因可能是什么呢?
邓豆豆逗
可以先看一下抗体官网的一些效果图,是否做出来有两条带的现象,其次查一下相关文献,看这个蛋白是否有剪切体或一些修饰之类的,还有可能是蛋白降解了,这时候可以找一个阳性对照一起做,如果阳性对照是单条带,就考虑是样本的原因了
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问
怎样提高WB实验蛋白定量与上样量的效率及准确性?
bamboopiggy
这个,只能说 勤能补拙,多做,经验丰富了就好了。一般情况下,在做标曲的时候,加样要准确,标曲出来的R^2值,接近0.99最好。样品稀释时,枪尖要和枪match,吸液时,枪尖别下的太深。上样时,同样注意枪尖和枪的match程度,以及枪的准确性。
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问
蛋白质的等电点是否与蛋白质的质量有关?
天一湖医者
蛋白质是两性电解质,其等电点和它所含的酸性氨基酸和碱性氨基酸的数量比例有关。各种蛋白质因氨基酸残基组成不同,等电点也不一样。
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问
蛋白纯化常形成包涵体而影响表达蛋白的生物学活性及构象,怎么解决?
桐轩456
首先我们要知道包涵体形成是因为外源性重组蛋白在高表达时,由于蛋白折叠辅助因子不足,在蛋白折叠之前分子间连接的疏水表面暴露在外面,导致折叠中间体大量堆积,并且这些中间体对蛋白酶的降解有抑制作用;对于大量折叠错误蛋白的出现,重组细菌体内缺乏相应的反应机制来恢复蛋白的正确折叠;促进细胞表达的蛋白多肽的溶解和正确折叠功能的丧失;蛋白或多肽自身结构在热力学和动力学上失衡;一些环境因素(如高温、酸性介质)能明
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问
蛋白诱导时间如何确定?IPTG大家都用什么浓度?
会心UY7N
我们一般用 0.5mg/ml IPTG.第一次没有做过的时候我是每隔 2h 超净台吸入 1ml 菌液,离心,加 loading 开水煮沸保存,2.4.8.10.12.16.18 的时间点,然后最后一次的全部离心,菌体保存在-80。然后将前面取得一起用 SDS-PAGE 进行凝胶电泳,考马斯亮蓝染色,自己的蛋白大概多大,根据 marker 看那个大小的地方有没有很粗的带,看哪个时间开始表达的最好,就
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问
怎样提高蛋白质在醋酸中的稳定性?
天一湖医者
1、尽量在相对密封和无菌的环境下快速进行分离操作2、在生理温度和压力范围内完成分离纯化操3、慎用溶剂和酸、碱、盐类,使用前要进行详细的试验,确定最佳添加量和条件;4、钝化或抑制蛋白质分解酶类的活性;5、选择合适分离方法。如:凝胶过滤、离子交换、吸附层析、亲和层析、电泳、结晶等。
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问
内参蛋白有什么区别,如何选择合适的
府宅
1. 胞浆蛋白的内参与胞核蛋白的内参是不一样的;2. 在一定的实验条件下,内参蛋白的表达发生明显的变化时需要选择其他表达不变或者变化很小的蛋白;3. 当研究的蛋白的分子量与内参接近时,需要选择分子量与目的蛋白的分子量差距比较大的蛋白。
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关于WB实验显色问题?
dxy_gwrp7ndq
做ECL的一抗浓度比DAB染色稀释10倍或20倍,适当缩短曝光时间,曝光前将膜上多余的ECL液空掉。
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磷酸化的抗体为什么总是杂不好
bamboopiggy
我牛奶和bsa都用过,这个其实是要看你的抗体好不好用,如果抗体好用,怎么杂怎么出。如果抗体不好用,一般都杂不好。此外,可以考虑在收样的lysis里面加点磷酸酶抑制剂。实在杂的难看,就换家公司买抗体,磷酸化的抗体,一般cst的还是不错的。
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免疫共沉淀实验的注意事项,外源IP为何只能正抓或反抓成功
府宅
1.抗体的性质。抗体不同和抗原结合能力也不同,免染能结合未必能用在IP反应。建议仔细检查抗体的说明书。特别是多抗的特异性是问题。2.溶解抗原的缓冲液的性质。多数的抗原是细胞构成的蛋白,特别是骨架蛋白,缓冲液必须要使其溶解。为此,必须使用含有强界面活性剂的缓冲液,尽管它有可能影响一部分抗原抗体的结合。另一面,如用弱界面活性剂溶解细胞,就不能充分溶解细胞蛋白。即便溶解也产生与其它的蛋白结合的结果,抗原
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请问梯度胶好用吗?可以同时收集到20kDa和150kDa分子量的蛋白吗?
dxy_gwrp7ndq
使用梯度胶,小分子量蛋白运动至在胶浓度更高的底部(正极),同时大分子量蛋白在顶部有更好的分离。如下图:选择最佳的丙烯酰胺凝胶浓度达到高效的蛋白分离
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蛋白印迹实验和流式细胞术都是使用抗体来检测细胞内靶标物质,两者如何选择
whilt-shirt
根据需要吧,但是最好两者都做,这样结果更可靠
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蛋白提取研磨和破碎法选择
dxy_gwrp7ndq
研磨的研钵磨球和玻璃管内壁之间间隙保持在十分之几毫米距离,破碎细胞的程度比组织捣碎机高。超声处理的频率一般选在10KC至200KC,功率200-500瓦范围,处理时间有数分钟至数十分钟不等,处理过程中注意冷却。此法多用于微生物材料。
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DTT特性在蛋白纯化和保存中有什么作用?
bamboopiggy
Cys存在于多种蛋白中,且其中的-SH常作为活性中心发挥作用,或者,两个-SH连接成二硫键,是维持蛋白质高级构象重要桥梁。-SH具有很强的还原性,溶液被溶液中的溶解氧或其它氧化物氧化,从使蛋白失去活性。所以,在蛋白纯化 和保存时,在溶液中加入一定量的DTT,以免蛋白-SH被氧化而失活
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问
蛋白标记实验,无蛋白质的区域具有高背景,怎么分析
府宅
检测试剂中的蛋白质抗体与特异性抗原结合,同时非特异性抗原同时也会非特异的结合在固相上的空白区域,产生高背景
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纯化后的蛋白质怎样保存?
dxy_gwrp7ndq
1. 低温低温下保存蛋白质是极其必要的。低温意味着更低的能量,低温下蛋白质分子热运动较低,其内部的成键不容易断裂。另外,在低温下,微生物不容易生长,可能存在的蛋白酶的活性也会很低,这些更容易保证蛋白质的活性。2. 分装蛋白质有时候是需要冷冻保存的,但我们使用蛋白质时却是在室温或者更高的温度。冻融这一过程会对蛋白质造成不可逆的损伤。因此我们需要尽量减少冻融的次数。纯化后的蛋白质,进行分装保存,每次需
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问
如何避免蛋白质谱实验中的二次污染问题
府宅
在质谱分析中,最常见的蛋白质污染物包括角蛋白和血清白蛋白。其他质谱(MS)蛋白污染物还包括酪蛋白和大肠杆菌蛋白质。在实验中,可以通过以下方法避免将上述蛋白质污染物引入样品:1. 保持实验室清洁、减少灰尘和空气流动;2. 使用一次性过滤吸头;3. 定期清洗电泳、染色、微量离心机等设备,避免通过接触或气溶胶引入污染物颗粒;4. 穿戴洁净的实验服和手套。
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