大鼠circRNA预测靶miRNA用哪个软件呀
dxy_iff1q1c3
高通量测序出了一些大鼠的circRNA，是新的circ，目前只知道序列和来源基因，怎么去预测其中某个circRNA的靶miRNA，找了好多软件，都是输入circRNAID预测，或者直接网址打不开。救救孩子吧
2 个回答
Dr_劉医生
有帮助
没到用软件那步，先得检索miRNA。推荐数据库cirbank（步骤见图），打开首页后点击miRNA，输入circRNA的ID，点击search，即可。
dxy_iff1q1c3
但是我测序出的circRNA没有ID，只有具体的序列，和染色体位置
土井挞克树
有帮助
一般用的是circBase数据库，这个数据库比较全。
dxy_iff1q1c3
但是，我的是大鼠，没有circRNAID，只有序列和位置
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