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科研学霸天团,48小时有问必答
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问
难消化的新鲜组织提取出的RNA建库后QPCR不合格,有什么方法可以改善?
bamboopiggy
1.将你的组织,直接放到trizo里,再进行剪碎。2.用液氮将组织冻住后,研钵内弄碎后,再加入trizol。3.买个组织提取rna的kit,可以试试。
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问
【求助】提组织RNA时,为何OD值总是小于1.8
迟C迟
RNA 260/280<1.8说明有蛋白质、酚的污染。
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问
提取鱼类肠道微生物,用来做16s测序,有哪些好的方法?
bamboopiggy
找一个靠谱的公司比什么都重要,尤其是做过鱼类16s的,否则什么样的bug都会给你弄出来。甚至会测不到。
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问
microRNA的提取方法和RNA提取的方法相同么?
迟C迟
原理是一样的,因为提RNA一般指total RNA。但要注意的是很多抽总RNA的方法,包括一些试剂盒,最短组分都在100nt左右。这些方法不针对miRNA,里面的某些步骤会损失大量的miRNA,如果抽提miRNA是为了定量,那肯定是不行了,建议用试剂盒。
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问
提取RNA,然后做需要什么试剂及试剂盒?
迟C迟
trizol法提取RNA,trizol买invitrogen公司的,逆转录试剂盒我们实验室用的东洋坊的,效果不错。
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问
从胚胎中提取RNA时,应注意哪些原则?
迟C迟
1. Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2. RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低最后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时最好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
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问
SDS凝胶电泳的上样量大家一般用的多少啊?
未来9
一般上样体积为10-15μL(即2-10μg蛋白质)
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问
小白提问,为什么跑western blot条白出来是空白的呢?内参也是白的,苦恼死了
天一湖医者
目的蛋白没转到膜上,或者你根本没分离出来探针有问题
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问
做wb的时候,经常做出来结果漂移,越来越高,是怎么回事?
丁香粉猪猪
当按照阴极-海棉-滤纸-胶-膜-滤纸-海绵依次放好后两块板不能压紧,因而在胶和膜之间可能存在潜在的间隙,电转移时蛋白从胶和膜之间的空隙中流走。使用十几张普通的草纸垫在两块海棉之间,条带就可以变得非常的漂亮。 另外,转膜时转膜液要浸没凝胶和膜,否则也可能出现上述情况。
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问
样品脂肪含量太多,需要增添什么步骤?
dxy_gwrp7ndq
脂肪类较多的会采用正己烷萃取等办法去除。
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问
干燥RNA的时候是要干燥到什么程度最好?需要保持湿润吗?
迟C迟
最后的到RNA的上一步是酒精洗涤,提取的RNA当然不是完全干燥,提取后可以用小号枪头洗出较多的液体,剩下就在空气中自然干燥;但是太干就不容易溶解,因为太干的话RNA之间就结合的非常紧密。
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问
cDNA法推断蛋白质一级结构时,引物有哪些设计要求,需要注意的问题?
府宅
1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq D
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问
玉米种子胚乳和果皮怎么样能更快速的分开,以降低RNA的降解?
迟C迟
是需要提取胚乳的RNA吗?我们一般取未成熟样品,在冰上用镊子挤出胚乳迅速放入液氮,提RNA问题不大。
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问
RFect系列siRNA转染试剂细胞浓度要求是多少?
dxywode
我实验合siRNA使用说明:siRNA工作浓度般10-100nM我准备用50nM做转染相同孔板同量siRNA加转 染试剂量相同所我觉存质粒DNA转染与转染试剂比例同影响转染效率问题siRNA能效干扰目蛋白表达加 量越应该沉默效越.合siRNA比较贵加花费合siRNA体外瞬转染干扰效致能维持2-5左右。
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问
Single-nucleus RNA-seq没有线粒体基因了是吗?
万千490
1.线粒体由于含有自己的DNA等并能进行自我复制和转录、合成蛋白质而成为一套完整的核外遗传系统。 2.线粒体的结构物质,除部分可以自身合成外,同时又要依靠核DNA遗传系统的输入,是一种半独立性的细胞器。 3.真核细胞内所具有的两种遗传体系是处于互相影响、互相依存的复杂矛盾状态之中,核DNA遗传系统看来是居于主导地位
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问
Rna提取提纯实验中,用来溶解RNA的DEPC水 是否要经过高压处理
迟C迟
商业化的DEPC水不需要再处理。注意分装使用,以防污染。
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问
原核表达中,IPTG诱导过程中,有必要摸诱导温度吗,一般最适多少度啊?
dxy_gwrp7ndq
建议室温和37度,做时间曲线(0,1,3,5,过夜),IPTG用0.2mM,电泳检测
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问
核酸电泳跑胶量的问题
dxy_rzhv86ar
我是用5ul的上样与3u的rna 混一个点一个
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问
组织小浓度低时RNA提取纯度问题
迟C迟
肯定影响后续实验的,可以多提几次,富集一下RNA,同时保证纯度,才能保证后续实验质量,不然做了也是白做。
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问
rna的二级结构对全长rna反转录有何影响?怎样排除影响因素?
dxy_gwrp7ndq
AMV在高反应温度时可消除mRNA的二级结构对逆转录的阻碍
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