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实验问答31,534,360 科研人在看

其他

问有玩转铁死亡的高手吗？

loveliufudan

虽然细胞发生铁死亡时铁代谢异常，但SIC7a11的表达下调并不是一定发生的情况。实际上，SIC7a11的表达可能会受到多种因素的调节，包括细胞类型、环境条件、氧化应激等。在某些情况下，细胞发生铁死亡可能导致SIC7a11的下调，因为氧化应激和细胞损伤可能干扰细胞的正常代谢和转运过程。然而，并非所有情况下都会发生这种下调。因此，无法简单地确定在细胞发生铁死亡时SIC7a11的表达是否一定下调。具体情

3 回答931 围观

问胆固醇造膜

loveliufudan

在使用胆固醇造膜并使用MTT检测胆固醇浓度对细胞存活率的影响时，存在一些可能导致你观察到的细胞存活率没有明显差异的原因。以下是一些可能的解释：1. 浓度范围选择：可能你选择的浓度范围过于窄，未涵盖到影响细胞存活率的有效范围。如果你只测试了几个特定的胆固醇浓度，可能错过了细胞存活率受浓度变化的敏感范围。尝试使用更广泛的浓度范围进行实验，以确定是否存在浓度相关的效应。2. 时间因素：胆固醇对细胞的影响

2 回答764 围观

问胆固醇结石小鼠模型取肝哪一叶有要求吗

灵枢天问

一般都是取靠近胆囊的那部分肝组织。

4 回答838 围观

问GO.分析 KEGG分析

loveliufudan

在GO（Gene Ontology）分析和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）分析中，通常会生成类似上述提供的表格或图谱来总结分析结果。在这个图中，"Count"代表在你的基因集合中与特定功能或通路相关的基因数目。比如，在这个例子中，与"apoptotic process"相关的基因数目是10，与"Wnt signaling pathway"相

3 回答6956 围观

问LPS刺激THP-1

土井挞克树

可以直接用lps刺激thp-1，成功后看多肽的抑炎效果

3 回答5497 围观

问病毒在0.22um滤膜过滤后，跑PCR就阴性了，为什么，还有没有毒呢

sswei

病毒在0.22um滤膜过滤后，把病毒等微生物过滤了，跑PCR就阴性了。

4 回答2277 围观

问想请问一下在对秀丽隐杆线虫进行平均荧光强度分析时,阈值是选择默认值还是自己根据图片的实际情况设定一个固定值?非常感谢

土井挞克树

我一般是先用默认值看结果，不理想的话再调整固定值

3 回答1380 围观

问救救救WB求助，好心人帮帮我吧

土井挞克树

1.300kd大分子建议分离胶用6%，浓缩胶4%。2.选择分子量最大的预染MARKER，我用的是250kd，然后在电泳槽周围堆满冰，120ma使劲跑吧，跑两个小时换一次电泳液，一直跑到250kd的MARKER，离开胶释放到电泳液中，大概要用5个小时

3 回答700 围观

问请问怎么在体外模拟运动环境？

dxy_sqe104z1

1. 利用微流控技术：可以通过微流控芯片将细胞置于微型通道中，控制液流并模拟不同的环境，如流速、化学梯度等，以模拟细胞在体内的运动环境。2. 利用微球技术：可以利用特定直径的微球，如聚苯乙烯微球，制作不同大小的孔洞，与细胞表面的黏附分子相互作用，模拟细胞在组织中的二维运动。3. 利用组织工程技术：可以制作三维的组织工程支架，在其中培养细胞，模拟细胞在组织内的运动情况。4. 利用生物印迹技术：可以通

4 回答2740 围观

问含有目的基因的质粒转入大肠杆菌感受态后涂平板，培养12个小时不长，24小时才长，菌落少且小为什么？

憨欢仔

原因可能是：质粒过大？平板不新鲜？平板抗生素浓度高？建议老师：1. 可以挑取菌落，同时划线培养，做个菌落PCR反应，跑胶看是否有目的条带；2. PCR有目的条带的话，提取质粒，进行酶切鉴定，跑胶看目的条带是否和预期一样；3. 上面都没问题后，测序看目的基因序列；4. 没问题后，大提质粒，保存。

9 回答11716 围观

问这俩个扫描电镜结果应该是属于什么形貌结构呢？

是TTT

图1是羟基磷灰石介孔，图2是一个个的羟基磷灰石微球

2 回答515 围观

问对于小样本的代谢组，t检验可以不校正，或者调整阈值吗？

土井挞克树

小样本更需要校准，因为小样本误差较大

3 回答1050 围观

问如果是动物实验样品采集，是给药之后12h取材好还是给药后2h后取材？

loveliufudan

一般而言，给药后1-2小时取材较常见，但具体取决于研究的目的和所研究的药物特性。以下是两种常见的取样时间选择：给药后1小时取材：这个时间点通常用于研究早期药物吸收、分布和早期生物学反应。在这个时间点，药物已经被吸收进入循环系统，并开始在体内分布和代谢，但可能尚未达到峰值浓度或完全平衡。这个时间点适用于了解药物的早期动力学和早期生物学效应。给药后2小时取材：这个时间点通常用于研究药物在体内的分布和稳

3 回答1422 围观

问可以推荐一些不同代谢组学标准数据库吗？

天一湖医者

常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD、LipidBlast、KEGG和Metlin等。

3 回答1117 围观

问K-means分析是如何确定有几类的，如何得到这些数据点的分布

loveliufudan

K-means聚类分析是一种无监督学习方法，用于将数据集划分为K个不同的簇或类别。确定K值（簇的数量）是K-means分析的一个重要问题，常见的方法包括以下几种：经验法则：根据经验法则选择K值。例如，基于领域知识或先前的经验，对研究对象的数量或特征有一定了解，可以初步估计出适合的K值。手肘法（Elbow Method）：通过绘制不同K值下的聚类结果的损失函数（如平方误差和）与K值的关系图，观察图形

3 回答931 围观

问找到差异代谢产物后，如何绘制代谢途径呢？就是如何找某个代谢产物在通路中的上下游呢？

天一湖医者

找到差异代谢物后，还需要挖掘和这些代谢物相关的代谢通路。可以采用MetaboAnalyst网站进行代谢通路分析（Metabolic pathway analysis），代谢通路分析分为富集分析（Enrichment analysis）和通路分析（pathway analysis）。通路分析中添加了通路拓扑分析（topology analysis），会输出通路在整体网络中的重要性（impact）。

3 回答1795 围观

问请问：1）液相色谱质谱中，我们是先鉴定化学物然后分析，还是先分析，然后对感兴趣的峰进行代谢物的鉴定？2）如果在正离子模式和负离子

loveliufudan

1）液相色谱质谱（LC-MS）分析的流程可以根据具体的研究目的和样品特性来确定。一般而言，常见的做法是先进行分析，然后对感兴趣的色谱峰进行代谢物的鉴定。在液相色谱分析中，样品经过色谱柱分离后进入质谱仪进行质谱分析，生成质谱图。根据质谱图的特征峰，可以进行初步的化合物鉴定，如根据质荷比（m/z）和相对丰度进行初步的分析和组分识别。随后，对于感兴趣的色谱峰（如代谢物），可以进行更深入的鉴定。这可以通过

3 回答837 围观

问请问非靶数据根据什么降噪（区分同分异构体等相同名称不同出峰时间的物质），如果均一化？是峰面积总和的百分比吗？

loveliufudan

在非靶数据分析中，针对峰的降噪和峰面积均一化的处理通常基于以下方法：降噪：对于非靶数据，常常会有一些噪声或杂质引入，这可能包括仪器噪声、背景信号等。为了降低噪声的影响，常用的方法包括：平滑滤波：使用滤波算法（如移动平均、Savitzky-Golay等）对信号进行平滑处理，去除高频噪声。噪声阈值：设定一个合适的阈值，将峰高低于该阈值的峰认为是噪声，并将其排除或进行后续处理。区分同分异构体：如果存在相

3 回答573 围观

问血清样本量为500+，如何进行质控？是否有通用的非靶向代谢组样品（血清，尿液，组织，细胞）的前处理方式？脂质代谢组与非靶向代谢组

loveliufudan

在大样本量的非靶向代谢组学研究中，进行质控是非常重要的，以确保数据的质量和可靠性。以下是一些常见的质控策略和通用的前处理方式：质控样品（Quality Control Samples）：在样品批次中添加一定数量的质控样品，这些样品是经过特定处理或混合而成的，用于监控实验的稳定性和可重复性。质控样品应覆盖实验样品中的代谢物谱，并在实验过程中与样品一同处理和分析。内部标准物质（Internal Sta

3 回答459 围观

问非靶向代谢组学和靶向代谢组学在应用上有何区别，选择依据是什么？数据处理可选择哪些软件？

天一湖医者

非靶向代谢组学可以全面、系统地分析源自生物体的所有代谢产物，是一种可以发现新生物标志物的无偏代谢组学分析。靶向代谢组学是对特定代谢产物的研究和分析。两者都有各自的优点和缺点，并且经常结合使用以发现和准确测定差异代谢物的含量，对后续代谢分子标记物的深入研究和分析。非靶向代谢组学和靶向代谢组学参与食品鉴定、疾病研究、动物模型验证、生物标志物发现、疾病诊断、药物开发、药物筛选、药物评估、临床研究、植物代

3 回答1211 围观

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