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        Haploview文件格式

        user-title

        dxy_iitpuzy7

        用Haploview的linkage formate 输入ped格式文件,它提示如下错误,但是第5列和第6列的性别和患病我不知道,不可以用0表示吗?一直提示第一行,没有收集到数据的个体不能用0表示图片描述图片描述吗?

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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        Haploview对于PED格式文件有一定的限制和要求。根据你提供的错误信息,出现了无效的性别或患病状态的错误。

        在PED文件中,第5列表示性别,一般使用数字来表示,其中1表示男性,2表示女性,0表示未知性别。类似地,第6列表示患病状态,通常使用数字表示,其中1表示患病,2表示不患病,0表示未知患病状态。

        根据你的描述,你不知道个体的性别和患病状态,因此你可以将这些未知的值用0表示。然而,根据Haploview的要求,第一行的个体必须有有效的数据,不能全部为未知状态(即不能全部为0)。这可能是导致错误的原因。

        确保第一行的个体具有已知的性别和患病状态,可以选择将其设置为已知的值,而将其他未知个体的值设置为0。例如,可以将第一行的个体设置为1(男性)和2(患病),然后将其他未知的个体设置为0。

        请确保你的PED文件符合Haploview的要求,并且在文件中没有无效的性别或患病状态。如果问题仍然存在,可以检查一下其他行是否也存在类似的错误。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以用0表示,但是需要对0进行赋值,0=null

        user-title

        dxy_iitpuzy7user-title

        可以用0表示,但是不能空着是吗?我把缺失值全部空格后,文件格式就显示错误了

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