酶切、回收、连接 常识
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三.填空题
1 .限制酶是一类专门切割 DNA 的酶,它能特异性识别切割 双 链(单、双)DNA 。
2 .II 型限制酶识别位点一般长度为 4~6 个核苷酸对。
3 .个体之间DNA 限制酶片段长度存在差异称 限制性片段长度多态性( RFLP )。
4 .限制酶命名采用Smith 和A thens 提议的方案,第一个字母大写取自来源细菌的 属名 ;第二、三个字母取自来源细菌的 种名 ;第四个字母(如果有)取自来源菌的 株系 。
5 .需要部分酶切时可采取的方法有(1 )减少酶的用量 (2 )缩短反应时间 (3 )增大反应体积 。
6 .限制酶识别序列为n 个碱基,则其切割频率的理论值应是 4n 。
7 .限制性内切酶通常保存在 50% 浓度的甘油溶液中。
8 .甘油浓度是导致一些酶的星活性的原因之一,在酶切时反应体系中的甘油浓度应控制在 5% 以下。
9 .限制与修饰是宿主的一种保护体系,它是通过对外源DNA 的 限制 和对自身DNA 的 修饰 来实现的。
10 .II 型限制酶既具有 识别位点 的专一性,也具有 切割位点 的专一性。它作用时需要 Mg2+ 离子作辅助因子。
四.简答题
1 .在酶切缓冲液中加入牛血清白蛋白(BSA )的目的与机理是什么?
答:目的是保护酶的活性;机理是通过提高反应体系中蛋白质的浓度,防止内切酶失活。
2 .如果用EcoR I 酶切DNA 时出现星活性,试分析原因?
答:主要原因有:酶浓度太高;高PH ;低盐;含Mn2+ 、Cu2+ 等非Mg2+ 金属离子;甘油浓度高于5% ;存在某些有机溶剂。
3 .下列序列中哪些可能是II 类限制酶的识别序列?
ATATCG CCCGGG GATATC AGCCGA GAGTC
答:CCCGGG GATATC GAGTC
4 .用Klenow 酶可将5 ‘粘末端填补成平末端,而导致某些限制位点消失,下列酶切后用klenow 处理再连接不会丢失识别位点的是哪些?
XmaI C ↓CCGGG BssH II G ↓CGCGC PstI CTGCA ↓G
HhaI GCG ↓C HpaII G ↓CGC
答:BssH II, HpaII
5 .当两种限制酶反应条件不同时,若要用双酶切,应采取什么措施?为什么?
答:要避免星活性及部分酶切。(1 )先用低盐缓冲液中活性最高的酶切,再补盐和第二种酶;(2 )用一种酶消化后,以酚:氯仿:异戊醇抽提,再经乙醇沉淀,将DNA 重新溶解与适合第二种酶的缓冲液,加第二种酶消化;(3 )先低温酶,后高温酶;(4 )使用通用缓冲液。
6 .试计算下列三种限制酶各自在某染色体DNA 序列上的切割概率
Sau3A I GATC Pst I CTGCAG Hinf I GANTC
Acy I GPuCGPyC
答: 1/44 ;1/46 ;1/44 ;(1/44 )x(1/22 )
7 .一长为4.2kb 的DNA 片段,分别用EcoRI 、PstI 及EcoRI+PstI 消化,电泳结果如下图所示,请根据结果绘出该片段限制性图谱
<rect> <rect> <rect> <font><font> </font> </font> </rect></rect></rect>
0.7kb
0.7kb 0.8kb
1.5kb 1.4kb 2.0kb
2.0kb 2.8kb
EcoRI Pst I EcoRI + Pst I
答: EcoRI PstI EcoRI
0.7kb 0.7kb 0.8kb 2.0kb