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NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3

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  • Nanodigmbio
  • #1002611(24 rxn); #1002612(96 rxn)
  • 中国南京
  • 2026年01月09日
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      1

    • 英文名

      NadPrep® EZ DNA Library Preparation v3

    • 供应商

      纳昂达(南京)

    • 保存条件

      -20℃

    NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 是基于 A-T 连接原理,针对主流测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒兼容多类型样本,尤其对极低质量 FFPE 样本的建库流程进行了优化,以确保文库稳定产出。该试剂盒操作流程简单,在单个步骤内即可完成对样本的片段化、末端修复和加 A,适用于投入 5-500 ng DNA 的全基因组测序,同时兼容液相杂交靶向捕获测序。

    产品特色

    • 多类型样本兼容性强,轻松应对 gDNA 与不同等级的 FFPE DNA (B+/B/C/D)
    • 片段化、末端修复和加 A 一步完成,简化流程,操作更便捷,提升实验效率
    • DNA 片段化长度灵活精准可控,有效提高酶切片段化回收率与文库丰富度
    • 极低质量样本下依然保持低背景噪音,减少假阳性干扰,增强变异检测的可靠度
    • 反应体系灵活,自动化适配性强,无缝集成至 NGS 自动化工作站,释放人力资源

    建库流程

    产品细节图片1

    产品表现

    文库产出稳定高效

    产品细节图片2

    图 1. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同起始投入量 gDNA 样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3 (NadPrep Enfrag v3) 和 v2 (NadPrep Enfrag v2) 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 B. NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库,酶切 20 min,扩增循环数参考相应说明书。
    注:样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。

    多类型样本灵活兼容

    产品细节图片3

    图 2. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同类型样本的建库产出。
    注:gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471);样本分级标准 | gDNA:~ 15 Kb 有明亮单一不拖尾条带;FFPE B:~ 15 Kb 有隐约可见主带,同时存在中度弥散;FFPE C:条带主要分布在 200-2500 bp,呈弥散状;FFPE D:条带主要分布在 250-1000 bp,呈弥散状。

    保持低水平背景噪音

    产品细节图片4

    图 3. 不同类型样本经不同酶切文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 的占比。不同类型样本分别使用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3、v2 和 Vendor A* 进行预文库构建,500 ng/预文库投入杂交,以 NanOnco Plus Panel v3.0 和 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成捕获,按照 total reads 计算。
    注:Artifact rate: 酶切副产物引入的异常序列占比。gDNA 和不同等级的 FFPE 样本的起始投入量分别为 50 ng 和 100 ng。

    文库丰富度显著提升

    产品细节图片5

    图 4. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 较 v2 显著提升文库丰富度。分别使用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3、v2、Vendor A* 和 Vendor B* 构建预文库,500 ng/预文库投入杂交,以 μCaler® Full Screen LF Custom Panel (针对 GW-OGTM800 标准品所包含的 15 个突变设计的定制探针) 和 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 完成捕获。每个样本随机选取 2 M reads pair 去重后用于数据分析,以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences, DCS211) 、单链一致性序列 (SSCS) 为标准进行过滤。
    注:样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (GeneWell,GW-OGTM800),起始投入量为 50 ng。

    野生型 SNV gDNA 样本突变评估

    产品细节图片6

    图 5. 对肿瘤野生型 SNV gDNA 样本经不同酶切文库构建试剂盒构建文库的捕获数据中的突变统计。以 NanOnco Plus Panel v3.0 和 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成捕获。每个样本随机选取 10 M reads pair 去重后用于数据分析,对背景噪音频率为 0-0.005 的每个位点的突变进行统计 (过滤标准为reads ≥ 3)。
    注:样本为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (GeneWell,GW-OGTM005),起始投入量为 50 ng。

    产品细节图片7

    图 6. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 构建文库的捕获表现。每个样本随机选取 2 M reads pair 用于数据分析,按照 total reads 计算。A. 比对率 & 中靶率;B. 靶区域覆盖度;C. Fold 80;D. 嵌合体比例 (嵌合体 reads 数/reads 总数)。

    订购信息

    类别 产品 详情 货号
    建库模块 NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 24 rxn 24 rxn 1002611
    NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 96 rxn 96 rxn 1002612
    截短型单端接头模块 NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn 24 rxn 1003611
    NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn 96 rxn 1003621
    NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn 96 rxn 1003622
    NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn 96 rxn 1003641
    截短型双端唯一接头模块 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003711
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24  1003721
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48  1003722
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72  1003725
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    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn Index 1-96 1003261
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