相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
1
- 英文名:
NadPrep® EZ DNA Library Preparation v3
- 供应商:
纳昂达(南京)
- 保存条件:
-20℃
NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 是基于 A-T 连接原理,针对主流测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒兼容多类型样本,尤其对极低质量 FFPE 样本的建库流程进行了优化,以确保文库稳定产出。该试剂盒操作流程简单,在单个步骤内即可完成对样本的片段化、末端修复和加 A,适用于投入 5-500 ng DNA 的全基因组测序,同时兼容液相杂交靶向捕获测序。
产品特色
- 多类型样本兼容性强,轻松应对 gDNA 与不同等级的 FFPE DNA (B+/B/C/D)
- 片段化、末端修复和加 A 一步完成,简化流程,操作更便捷,提升实验效率
- DNA 片段化长度灵活精准可控,有效提高酶切片段化回收率与文库丰富度
- 极低质量样本下依然保持低背景噪音,减少假阳性干扰,增强变异检测的可靠度
- 反应体系灵活,自动化适配性强,无缝集成至 NGS 自动化工作站,释放人力资源
建库流程

产品表现
文库产出稳定高效

图 1. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同起始投入量 gDNA 样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3 (NadPrep Enfrag v3) 和 v2 (NadPrep Enfrag v2) 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 B. NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库,酶切 20 min,扩增循环数参考相应说明书。
注:样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。
多类型样本灵活兼容

图 2. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同类型样本的建库产出。
注:gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471);样本分级标准 | gDNA:~ 15 Kb 有明亮单一不拖尾条带;FFPE B:~ 15 Kb 有隐约可见主带,同时存在中度弥散;FFPE C:条带主要分布在 200-2500 bp,呈弥散状;FFPE D:条带主要分布在 250-1000 bp,呈弥散状。
保持低水平背景噪音

图 3. 不同类型样本经不同酶切文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 的占比。不同类型样本分别使用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3、v2 和 Vendor A* 进行预文库构建,500 ng/预文库投入杂交,以 NanOnco Plus Panel v3.0 和 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成捕获,按照 total reads 计算。
注:Artifact rate: 酶切副产物引入的异常序列占比。gDNA 和不同等级的 FFPE 样本的起始投入量分别为 50 ng 和 100 ng。
文库丰富度显著提升

图 4. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 较 v2 显著提升文库丰富度。分别使用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3、v2、Vendor A* 和 Vendor B* 构建预文库,500 ng/预文库投入杂交,以 μCaler® Full Screen LF Custom Panel (针对 GW-OGTM800 标准品所包含的 15 个突变设计的定制探针) 和 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 完成捕获。每个样本随机选取 2 M reads pair 去重后用于数据分析,以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences, DCS211) 、单链一致性序列 (SSCS) 为标准进行过滤。
注:样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (GeneWell,GW-OGTM800),起始投入量为 50 ng。
野生型 SNV gDNA 样本突变评估

图 5. 对肿瘤野生型 SNV gDNA 样本经不同酶切文库构建试剂盒构建文库的捕获数据中的突变统计。以 NanOnco Plus Panel v3.0 和 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成捕获。每个样本随机选取 10 M reads pair 去重后用于数据分析,对背景噪音频率为 0-0.005 的每个位点的突变进行统计 (过滤标准为reads ≥ 3)。
注:样本为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (GeneWell,GW-OGTM005),起始投入量为 50 ng。

图 6. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 构建文库的捕获表现。每个样本随机选取 2 M reads pair 用于数据分析,按照 total reads 计算。A. 比对率 & 中靶率;B. 靶区域覆盖度;C. Fold 80;D. 嵌合体比例 (嵌合体 reads 数/reads 总数)。
订购信息
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
| 建库模块 | NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 24 rxn | 24 rxn | 1002611 |
| NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 96 rxn | 96 rxn | 1002612 | |
| 截短型单端接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | 24 rxn | 1003611 |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003621 | |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003622 | |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003641 | |
| 截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | MDI 1-12 | 1003711 |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-24 | 1003721 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | MDI 25-48 | 1003722 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn | MDI 49-72 | 1003725 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn | MDI 73-96 | 1003726 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-96 | 1003751 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn | MDI 97-192 | 1003752 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn | MDI 193-288 | 1003753 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn | MDI 289-384 | 1003754 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn | MDI 1-96 | 1003761 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn | MDI 97-192 | 1003762 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn | MDI 193-288 | 1003763 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn | MDI 289-384 | 1003764 | |
| 通用截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn | Index 1-12 | 1003240 |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn | Index 1-24 | 1003241 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn | Index 25-48 | 1003242 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn | Index 1-96 | 1003251 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn | Index 97-192 | 1003252 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn | Index 193-288 | 1003253 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn | Index 289-384 | 1003254 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E5, 96 rxn | Index 385-480 | 1003255 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E6, 96 rxn | Index 481-576 | 1003256 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E7, 96 rxn | Index 577-672 | 1003257 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E8, 96 rxn | Index 673-768 | 1003258 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn | Index 1-96 | 1003261 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn | Index 97-192 | 1003262 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn | Index 193-288 | 1003263 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn | Index 289-384 | 1003264 | |
| 全长型双端唯一接头模块 | NadPrep® UDI Adapter Kit Set A (for Illumina®), 96 rxn | Index 1-12 300 pmol / 接头 |
1003211 |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set B (for Illumina®), 96 rxn | Index 13-24 300 pmol / 接头 |
1003212 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set A&B (for Illumina®), 192 rxn | Index 1-24 300 pmol / 接头 |
1003213 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set C1 (for Illumina®), 24 rxn | Index 1-12 24 rxn |
1003221 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set D1 (for Illumina®), 480 rxn | Index 1-96 480 rxn |
1003224 |
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验【交流】关于NEB的T4 DNA连接酶和快速连接试剂盒的常见问题及解答
连接酶,反应10分钟。平滑末端连接:在20µl反应体系中加入1µl T4 DNA 连接酶反应2小时,或者加入1µl高浓度T4 DNA 连接酶反应10分钟。 另外,NEB的快速连接试剂盒 (Quick Ligation Kit, NEB #M2200V [15个反应])是独有的可以在室温5分钟条件下连接平滑末端和粘性末端的试剂盒。 图1:在25°C条件下,用1 unit(1:400稀释后取1 µl)T4 DNA连接酶连接λDNA/Hind Ⅲ片段(4-碱基粘端)不同反应时间的结果。 图
DNA片段有以下优点:高纯度:回收的DNA片段基本上不含RNA、蛋白质及其它有机分子,可直接用于酶切、连接、探针制备、序列测定等;简便:所需主要仪器是一架台式离心机;快速:整个回收过程只需半个小时;高效:回收得率达到70%以上;多用途:可以同时作胶回收、PCR产物回收、DNA片段及探针的纯化浓缩等;安全:不接触苯酚、氯仿等有害物质。二、试剂盒组成1.碘化钠溶液: 50ml2.DNA洗涤液(20倍浓缩液):10ml3.“基因纯”试剂: 1ml4.超纯水: 1ml使用前,将DNA洗涤浓缩液(10
液ASL重悬后,70℃处理5分钟裂解细菌;离心去除不溶解的杂质,蛋白酶K消化进一步去除蛋白和杂质;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。 产品特点: 1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。 2.不需要使用有毒的苯酚等试剂










