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【求助】有个关于启动子的概念,有没人能分辨清?

黑洞里的鱼 请教一下,启动子区(-5kb~0kb)指的是mRNA的5'端上游5kb内,还是对应的DNA的sence strand的5'端(即编码mRNA的DNA链对应的那条链)?如果是miRNA,假设pre-miRNA上游即(-5kb~0kb)区域是他的启动子区,那这个区域是pre-miRNA的5'端的(-5kb~0kb)吗?还是转录pre-miRNA对应的DNA的5'端?在miRbase查到hsa-mir-140的pre-miRNA ...

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【求助】关于慢病毒载体shRNA构建小鼠基因沉默模型的问题

angel880627 最近因课题需要,要构建基因沉默的小鼠模型来进行试验,有木有大侠知道得到慢病毒载体后该如何构建小鼠模型?文献里写的都很模糊,实验室里有没有师兄师姐做过,还望有经验的大虾能给点指导,越具体约好啊~~~majilee 你说得也很模糊1.是要小鼠体细胞都沉默的话 需要从es细胞开始2.另外一种是中国人很常见很经常做的 慢病毒包装好后注射老鼠angel880627 从ES细胞做起是要怎么做?我看到有的文献在构建的时 ...

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【求助】DEPC水还能用吗

能nca 实验室的DEPC水,处理了一年多了,是以前师姐装在EP管得,实验一直就用这个做实验,这个水这么久了还能用吗还有70%的乙醇也是用这水配制的,也放了一年多了还能用吗?devil19840 只要保存得当,容器干净、没有别的东西污染,应该就没问题volano 俺待过的实验室,DEPC处理过的水,4度只保留一周。 勤配,少量配,尽量用新鲜的,不然到时候RNA作不出来,找原因还得排除一条DEPC水有没有过期呀?何必呢,平时多勤快点, ...

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【求助】求教 10 mmol/L K+HEPES 怎么配呀

habaside543120 钾后面的加号是一个上标,,,和HEPES写在一起,,不知道这个东西怎么配也??有人可以指点一下吗??habaside543120 studypeople hepes做PH缓冲剂,浓度是10mmol,最后调PH的时候,用KOH调,应该就行了本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】哪位高手能够告诉我用荧光染色剂fluo-3/AM测量细胞内钙离子浓度应注意什么

g_qhzhang 哪位大侠能够告诉我用荧光染色剂fluo-3/AM测量细胞内钙离子浓度应注意什么?谢过了先g_qhzhang 之前看到园子里有战友讨论荧光染色剂fura-2觉得非常好,对这方面了解很少,被热心战友推荐用fluo-3/AM,不知两个有何区别,只知是2代和3代,希望得到各位大侠指点。婷子 fura2 做流式细胞仪检测fluo3AM 做激光共聚焦好点,但网上看到也有用于流式细胞仪检测的。我之后也要做这个,只是还没找到fl ...

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【求助】如何研究转录因子与信号通路间联系机制

小猪爬墙 如果我要寻找转录因子的下游因子怎么做,比如我发现基因A表达下调了可以导致TGF通路表达下调,想研究其中的机制,具体我该怎么做呢,导师天天催,我都急死了,盼您赐教啊。小猪爬墙 http://www.bioon.com.cn/doc/showarticle.asp?newsid=26539小猪爬墙 http://www.doc88.com/p-47430825856.html本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯 ...

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【求助】如何体外注射mimics来验证miRNA的功能

郑哲 我要做miRNA的干扰实验,体外注射mimics,然后看它对靶基因的影响,想知道实验要具体怎么设计呢,要怎么做对照,而且不明白什么是阴性对照,希望大家帮助predator 不知道你的mimics的注射对象是什么,是细胞,还是动物?公司合成mimics时会有阴性对照,可以咨询公司。tntztyx 关注中~~~本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:s ...

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【求助】急:外源蛋白与宿主细胞膜发生黏附,求检测方法

紫贝壳li 课题研究外源分泌蛋白与宿主细胞的相互作用,现有一分泌蛋白能粘附于Hela细胞膜,引起后续一系列反应,但作用位点未知,且该蛋白作用于细胞膜,但未被吞噬进胞内,求怎样检测该蛋白粘附于膜的量大鹏鸟 定性可以用免疫荧光,定量也可以大概的用免疫荧光看看。smartchow 定性用免疫荧光做,具体方法:1、做Hela细胞的细胞爬片2、用5%BSA的PBS溶液去封闭,3、用你的外源分泌蛋白与之结合(外源分泌蛋白溶于PBS中,具 ...

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【求助】天跟胶回收试剂盒老是回收不成功

江janice 求助:用的是天根 的胶回收试剂盒,11管PCR产物,差不多500微升的总体积,上四个孔电泳,电泳后用天根的盒子回收到四个EP管,每管40微升,取5微升电泳,居然没有成功,又取10微升电泳还是没有任何条带,不知道可否有人用天根的盒子,是否遇到这方面的问题,一般100微升的PCR产物,回收到多少体积比较恰当,纠结啊,回收了好几次电泳都没有目的条带,盒子是刚买的新盒子,谢谢好心人帮助大鹏鸟 天根的盒子还是很好用的,注 ...

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【求助】关于连续观察细胞内钙离子的方法

wori1123 我的研究课题需要动态观察细胞内钙离子浓度,大概每隔10秒观察一次,想跟大虾们请教下怎么样能解决连续观察时温度的恒定问题,因为试了好多次都不行,谢谢DarrenWONG 您要观察多久?几分钟?几小时?用Fluo-4的Flexstation 或 Flipr (Molecular Devices公司)可以实时检测细胞钙流(比如加药后),可以控制温度、湿度,但是读出来的荧光信号,没有图像,而且细胞检测后就废了。显微镜观察的话,用 ...

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【求助】通路实验如何设计啊

小猪爬墙 各位大虾好,想请教大家下信号通路的实验怎么设计,我的实验是已发现基因A可调节癌基因B的表达,基因A下调可以使癌基因B表达降低,同时某miRNA可以下调A基因表达,能否设计实验通过人为上调某miRNA下调A基因表达,进而使得癌基因B表达降低呢?请教是否可行?我看通路设计中一般都需要敲除中间的某个基因以验证其作用,我的实验设计中上调miRNA后检测基因A然后检测基因B表达,实验中是否需要敲除基因A然后再检 ...

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【求助】transwell小室细胞种植

尘朵朵 请问用过transwell小室的战友们,你们用它种细胞时的密度+时间是多少啊(加药之前)。我每次也没计数,就是一个25cmXcm的培养瓶,长满之后消化,每个小室种250ul细胞,一共12个小室,长至第二天约16小时。不知道是否太满了?请各位提出宝贵意见哈!先谢谢了!ciliary 你好,我每次都是计数的,养的是HUVEC,每孔细胞数为5×10^4,每孔是100ul,一般测迁移,6-8小时就可以了,我最长做过24小时,觉得 ...

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【求助】lipofectamine 2000转染

tu_guiyun98121 各位大侠好。本人准备做转染细胞,用的试剂是invitrogen的lipofectamine 2000。因为是初次做,有几个问题想请教一下各位高手。谢谢!1。质粒DNA抽提完后(用除内毒素试剂盒),是否需要除菌。如果需要,一般用什么方法?2.如果是做瞬时转染,是不是可以不用线性化质粒,而是提完质粒就可以直接用于转染。如果是稳定转染,就要先酶切质粒,使其线性化,然后再转染。3.invitrogen的l ...

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【求助】NF-kB luciferase

superskyfly 我自己都觉得我自己很牛,千百人都做出来的试验,我就是做不出来。质粒用的是Promega p4.32-NF-kB-Luc, 转染用的是Invitrogen的Lipofactamin, 激活用的是Sigma生产的PMA和PHA-P,Assay用的是Promega dual,结果加了PMA和PHA的和不加的读数几乎没有区别。加了compound的和不加的也没有区别。用过PC3, Jurkat, A549,HCT116都是一样 ...

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【求助】P53的翻译后修饰都有哪些? 怎样验证其修饰后与靶标启动子的结合活性的变化?

xiaozhangwei2 P53的翻译后修饰都有哪些?听说有磷酸化和乙酰化。还有其他的吗?怎样找出P53是发生了哪种修饰变化?如何设计实验验证P53修饰后,与靶标启动子结合时,有没有产生结合活性的变化啊?谢谢!大鹏鸟 p53的修饰正常细胞在非应激状态下p53的水平和活性都较低,受到应激作用时,p53通过一系列的翻译后修饰被活化,并能结合特异的DNA序列。翻译后修饰是调节蛋白质功能的一个主要机制,p53在多个位点上可 ...

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【求助】怎样设计实验验证:P53经翻译后修饰,不再与靶基因结合

xiaozhangwei2 做的病毒。被指定了一个新方向,假设X病毒可以诱导P53的翻译后修饰,使其不再与靶基因结合。应该设计哪些实验来验证呀? (病毒诱导的P53翻译后修饰种类可能为磷酸化或者乙酰化,不确定。)完全没有信号传导方面的经验,还请多多指教。希望可以简短的把所需要做的实验罗列一下,怕自己是新手,考虑不周全。谢谢!大鹏鸟 1、X病毒诱导后,用磷酸化或者乙酰化抗体检测P53的变化。2、X病毒诱导后检测P53-Lucif ...

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【求助】提质粒后,跑电泳,用10乘Loading Buffer 还是6乘Loading Buffer?

ilovelc999 请问各位,提质粒后,用20微升TE溶解,然后进行电泳,应该用10乘Loading Buffer 还是用6乘Loading Buffer?另外Buffer与质粒溶液一般应以什么比例混合好呢?多谢各位啦!纯属菜鸟 10乘 5:1的比例 质粒5肥宝 我是用6X的,1:5,质粒5,不过也没那么严格,一般也就点个小点估计1ullihuijin017 都可以,按比例就好!没那么严格ilovelc999 恩恩,多谢各位了!本文由丁香园论坛提供,想 ...

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【求助】着急,不知道10mmol/L的Tris-HCl(pH8.0)如何配制?

ilovelc999 很着急,不知道10mmol/L的Tris-HCl(pH8.0)如何配制?有哪位知道吗?麻烦告诉我一下好吗。mybbff 先配成10mM的,水先不要加足,调节pH到8.0后再定容到预定体积。ilovelc999 恩,知道啦,多谢版主!wangbingying66 1.称取1.211g Tris2.加800ml去离子水,充分搅拌溶解3.加420μl HCL4.加去离子水定容至1L5.高温高压灭菌注意:应使溶液冷却至室温后再调P ...

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【讨论】大家看看这样子转染是不是成功了的呢?

qiangshou2010 我最近转染Frhk-4细胞株,用QIAGEN和lipofectamine 2000/RNAiMAX都不能将siRNA转进去。前几天用了Engreen的一个试用装,感觉是转进去了,但是老师说不一定。siRNA荧光和细胞不像是在同一平面?下面是图,大家帮忙看一下,谢谢。qiangshou2010 我观察前用pbs将细胞洗了两次,这个过程能不能将细胞膜上的siRNA洗掉呢?芦宏 我建议你看一下转染效果,做 ...

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【求助】求助PI3K/Art信号通路图

zhoujianheng 哪位大侠有较完整清晰的PI3K/Art信号通路图,谢谢chengbin1217 爱玩的小瓶子 共同学习吧 加油guojunling1201 你好!你找到了吗、能不能发给我一份?大水牛11678 guojunling1201 wrote:你好!你找到了吗、能不能发给我一份?冷枫之孤独王者 cell signaling technology上有本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可 ...

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