简介
质粒(Plasmid)是一种存在于细菌、酵母等微生物细胞中的小型环状双链 DNA 分子,能够独立于宿主染色体进行自我复制,通常携带对宿主生存非必需但具有特定功能的基因。在研究基因功能时,无论是过表达,还是基因敲除,我们都需要通过 PCR 构建载体,然后转导到大肠杆菌;摇菌扩增后,从细菌中提取质粒,从而用于后续分子或细胞实验。
原理
QIAprep Miniprep 系列为常规分子生物学实验提供了一种快速、简单且经济高效的质粒 DNA miniprep 方法。QIAprep Minipre 系列采用硅胶膜技术,在适当的低盐和 pH 条件下将质粒 DNA 与硅胶膜结合,后续 RNA、蛋白质、染料和低分子量杂质经低盐漂洗缓冲液冲洗而去除,用少量 Tris 缓冲液或无核酸酶水即可洗脱获得高质量的质粒 DNA,纯化的质粒 DNA 可立即使用,不需要苯酚提取和乙醇沉淀。
材料与仪器
QIAprep Spin Miniprep Kit(QIAGEN);
微量离心机、水浴锅或加热模块、冰箱;
5m 、2 ml EP 管、无菌移液枪枪头;
一次性手套、96-100% 乙醇。
步骤
实验开始前准备工作:
1) 将 RNaseA 加入到 Buffer P1 中,混合均匀并储存在 2~8℃ ;
2) 可选:将 LyseBlue 试剂以 1 :1000 的比例添加到 Buffer P1 中;
3) 将 96-100% 乙醇加入到 PE 缓冲液中(按照说明书比例添加);
4) 所有离心步骤均微量离心机中以 13,000 rpm(~17,900 x g)的速度进行。
质粒提取:
1) 收集 1-5 ml 的细菌过夜培养物,以 >8000 rpm(6800 x g)离心 3 分钟得到细菌沉淀;
2) 将沉淀的细菌细胞重悬于 250 μl 缓冲液 P1 中,并转移到微量离心管中;
3) 加入 250 μl P2 缓冲液,通过 4-6 次轻柔颠倒混匀,直到溶液变清;
4) 加入 350 μl 缓冲液 N3,通过 4-6 次轻柔颠倒混匀。如果使用 LyseBlue 试剂,溶液将变成无色;
5) 在微量离心机中以 13,000 rpm(~17,900 x g)离心 10 分钟;
6) 通过移液枪将上清液转移到硅胶膜纯化柱中,离心 30-60 秒并丢弃流出液;
7) 加入 0.5 ml PB 缓冲液,离心 30-60 秒并丢弃流出液;
8) 加入 0.75 ml PE 缓冲液,离心 30-60 秒并丢弃流出液;
9) 离心 1 分钟以去除残留的洗涤缓冲液;
10) 将 硅胶膜纯化柱放入干净的 1.5 m 离心管,加入 50 μl EB 缓冲液(10 mM Tris·Cl,pH 8.5)或无酶水到硅胶膜纯化柱的中心,静置 1 分钟,然后离心 1 分钟;
11) 用干净的 1.5 ml 或 2 ml 无菌离心管收集纯化后的质粒 DNA,后续可保存在-20℃ 冰箱内。
注意事项
1. 所有的操作均可在室温条件下进行;
2. 第 3)步骤不要涡旋处理,否则会导致基因组 DNA 污染,且裂解时间不要超过 5 分钟;
3. 第 9)步骤的目的在于去除 PE 缓冲液中残留的乙醇,乙醇未去除干净的话会对下游酶促反应产生抑制影响;
4. 为了提高洗脱效率,可将 EB 缓冲液或无酶水提前在 65℃ 水浴锅或加热模块中预热;
内容来源:QIAGEN 凯杰
来源:丁香实验