
单细胞蛋白组测序服务
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- 单细胞蛋白组测序(Ab-seq),解决单细胞转录组与蛋白组存在时空不对等性,往往表现为转录本表达但是蛋白未表达;部分为蛋白高表达,而转录本已经降解或者不表达的问题。
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- 2025年07月15日
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- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商:
上海烈冰生物医药科技有限公司
- 服务名称:
单细胞蛋白组测序
产品简介
单细胞转录组与蛋白组往往存在时空不对等性,表现为转录本表达但是蛋白未表达;部分为蛋白高表达,而转录本已经降解或者不表达。基于BD流式分选和蜂巢板捕获技术,单细胞蛋白组作为桥梁链接转录调控两端,可同时完成对每个样本上千个细胞的基因表达和细胞表面蛋白表达的检测。
我们的优势
1. 多种抗体库,300+抗体选择
2. BD FACSMelody流式分选细胞表面Marker,对于较低分辨率的标志物也能有效鉴定
样本要求
样本类型:
组织、血液、培养的细胞系、制备好的单细胞悬液
注:若客户样本为组织,且无能力进行组织解离来获取单细胞悬液,烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助,但因不同类型样本的特异性,无法保证实验方法适用于所有类型组织。
质量要求:
1. 细胞活性大于70%
2. 浓度为500-2000细胞/μl
3. 体积不小于200μl
4. 细胞培养基及缓冲液不能含Ca2+和Mg2+
5. 细胞体积小于40μm
实验流程
数据分析流程
流式分选细胞表面 markers
CD 分 子(cluster of differentiation)是细胞表面的 marker,用于白细胞的鉴定和表征。CD 命名法是由 1982 年成立的 HLDA 研 讨 会(Human LeukocyteDifferentiation Antigens)开发和维护的。目前,CD 命名法已经广泛用于人、 小鼠和其它物种中,该图展示了人和小鼠不同细胞类型表面的 key markers。
Ab-seq抗体选择
烈冰生物具备全套实验平台,为您提供完整的全服务流程,涉及各种类型样本制备、完善的实验质控流程、个性化的数据分析。
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询价记录
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文献和实验血液 CD66b+ 中性粒细胞(PMN)和胰腺癌组织 CD45+ 免疫细胞 单细胞捕获平台:BD RhapsodyTM 单细胞实验分组: HC-PMN(健康组)×2;CP-PMN(慢性胰腺炎组)×2;PDAC-PMN 细胞×5;PDAC免疫细胞×5 主要技术手段: 单细胞测序,空间转录组测序,转录组测序,蛋白组、代谢组质谱分析,免疫荧光,免疫组化,pcr(qpcr)分析 单细胞分析工具应用: 细胞聚类分析,subCluster 分析,差异基因表达分析,GO/Pathway 分析,拟时序分析
单细胞蛋白质组学是精准医学与生命科学前沿的关键技术。然而,由于细胞尺寸小、蛋白质无法扩增、低丰度蛋白测定困难、样本前处理繁琐、检测通量有限等一系列挑战,单细胞蛋白组研究长期面临“测不全、测不准、通量低”的困境。 景杰生物(PTM BIO)依托全球top级的蛋白质组学平台,推出单细胞蛋白质组学解决方案,以“自动化分选 + 高效前处理 + 卓越质谱 + 专属生信”四大核心平台,突破传统技术瓶颈,实现单细胞水平的高深度、高稳定性蛋白鉴定,为肿瘤异质性、免疫微环境、发育生物学及精准医学研究提供有力工具
芯空一号快讯|GeoMx DSP 570蛋白联合PCF空间蛋白解析肿瘤微环境
signaling等通路变化。此外,研究进一步比较RNA和蛋白层面的差异结果,发现部分基质相关分子如FN1、SPP1、ACTA2、COL1A1以及ITGA5在空间区域中呈现一致变化,提示空间多组学联合分析能够从不同分子层面揭示肿瘤微环境特征。 图2 空间转录组与蛋白组联合解析预后相关分子特征 3.PCF单细胞空间蛋白验证关键分子特征并解析肿瘤微环境组成 研究进一步利PCF技术对空间蛋白组学筛选出的关键蛋白marker进行独立验证,包括CD34和CD44等与患者预后
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