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非靶向代谢组学(untargeted metabolome)

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  • 非靶向代谢组学(untargeted metabolome)

    非靶向代谢组学也叫发现代谢组学:
    发现代谢组学一般包括:
    1代谢谱分析(也称为差异表达分析),在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物
    2鉴定,进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构
    3解释,研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联


    分析流程


    生物信息分析


    生物信息学分析
     
    基础服务包  
    1. 原始数据Peak提取及保留时间纠正 2. 多样本Peak比对(peak alignment)
    3. 缺失值模拟 4. 显著性差异Peak分析
    基础分析包(统计分析)  
    1.主成分分析(PCA) 2.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)
    3.热图分析 4.K-means聚类分析
    5.决策树分类分析 6.ROC判别分析
    增殖分析包(功能分析)  
    1. Peak代谢组注释 2. Pathway注释
    增殖分析包(关联分析)  
    1. 代谢组与转录组关联分析 2.代谢组与蛋白组组关联分析
  • 非靶向代谢组学(untargeted metabolome)

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