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非靶向代谢组学(untargeted metabolome)

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      非靶向代谢组学 开学季大降价

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      Bionovogene

    非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics),也称为非目标代谢组学或发现代谢组学,无偏向性地对所有小分子代谢物同时进行检测分析的代谢组学。
    研究流程:
    实验设计-样本采集-代谢物提取-代谢物检测-数据质控-数据分析-生物学解释

    应用领域:
    1. 医学研究:疾病标志物筛查,病因与病理机制探究,疾病复发诊断,疾病的诊断和分型,临床疗效评价,药物毒理学评价
    2. 生命科学研究:非生物环境关系研究,代谢途径及功能基因组研究,植物与微生物研究,药用植物研究中的应用,在表型鉴定中的应用

    实验设计:
    非靶向代谢组学用于检测生物学样品的总体代谢物的信息并进行定量,对不同处理或生理状态的样品进行分组,并通过非靶向代谢组学的方法进行检测,找到不同组别的差异代谢产物,用于后续生理机制的研究


    产品优势

    ● 检测平台采用Thermo Scientific™ Q Exactive™ 等高分辨质谱仪
    ● 无偏好性,是“检测啥结果里就有啥”,不是“库里有啥才能检测啥”
    ● BioDeep 自建数据库+公共数据库,物质数量65万+
    诺米代谢已完成包括动物组织、粪便、肠道内容物、血浆、血清、植物组织、土壤等各类项目6000+,积累了丰富的项目经验
    项目文章100+
    非靶向代谢组分析内容多达24项,更全面阐述数据信息
    ● 提供售前实验方案设计和售后技术答疑等服务

    诺米代谢非靶向代谢组常见物质
    分类 常见物质 数量
    (约)
    氨基酸类 天冬酰胺、苯丙氨酸、缬氨酸、赖氨酸、丙氨酸、酪氨酸 300
    脂肪酸类 己酸甲酯、辛酸甲酯、癸酸甲酯、十一烷酸甲酯、十二烷酸甲酯、十三烷酸甲酯、十四烷酸甲酯/肉豆蔻酸甲酯、甲酯、十五烷酸甲酯 60
    中心碳代谢类 柠檬酸、a-酮戊二酸、L-异亮氨酸、L-亮氨酸、L-赖氨酸、L-甲硫氨酸、L-苯丙氨酸、葡萄糖-6-磷酸、果糖-1,6-二磷酸、琥珀酸盐 60
    脂质 11去氢皮质激素、7a羟基胆固醇、20羧基白三烯B4、二十二碳五烯酸(22n-3)、9,10-环氧十八烯酸、21脱氧皮质醇、双氢睾酮、肾上腺_素、植物鞘氨醇 1500
    有机酸类 酒石酸、马尿酸、L-焦谷氨酸、5-羟甲基-2-糠酸、高香草酸、3-羟基-3-甲基谷氨酸、苯丙_酮酸 500
    神经递质类 5-羟吲哚乙酸、谷氨酰胺、色胺、褪黑素、5-羟基色氨酸、组氨酸、色氨酸、犬尿氨酸 50
    胆汁酸类 别胆石酸、石胆酸、异石胆酸、去氧胆酸、鹅去氧胆酸、熊去氧胆酸、猪去氧胆酸、正胆酸、脱氢胆酸 70
    黄酮类 儿茶素、染料木素、葛根素、黄芩苷、地奥司明、Kaempferol、木樨草素、芦丁、大豆苷元、柚皮苷、淫羊藿苷、白杨素、水飞蓟宾、异槲皮苷、漆黄素、异牡荆素 1000
    激素类 反式-玉米素、茉莉酸甲酯、油菜素内酯、吲哚乙酸、脱落酸、赤霉素、茉莉酸、水杨酸、脱氢异雄酮、二氢睾酮、孕烯醇酮、雌酮、17-羟孕烯醇酮、孕酮、雌二醇、雌三醇、醛固酮 70
    色氨酸类 烟酸(维生素B3)、吡啶甲酸、吲哚-3-甲醛、 3-hydroxyanthranilic acid、色胺、吲哚-3-羧酸、喹_啉酸、吲哚-3-乙酸 30
    花青素类 锦葵色素、天竺葵色素、飞燕草素、芍药色素、槲皮素、芦丁(芸香苷)、Kaempferol、异鼠李素 500
    植物激素类 赤霉素、脱落酸、水杨酸、吲哚乙酸、玉米素、独脚金内酯、褪黑素 100
    其他类别 900
    项目文章举例

    客户
    单位
    杂志名 影响
    因子
    发表
    时间
    文章
    题目
    1 中国科技大学 Cell Metabolism 27.281 2019 CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress
    2 浙江大学 Signal Transduction and Targeted Therapy 18.181 2020 The AKT-independent MET–V-ATPase–MTOR axis suppresses liver cancer vaccination
    3 西安交通大学第一附属医院 Small 13.282 2021 De Novo Nano-Erythrocyte Structurally Braced by Biomimetic Au(I)-peptide Skeleton for MDM2/MDMX Predation toward Augmented Pulmonary Adenocarcinoma Immunotherapy
    4 东南大学 Autophagy 16.014 2019 The HGF-MET axis coordinates liver cancer metabolism and autophagy for chemotherapeutic resistance
    5 复旦大学 Small 13.282 2020 Platelet Membrane-Camouaged Magnetic Nanoparticlesfor Ferroptosis-Enhanced Cancer Immunotherapy
    6 西安交通大学 Chemical Engineering Journal 13.270 2021 Carnosic acid-induced co-self-assembly of metal-peptide complexes into a nanocluster-based framework with tumor-specific accumulation for augmented immunotherapy
    7 复旦大学 Chemical Engineering Journal 13.270 2020 Biomimic FeS2 nanodrug with hypothermal photothermal effect by clinical approved NIR-Ⅱ light for augmented chemodynamic therapy
    8 苏州大学第一附属医院 Journal of Nanobiotechnology 10.431 2021 Melatonin alleviates titanium nanoparticles induced osteolysis via activation of butyrate/GPR109A signaling pathway
    9 中国水产科学研究院 Science of the Total Environment 7.961 2020 Toxic effects of ammonia and thermal stress on the intestinal microbiota and transcriptomic and metabolomic responses of Litopenaeus vannamei
    10 中国水产科学研究院 Science of the Total Environment 7.961 2020 Toxicological effects of microplastics in Litopenaeus vannamei as indicated by an integrated microbiome, proteomic and metabolomic approach
    11 中国林科院 Food Chemistry 7.513 2019 Identification of putative genes for polyphenol biosynthesis in olive fruits and leaves using full-length transcriptome sequencing
    12 中国农业大学 Journal of Experimental Botany 6.994 2019 Growth of maize on mixed nitrate and ammonium promotes auxin synthesis and biomass accumulation
    13 上海交通大学 Microbial Cell Factories 5.320 2019 Simultaneous and sequential based co-fermentations of Trichoderma asperellum GDFS1009 and Bacillus amyloliquefaciens 1841: a strategy to enhance the gene expression and metabolites to improve the bio-control and plant growth promoting activity
    14 中国科学院西北生态环境资源研究院 Land Degradation & Development 4.970 2020 The features of main osmolytes, silicon and their coupling effects in improving drought resistance of the typical xerophytes in the desert areas of northwest China


    分析内容

    差异代谢物层次聚类分析、OPLS-DA_score、差异代谢物柱状图


    案例分析

    【项目文章】HGF-MET 信号通路协调肝癌代谢和化疗耐药的自噬
    The HGF-MET axis coordinates liver cancer metabolism and autophagy for chemotherapeutic resistance

    期刊:Autophagy 影响因子:11.059
    发表时间:2019年 发表单位:浙江大学医学院第一附属医院

    研究内容及创新点

    HGF 刺激并促进了瓦博格效应和谷氨酰胺水解,从而加速了多种肝癌细胞的发生;丙-酮酸脱氢酶复合物 (PDHC) 和GLS/GLS1 是 HGF 活化 MET 激酶的关键底物;MET 介导的磷酸化抑制了 PDHC 活性,但是却激活了 GLS,从而促进癌细胞的发生和代谢。作者证实了 Y1234/1235 去磷酸化 MET 与临床肝癌的自噬相关。


    图 1 HGF-MET 信号通过 PDHC 和 GLS 促进肝癌代谢和生物发生


    图 2 HGF-MET 靶向药物通过诱导自噬来调整肝癌的生物发生

    结论
    MET 抑制剂和自噬抑制剂的联合应用显著提高了肝癌在试管和小鼠的治疗效率。

    参考文献
    Renaudin Felix,Orliaguet Lucie,Castelli Florence et al. Gout and pseudo-gout-related crystals promote GLUT1-mediated glycolysis that governs NLRP3 and interleukin-1β activation on macrophages.[J] .Ann. Rheum. Dis., 2020

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