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天根生化科技(北京)有限公司
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NGS科技服务-单细胞测序
单细胞测序指在单个细胞水平上对基因组进行测序。主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两方面,分别针对单个细胞的DNA和RNA进行序列分析和比较,进而揭示基因组和转录组的变化。
产品list:
| 单细胞转录组 |
| 海量单细胞 |
| 单细胞基因组 |
重点结果展示:
图中每个点代表一个细胞,每种颜色代表一个cluster。该图是通过t-SNE算法得到的二维结果。在这个二维空间中,彼此接近的细胞对与具有相似距离的细胞具有更相似的基因表达谱。
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文献和实验的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
单细胞测序在疾病诊断和细胞异质性研究中发挥着重要作用。然而目前的单细胞测序手段需要将细胞消化并裂解才能够进行,而细胞状态在这一操作中不可避免的会发生改变,因此很难掌握细胞真实的基因表达情况,尤其对于基因通路上表达变化的检测为不利。近期苏伊士理工大学使用FluidFM创建了一种原位活细胞基因测序方法,这种方法能够在不杀死细胞的情况下完成对细胞的测序工作。通过这种技术该团队成功完成单细胞RNA基因测序,并通过这种方法检测到了细胞的基因表达和细胞周期状态变化。下面本文就这项工作的具体内容进行阐述
单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域,但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题,比如: 1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液,比如已经在-80℃冻存的样本; 2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获,比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等,由于直径过大,超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径; 3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失,比如脑部的新生神经元、肾脏的肾小球足细胞和肾小球系膜细胞等都会在单细胞
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