
单细胞免疫组库测序服务
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- 单细胞免疫组库测序是在一个样本中同时获5'端表达谱、T细胞受体和B细胞免疫球蛋白库的信息,结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。
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- 2025年07月15日
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- 提供商:
上海烈冰生物医药科技有限公司
- 服务名称:
单细胞TCR/BCR测序
单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近万个细胞,可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息,结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的影响免疫应答分析,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生和发展的分子机制。
(图片来源:Wang Y, et al., Journal of Infection, 2023)
服务优势
1. 1000+ TCR/BCR项目经验,一次实验可同时获取1000-10000个细胞的文库构建,获得转录组和免疫组数据。
2. 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程,获取V(D)J全长序列的配对信息。
3. 丰富的免疫组库测序和数据分析经验,实现专属个性化数据分析服务,搭配单细胞分析云平台,一键导出交互性的动态结果报告。
4、免疫组库测序经验丰富,助力发表高分SCI文献:
样本要求
样本类型:
组织、血液、培养的细胞系、制备好的单细胞悬液
注:若客户样本为组织,且无能力进行组织解离来获取单细胞悬液,烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助,但因不同类型样本的特异性,无法保证实验方法适用于所有类型组织。
质量要求:
1. 细胞活性大于70%;
2. 浓度为500-2000细胞/μl;
3. 体积不小于200μl;
4. 细胞培养基及缓冲液不能含Ca2+和Mg2+;
5. 细胞体积小于40μm。
实验流程
数据分析流程
结果示例
V(D)J基因的使用频率:上图主要展示了TCR序列中V基因的使用情况
注:横坐标为V基因,纵坐标为J基因
V-J基因组合频率:下图主要展示了TCR序列中V-J基因组合情况。
注:横坐标为CDR3长度分布,纵坐标为细胞占比
CDR3序列长度:上图主要展示了CDR3序列的长度分布,以及使用频率最高的12个TRAV基因对应的CDR3长度信息。
注:横坐标为clonotype编号,纵坐标为细胞占比
克隆频率统计:该图主要展示了TOP50 clonotype对应的细胞占比。
注:Unique或数字: 每个clonotype对应的细胞数(size)
克隆增殖统计:下图主要展示了不同size对应的clonotype的占比情况
注:右图中,XY轴均为cluster编号,括号内为该cluster中检测到TCR序列的细胞数
注:横向纵向均为样本名称,括号内为该样本中检测到的clonotype数,色块内为overlap的clonotype数。
文献示例
[1] MHC class Ib–restricted CD8+ T cells possess strong tumoricidal activities. PNAS.2023 Aug; IF=11.1
[2] Prmt5 deficiency inhibits CD4+ T-cell Klf2/S1pr1 expression and ameliorates EAE disease. Journal of Neuroinflammation. 2023Aug; IF=9.3
[3] Systemic immune dysregulation in severe tuberculosis patients revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Infection. 2023Mar; IF=28.2
[4] Tumor-intrinsic YTHDF1 drives immune evasion and resistance to immune checkpoint inhibitors via promoting MHC-I degradation. Nature Communications. 2023 Jan; IF=16.6
[5] Single-Cell Landscape Highlights Heterogenous Microenvironment, Novel Immune Reaction Patterns, Potential Biomarkers and Unique Therapeutic Strategies of Cervical Squamous Carcinoma, Human Papillomavirus_x005f Associated (HPVA) and Non-HPVA Adenocarcinoma. Adv Sci. 2023 Jan; IF=15.1
[6] Influenza vaccination features revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Medical Virology. 2022 Sep; IF=12.1
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文献和实验[1] MHC class Ib–restricted CD8+ T cells possess strong tumoricidal activities. PNAS.2023 Aug; IF=11.1
[2] Prmt5 deficiency inhibits CD4+ T-cell Klf2/S1pr1 expression and ameliorates EAE disease. Journal of Neuroinflammation. 2023Aug; IF=9.3
[3] Systemic immune dysregulation in severe tuberculosis patients revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Infection. 2023Mar; IF=28.2
[4] Tumor-intrinsic YTHDF1 drives immune evasion and resistance to immune checkpoint inhibitors via promoting MHC-I degradation. Nature Communications. 2023 Jan; IF=16.6
[5] Single-Cell Landscape Highlights Heterogenous Microenvironment, Novel Immune Reaction Patterns, Potential Biomarkers and Unique Therapeutic Strategies of Cervical Squamous Carcinoma, Human Papillomavirus_x005f Associated (HPVA) and Non-HPVA Adenocarcinoma. Adv Sci. 2023 Jan; IF=15.1
[6] Influenza vaccination features revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Medical Virology. 2022 Sep; IF=12.1
的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。 简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 . 分析样本内/样本间Clonotype组成(如增殖性克隆,细胞类型间clonotype overlap情况
-Sequencing (scRNA-seq) Analysis Outline (Trends Immunol. 2017 Feb;38(2):140-149.)但随着科研要求的不断增高,以及技术手段的不断发展,免疫组库的研究也正逐渐向更精细的方向发展,单细胞免疫组库测序,使得科学家从另一个角度认识这个复杂的系统。单细胞 RNA 测序是分析个体免疫细胞的有力工具,特别是在免疫系统发育和反应过程中。专门用于处理和分析单细胞数据的计算方法可以观察在群体水平无法解决的罕见和中间细胞状态。而 B 细胞和 T 细胞的单细胞
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