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OBiO和元生物
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指在指定时间,某个体循环系统中所有功能的多样性T细胞和B细胞的总和。在B细胞和T细胞中发现的受体分别被称为B细胞受体(B Cell Receptor,BCR)和T细胞受体(T Cell Receptor,TCR)。免疫组库就是研究BCR和TCR,探究人体免疫机制。
技术流程
①单细胞悬液制备:从目标器官或组织分离活单细胞,需要摸索和调整消化方案,以最大限度地增加细胞数量和细胞质量,同时减少细胞死亡;
②细胞活性检测:对单细胞悬液进行质检,包括细胞活性、细胞直径、细胞数量、结团率和碎片率等;
③单细胞捕获:制备好合格的细胞悬液,凝胶磁珠和油滴分别加入到Chromium Chip A的不同道(共8个道),经由微流体“双十字”交叉系统形成GEM。
④细胞裂解、cDNA反转录及PCR扩增:GEM混合后进行细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量引物序列,并与细胞裂解液、反应混合物(包含反转录试剂和 poly(dT) 反转录引物)混合,带有polyA 的RNA逆转录产生带有10X Barcode和UMI信息的cDNA;

⑤TCR/BCR区域富集:对全长cDNA分为两份,一份使用5'接头的通用引物进行巢式PCR,此过程加上测序接头P5,实现5‘转录组PCR扩增’;另外一份使用TCR/BCR恒定区的连续巢式引物进行巢式PCR,此过程加上测序接头P5,实现TCR/BCR区域富集;
⑥文库构建:TCR/BCR区域扩增富集完成后酶切片段化,通过控制打断不同长度而最终得到的序列可以覆盖整个V(D)J片段cDNA序列,通过末端修复、加A、接头连接Read2测序引物,PCR构建含有P5和P7接头的V(D)J文库;
⑦上机测序。
技术服务优势
①支持T/B细胞的克隆型研究,从而鉴定免疫细胞的克隆多样性;
②从样本制备到个性化分析,为您提供全方位的服务。
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文献和实验的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。 简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 . 分析样本内/样本间Clonotype组成(如增殖性克隆,细胞类型间clonotype overlap情况
球蛋白库以微调与抗原的相互作用。免疫系统在自身免疫疾病、传染病、癌症等多种疾病中扮演者至关重要的角色,也正因此免疫组库测序一直是多方领域的研究重点,即以 T/B 淋巴细胞为研究目标,对其产生的多样化免疫分子例如膜型免疫分子 BCR 和 TCR、分泌型免疫分子抗体等进行测序研究。新技术 10x 单细胞 V(D)J 的优势传统免疫组库测序利用的是多重 PCR 或 5’RACE 方法,但都存在一定的局限性,如多重 PCR 法扩增范围局限在 CDR3 区、5'RACE 法只能获得单链全长信息等。10x
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