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- 2026年01月20日
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锐博生物
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circRNA测序
环状RNA(circular RNA，circRNA)是近年来发现的一类特殊的非编码RNA，大量存在于真核细胞胞质内，主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生，具有很多重要的调控功能。circRNA可以作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA，ceRNA)结合胞内miRNA，阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。除此以外，circRNA也具有调控其它类型RNA、调节蛋白质活性等功能。circRNA在不同物种中具有保守性，而且存在组织表达差异，其环状结构对RNase不敏感，所以它比线性RNA更为稳定。越来越多的研究发现，circRNA在开发新型疾病诊断与治疗方法上具有巨大潜力且意义重大。
1、去rRNA、去线性RNA针对环状RNA建库，排除了线性RNA干扰
2、有效提高数据可靠性及检测效率，可检测到低丰度的稀有环状RNA
3、针对环状RNA开发出相应的分析方法和算法，深度挖掘环状RNA生物学功能、发现新的环状RNA
服务优势
1、去rRNA、去线性RNA针对环状RNA建库，排除了线性RNA干扰
2、有效提高数据可靠性及检测效率，可检测到低丰度的稀有环状RNA
3、针对环状RNA开发出相应的分析方法和算法，深度挖掘环状RNA生物学功能、发现新的环状RNA
项目流程
生物信息学分析项目
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文献和实验相关实验
课程内容： 1.miRNA Sponge 研究窘境 2.circRNA 研究的重要科学问题 3.新兴的 circRNA 研究思路：修饰，翻译，结合蛋白等等
环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域的研究热点。circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。circRNA分子富含microRNA(miRNA)结合位点,在细胞中充当miRNA分子海绵(miRNA sponge),可以解除miRNA对其靶基因的抑制作用。 在circRNA的研究中,设计出特异的circRNA引物极为关键。以下简介在circRNA的研究中,如何准确快速获得感兴趣circRNA序列并设计对应的环状RNA引物
-tool利用 464 个 RNA-seq 测序数据，进行新 circRNA 预测及基因组注释，并计算已知的及新预测的 circRNA 表达情况，构建 circRNA-miRNA-genet 调控网络，以上信息均可从该数据库获得。物种为人。4.deepBase v2.0网站链接：http://www.rna-seqblog.com/deepbase-v2 - 0 -identification-expression-evolution-and-function-of-small-rnas-lncrnas
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