上海miRNA测序实验

上海miRNA测序实验

miRNA 测序是研究特定组织在特定状态下的已知miRNA，分析预测新的miRNA，并对已知 miRNA 和新miRNA进行靶基因预测。通过对miRNA靶基因注释及代谢通路分析，将鉴定出的 miRNA与相应表型差异关联起来，为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力的工具。

上海miRNA测序实验生物信息分析内容

1、数据产出统计和质量评估

2、sRNA在参考基因组上的分布

3、sRNA分类注释统计

4、碱基偏好性分析

5、基因表达水平分析

6、新转录本预测

7、差异miRNA靶基因预测

8、差异基因筛选及聚类分析

9、差异表达miRNA靶基因GO富集分析

10、差异表达miRNA靶基因Pathway富集分析

11、差异表达miRNA靶基因蛋白互作网络分析

技术参数

样本类型：total RNA

样本要求：总量≥3 μg，浓度≥200 ng/μL

文库类型：Small RNA文库

测序策略：HiSeq SE50，推荐数据量：≥10M reads

项目周期：35个工作日

结果示例

样本已知miRNA各位置碱基偏好性

新miRNA二级结构及reads mapping示意图

各个样本之间共有novel miRNA分布