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- 2025年12月29日
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上海达为科生物科技有限公司
- 服务名称：
miRNA测序
| 品牌 | 其他品牌 | 产地类别 | 国产 |
|---|---|---|---|
| 应用领域 | 医疗卫生,生物产业,综合 |
miRNA测序：利用测序分析软件，通过小RNA测序可以快速鉴定物种全谱的小RNA组，并预测新的miRNA，同时可对miRNA的靶基因进行预测和功能分析。
miRNA测序服务介绍
microRNA(miRNA)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或抑制mRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达（新发现miRNA也能在转录水平调控基因表达）。miRNA在物种进化中相当保守，在动物、植物和**等中发现的miRNA表达均有严格的组织特异性和时序性。miRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用，包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的miRNA测序，可以一次获得数百万条miRNA序列，能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同**状态下已知和未知的miRNA及其表达差异，为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。
miRNA测序分析项目
标准分析项目
1) 原始数据质控（去接头污染，去低质量reads），数据产出统计；
2) 与参考序列比对；
3) 小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比对信息；
4) 小RNA与miRBase中某范围的已知的 miRNA的比对；
5) 按照优先级将小RNA进行分类注释；
6) 预测新的miRNA；
7) 差异miRNA分析；
8) 差异miRNA表达聚类分析；
9) miRNA靶基因预测分析
10) 靶基因功能富集分析
分析项目（以下分析选择分析结果较好的3~5个）
靶基因蛋白互作网络分析
miRNA功能协同网络分析
miRNA通路协同网络分析
miRNA共调控网络分析
miRNA活性分析
按照客户要求对兴趣miRNA进行深入分析；
重要miRNA的功能富集分析；
样本要求：
RNA样品总量: ≥3μg
RNA样品浓度: ≥200 ng/μL
项目周期：
45个工作日
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文献和实验的小分子――筛选一定大小的RNA分子，连接到3'和5'的适配子（adapters），逆转录并通过PCR扩增、亚克隆并测序。miRNA前体在基因组上的定位和聚类是通过向基因组数据库查询进行。这个方法有助于判断miRNAs是否是mRNAs、tRNAs、rRNAs等分子的降解产物。 有的实验室通过一种RNA folding program 'mfold'来判断C. elegans和C. briggsae之间的高度保守区域是否含有潜在的miRNA前体，然后用Northern Blots的方法来确定
案例：通过深度测序分析乳腺癌中 microRNA 的序列和表达 背景： microRNAs 调控很多对肿瘤发生非常重要的基因。乳腺癌中很多 microRNAs 是下调的，但系统的乳腺癌中 microRNA 的表达分析还没有被报道。 目的： 利用 Illumina HiSeq2000 测序平台对不同类型乳腺癌组织和细胞进行测序，分析其 microRNAs 表达差异。 结果：通过对 11 个正常乳腺组织，17 个非转移
一、miRNA的靶基因寻找研究表明，一个基因可以受多个miRNA调控，而一种miRNA又可以参与调控多个靶基因，据预测，至少有30%的人类基因是miRNA的靶基因。这就足以显示出miRNA群体的重要性。而在人类疾病中多不同程度的表现出大量miRNA的上调和下调，这也足以显示miRNA在疾病发生过程中占据着非常重要的作用。而探讨miRNA的功能作用中最重要的一步就是高效准确的寻找到其所调控的靶基因。目前寻找靶基因主要是从以下两个方面入手。1．生物信息学方法miRNA靶基因的预测主要是根据生物
