miRNA 测序案例分析
上海英拜生物
6102
案例：通过深度测序分析乳腺癌中 microRNA 的序列和表达
背景： microRNAs 调控很多对肿瘤发生非常重要的基因。乳腺癌中很多 microRNAs 是下调的，但系统的乳腺癌中 microRNA 的表达分析还没有被报道。
背景： microRNAs 调控很多对肿瘤发生非常重要的基因。乳腺癌中很多 microRNAs 是下调的，但系统的乳腺癌中 microRNA 的表达分析还没有被报道。
目的： 利用 Illumina HiSeq2000 测序平台对不同类型乳腺癌组织和细胞进行测序，分析其 microRNAs 表达差异。
结果：通过对 11 个正常乳腺组织，17 个非转移组织，151 个转移组织，及 6 种乳腺癌相关细胞系测序分析发现，正常组织中 miR-21 是高表达的，发生转移的乳腺癌病人的乳腺组织中 mir-423 是上调的，三阴乳腺癌病人中 mir~17-92 是特异性上调的，但是这些变化并不显著。
这些结果表明，基于 microRNAs 水平对乳腺癌类型进行区分及预测转移统计学上可能是可行的，但是乳腺癌类型及转移的差异并不是由于富集的 microRNAs 的下调驱动的，提示在乳腺癌的发展过程中起作用的 microRNAs 不多。
原文索引：
Farazi TA1, Horlings HM, Ten Hoeve JJ（2011）MicroRNA sequence and expression analysis in breast tumors by deep sequencing. Cancer research, 71(13), 4443-4453
