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免疫细胞浸润比例分析

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      免疫细胞浸润比例分析

    免疫细胞浸润比例分析

    1 分析目的
    从免疫细胞组分这一角度,分析肿瘤样本特异的免疫特性,挖掘潜在的特征,这一特征可用于肿瘤预测模型和预后预测模型
    2 数据来源
    基因表达谱
    3 分析方法
    基于样本的基因表达谱,我们利用免疫细胞浸润分析在线工具EPIC[14]https://gfellerlab.shinyapps.io/EPIC_1-1/)分析各个样本的免疫细胞比例,包括B细胞(Bcells)、 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)、CD4+T细胞(CD4_Tcells)、 CD8+T细胞(CD8_Tcells)、 内皮细胞(Endothelial)、 巨噬细胞(Macrophages)和NK细胞(NKcells)以及其它类型细胞(otherCells)。对于每一种免疫细胞的浸润比例,我们利用Welch双样本非配对T检验,对Tumor vs Normal间的差异进行统计分析。
    4 交付文件
    1)每个样本的各类免疫细胞组分(Excel
    2)肿瘤vs对照的免疫细胞组分差异统计分析(Excel
    5分析结果示例图
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    联系人:刘经理
    电话:021-54376058
    手机:13917998048 (7:00-24:00, 周末节假日不休)
    邮箱:yanzaibio@yihaowan.cn, yanzaibio@163.com
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    地址: 上海市闵行区放鹤路1088号博济科技园6号楼109室
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