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免疫细胞浸润比例分析
免疫细胞浸润比例分析
1 分析目的从免疫细胞组分这一角度,分析肿瘤样本特异的免疫特性,挖掘潜在的特征,这一特征可用于肿瘤预测模型和预后预测模型
2 数据来源
基因表达谱
3 分析方法
基于样本的基因表达谱,我们利用免疫细胞浸润分析在线工具EPIC[14](https://gfellerlab.shinyapps.io/EPIC_1-1/)分析各个样本的免疫细胞比例,包括B细胞(Bcells)、 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)、CD4+T细胞(CD4_Tcells)、 CD8+T细胞(CD8_Tcells)、 内皮细胞(Endothelial)、 巨噬细胞(Macrophages)和NK细胞(NKcells)以及其它类型细胞(otherCells)。对于每一种免疫细胞的浸润比例,我们利用Welch双样本非配对T检验,对Tumor vs Normal间的差异进行统计分析。
4 交付文件
(1)每个样本的各类免疫细胞组分(Excel)
(2)肿瘤vs对照的免疫细胞组分差异统计分析(Excel)
5分析结果示例图
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文献和实验性物质(如51Cr释放实验)或抗体标记(如流式细胞分析)进行定量分析; 3. 需要将多个时间点的不同样本(孔)数据关联在一起,以生成时程曲线,从而可能导致人为因素误差; 4. 检测时缺少环境控制而导致细胞变化,从而可能出现不需要或误导性的实验结果。 Incucyte® 提供全套免疫细胞杀伤方案,可实时查看和自动分析免疫细胞介导的肿瘤细胞杀伤作用,通过这种非侵入性、无干扰性的细胞分析平台对免疫细胞、抗体功能&杀伤能力获取新的见解。Incucyte®免疫细胞杀伤方案适用于研究: - 细胞
有2/3是生物医学方面的专家,而我国生物医学界没有人被邀参加,可见我国过去对如何将图像分析应用于医学生物学方面的研究重视得不够,对国际上这方面的信息掌握得不及时。国内自70年代末期相继从国外引进大型自动图像分析仪后,80年代才开始将医学生物学研究与图像分析方法结合起来。从1981~1983年召开了三次全国体视学与图像图像分析学术会议,1987年召开了第四次学术会议,虽然在宣读的论文中医学研究已占了很大的比例,但具体应用到免疫细胞化学则实例极少,仅是一个开端。1988年中国体视学会正式成立,是在民政部登记
最近有同学问师兄,“最近我要做生存分析,可是我不太会,也不太懂,师兄能不能教教我”,好吧,今天开一贴,讲讲这个。有同样的问题的同学可以一起来看看,毕竟在临床、科研上,这方面知识还是很受用的。有什么想跟师兄讨论的,可以加师兄微信号:laiwenshixiong,加我时,注意注明申请理由,如果申请理由是你的名字话,那你就会被师兄忽略掉。就这样吧。让我们开始征程。一、生存分析基本概念1、事件(Event)指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者










