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肠道菌群非靶标代谢组学
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上海百趣生物医学科技有限公司
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面议
人体内肠道微生物数量高达100万亿个,接近自身细胞总量的10倍,是人体的“第二基因组”,也被称为“人体另一个器官”。大量研究表明肠道菌群与糖尿病、肝脏疾病、心脑血管疾病、肾病、艾滋病、肿瘤等多种疾病密切相关,在人类健康和疾病中发挥着至关重要的作用。
肠道菌群通过产生的代谢物对人体产生影响。运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,清晰展示肠道菌群在宿主中的代谢状态,可更加直观的研究肠道菌群与疾病发生发展的关系,从而为疾病的预防和治疗,提高宿主的健康水平提供新的思路。
通过KEGG、BIOML、CGR、HBC、GMrepo等数据库结合文献及宏基因组深度测序数据,Biotree自主构建了肠道菌群代谢组数据库,覆盖2200+个菌种,3700+个肠道菌群相关代谢物,不仅可有效对代谢物进行溯源分类,而且代谢物可精细溯源到具体菌株(部分为种属),将大大助力肠道菌群与健康作用机制研究。
技术优势
覆盖2200+个菌种,3700+个肠道菌群相关代谢物,代谢物数量、菌株数量庞大
不仅可对众多物种的代谢物进行溯源分类,而且代谢物可以溯源到菌株
代谢物可以确定上下游关系(如果是可逆反应则无)及调控基因/酶
应用方向
肠道菌群代谢物动态变化研究
肠道菌群差异代谢物筛选
肠道菌群在疾病发生发展中的作用机理研究
合作案例
Acupuncture ameliorates breast cancer-related fatigue by regulating the gut microbiota-gut-brain axis.2022.Frontiers in Endocrinology.(IF=6.055)【客户文章】
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文献和实验同济医院张子强团队运用 AFADESI 空间代谢组与微生物组联用探究肠道菌抗癌新机制
tumoral metabolism in mice”。该研究通过微生态组学及 AFADESI 空间代谢组学等多个层面的研究,首次发现了肠道菌群和肺癌微生态之间潜在的全新调控作用,阐明了肠道/肿瘤菌群交互作用以及菌群参与调控肿瘤发生发展的关键机制。其中 AFADESI 空间代谢组学由鹿明生物提供技术支持; 本研究的前提有如下几点: 1.肠道菌群对肿瘤生物学有深远影响,比如口服双歧杆菌(Bifidobacterium)会增强 PD-L1 的治疗效果; 2.肿瘤组织内部也有微生物存在,称为瘤内菌群。它可能会
实验或组学技术联合分析,再涉及到多组学分析的环节,把课题联合分析做完善是关键。 研究思路文章参考: 中文标题:人参固本对甲状腺素毒症小鼠的抗衰老作用:改善免疫衰老、低蛋白血症、脂毒性和肠道菌群 研究对象:小鼠 发表期刊:Frontiers in Immunology 影响因子:8.786 发表时间:2022 年 10 月 25 日 合作单位:鲁南制药集团,山东大学齐鲁医院 运用组学技术:流式细胞技术、蛋白质组学,粪便代谢物学、植物代谢组学和微生物组学,其中蛋白组学和代谢组学由鹿明生物提供检测和支持
Cell Reports:天津医科大学王荃 / 姚智发现肠道共生细菌参与肠道稳态调控新机制
炎性肠病(IBD)是一种全球性疾病,在我国发病率呈显著上升趋势。IBD 发病机制仍不清楚,认为与肠道菌群和遗传等多种因素相关。肠道菌群对宿主生理和病理具有重要影响,特别在免疫发育和稳态调节方面具有多种效应。肠道菌群及相关代谢物对宿主的免疫调节机制研究处于起步阶段,大量效应菌株和相关代谢物有待挖掘。 北京时间 2022 年 8 月 30 日晚 23 时,天津医科大学基础医学院、天津市免疫学研究所王荃教授和姚智教授合作在 Cell Reports 杂志上在线发表论文 Enterobacter
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