- 询价
- 肿瘤风险分层和生存预后的新型免疫相关基因特征构建
- 中国
- 2025年12月29日
企业认证
相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
研载生物
- 服务名称：
肿瘤风险分层和生存预后的新型免疫相关基因特征构建
r 背景介绍
随着基因表达谱在低级别胶质瘤 (LGG) 中的流行，并且基于免疫微环境的关键作用，本研究的目的是开发用于 LGG 风险分层和预后预测的免疫相关特征。使用TCGA、GTEx和CGGA 的 RNA 测序数据，从ImmPort获得免疫相关基因，采用单变量、多变量 cox 回归和 Lasso 回归来识别差异表达的免疫相关基因并建立特征。构建了一个列线图，并通过 Harrell 的一致性指数 (C-index)、ROC和校准曲线评估其性能。使用 CIBERSORTx 和 TIMER 评估风险评分和肿瘤浸润免疫细胞丰度之间的关系。作者鉴定了 277 个免疫相关的差异表达基因。确定了 6 个免疫基因（CANX、HSPA1B、KLRC2、PSMC6、RFXAP 和 TAP1）作为风险特征。Kaplan-Meier 曲线、ROC 曲线和风险图验证了其在 TCGA 和 CGGA 数据集中的性能。单变量和多变量 Cox 回归表明风险组是原发性 LGG 的独立预测因子。CIBERSORTx 算法显示，幼稚 CD4+ T 细胞在低风险组中显著升高。相反，在 TCGA 和 CGGA 队列中，高危组的 M1 型巨噬细胞、M2 型巨噬细胞和 CD8+T 细胞的浸润水平显著升高。本研究构建了一个稳健的六种免疫相关基因特征，并建立了一个预后列线图，可有效用于原发性 LGG 的风险分层和总生存期预测。r 数据来源
基因表达谱（TCGA数据库、GTEx数据库、CGGA数据库）
r 分析流程
r 参考文献
Zhang M, Wang X, Chen X, Zhang Q, Hong J. Novel Immune-Related Gene Signature for Risk Stratification and Prognosis of Survival in Lower-Grade Glioma. Front Genet. 2020 Apr 15;11:363. doi: 10.3389/fgene.2020.00363. PMID: 32351547; PMCID: PMC7174786.
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验Cancer Immunol Res：石敏团队揭示重塑基质代谢 - 免疫排斥微环境改善 MSS 型结直肠癌免疫治疗疗效
）以及能量代谢型（EM）。值得注意的是，SM 亚型预后最差，Hippo、NOTCH 和 Wnt 等多种致癌途径显著激活，具有促肿瘤和抗肿瘤微环境因子同时上调、基质细胞（CAF、内皮细胞）及免疫抑制性髓系细胞（M2 巨噬细胞、MDSC）浸润显著增加等特征，呈现出免疫排斥微环境的特点（SM-免疫排斥亚型）。其中，SM 亚型的特征代谢通路——硫酸软骨素（CS）代谢通路是总生存的独立风险因素，同时与免疫排斥微环境因素具有强相关性。 图 1 基于转录组的全面代谢通路评分鉴定 MSS 结直肠癌代谢亚型 图 2 CS
Cell I 乳腺癌良好预后的新型生物标志物— FOLR2+巨噬细胞
细胞 /CD8+ T 细胞共定位与有利的临床预后结果相关，表明这种新表征的巨噬细胞亚群具有明确的抗肿瘤作用，对于肿瘤治疗具有积极意义。 另一类 TREM2+ 巨噬细胞在健康乳腺组织中的表现不佳，随着肿瘤的发展而增加并促进肿瘤发生。相比之下， FOLR2+ 巨噬细胞是在癌症发展开始之前填充健康乳腺的组织驻留巨噬细胞 (TRM)。定义 FOLR2+ 巨噬细胞的特定基因特征与乳腺癌患者更好的生存率相关。 因此，FOLR2+ 巨噬细胞与 CD8+ T 细胞等抗肿瘤免疫的主要细胞参与者的特征呈正相
Cell: 有的放矢，首个泛癌肿瘤微环境图谱，可准确预测免疫治疗疗效
个功能基因表达特征 (Fges)，创建了包括免疫富集，无纤维化（IE/F4）、免疫富集，纤维化的（IE）耗尽的（D）和纤维化的（F）四种不同黑色素瘤的 TME 模型。并进一步通过改进对特定细胞类型和生物过程的相关基因，对异质的细胞功能和黑色素瘤 TME 属性进行更细致的分类并整合了不同治疗病人的预后信息。 图片来源：Cancer Cell 为了确认训练集建立模型的可行性和准确性，研究者进一步对 23 个独立的黑色素瘤数据集进行验证。结果首先复现了上述建立的四种 TME 亚型分类，随后通过结合
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
