- 询价
- 中国大陆地区
- 生物信息学分析
- 2026年01月04日
企业认证
相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
伯豪生物
- 服务名称：
伯豪生物生物信息学分析
上图中节点的大小表示的是基因的 degree，颜色代表上下调的信息，边的颜色或者线型代表是相互作用的来源。
转录因子分析及网络构建介绍转录因子与基因表达调控区域的特异性结合是基因表达的重要调控方式。针对特定转录因子的实验，可对差异基因进行转录因子结合位点的 motif 分析，从而推测差异基因中有哪些基因可能直接受该转录因子调节。后结果会用统计学方法进行检验，找到调控目标生物性状，统计学上有显著差别的转录因子。找到差异的转录因子及其调控的靶基因，我们可以构建 TF-network，从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因，系统的研究转录因子与基因的调控关系。
客户关注的 mRNA,lncRNA,microRNA（如差异基因）。
1、图片文件（Network 图），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打开进行细节调整；
3、文本文件：转录因子与基因之间的调控关系，结合 score 值，Evalue，以及关键转录因子的排序。
二、基因相互作用网络图
上图中节点的大小表示的是基因的 degree，颜色代表上下调的信息，边的颜色或者线型代表是相互作用的来源。
基因相互作用网络图介绍基因网络是一组基因的集合体，这些基因通过相互协作来控制生物体重要的生命过程。我们将客户关注基因进行基于实验验证，其他亲缘物种数据库检索、文献挖掘等多种信息进行基因互作网络的构建，找到关键核心基因。
客户关注的 mRNA（如差异基因）。
1、图片文件（Network 图），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打开进行细节调整；
3、文本文件：基因之间的互作关系，关键调节基因的排序（如 betweenness centrality）。
三、共表达网络图
网络图为筛选出的核心基因之间的关系，通过图论的方法计算出关键基因，并通过关键基因的共表达基因预测出其功能。
共表达网络构建根据基因表达信号值的动态变化，计算基因间的共表达关系，得到基因间的表达调控关系及调控方向，从而构建基因的表达调控网络。利用共表达网络图，研究者可通过分析基因调控能力，获得样本随实验变化的核心调控基因。
每组数据 3 个或 3 个以上生物学重复并且为差异基因或者关注的部分基因。
1、图片文件（Network 图），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打开进行细节调整；
3、文本文件：基因之间共表达相关性以及显著性，基因核心共表达的排序。
四、WGCNA
基于加权共表达的计算，利用平均层次聚类的模块的划分，模块与性状之间的相关性，挑选出显著性的性状，构建相应网络图，从而找到与性状相关的核心基因。
加权基因共表达网络分析（WGCNA）寻找协同表达的基因模块（module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中的核心基因。
样本数量在 3 组以上，并且每组的样本重复为 3 个或 3 个以上。
1、图片文件：cluster tree，module relation 等；
2、文本文件：每个 module 的所属基因，以及基因之间的相关性；
3、module 之间的相关性。
五、microRNA 与靶基因网络图
结果中显示了 microRNA 与 mRNA 之间的关系，图中 microRNA 调控的靶基因越多，说明 microRNA 影响了这一群靶基因的功能；靶基因被多个 microRNA 调控，说明该基因为核心的基因。
microRNA 与靶基因网络图介绍将显著性功能与显著性 Pathway 所包 含的靶基因取交集后与 microRNA 构建 microRNA 靶基因调控网络，可以在全局的水平上直观的反应基因之间的相互关系，同时反映了基因调控网络的稳定性。根据网络中 microRNA 的位置函数计算出 microRNA 在网络中的关系强度，即 microRNA 的网络特征值。特征值高 microRNA 处于网络的枢纽性地位，该 microRNA 调控能力强，对网络结构和样本性状有重要的调控价值，同时从网络中也可以得到被 microRNA 调控的关键靶基因。
microRNA 进行靶基因预测并且对靶基因进行筛选后。
1、图片文件（Network 图），包括 png,PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打开进行细节调整；
3、文本文件：microRNA 与靶基因的关系，microRNA 与靶基因的核心基因筛选。
六、microRNA-GO-network
......
七、microRNA-pathway-network
......
八、Pathway-Network
......
九、趋势分析
......
十、lncRNA 和 mRNA 共表达分析
......
十一、功能层次网络构建
......
十二、ceRNA 调控网络
......
十三、GSEA 分析
......
十四、时间序列共表达网络
......
十五、分子建模预测
......
十六、IPA—Canonical pathways analysis
......
十七、Diseases and Bio Functions
......
十八、信号通路网络图
......
十九、上游调控分析
......
二十、调控机制分析
......
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验伯豪生物客户项目发文
| 序号 | 伯豪生物提供服务 | 杂志 | IF | 发表年份 |
| 1 | 【样本】：细胞 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Journal of Hepatocellular Carcinoma | 4.3 | 2023 |
| 2 | 【样本】：心脏组织 【服务】：代谢组学数据分析 原文链接【点击查看】 | Molecular Omics | 2.9 | 2023 |
| 3 | 【样本】：组织 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Pharmacogenomics & Personalized Medicine | 2.6 | 2022 |
| 4 | 【服务】：IPA 原文链接【点击查看】 | Chemical Engineering Journal | 16.7 | 2022 |
| 5 | 【服务】：GO and KEGG 原文链接【点击查看】 | Biomed Research International | 3.2 | 2022 |
| 6 | 【样本】：组织 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Journal of Oncology | 4.5 | 2022 |
| 7 | 【样本】：组织 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Clinical and Translational Medicine | 8.5 | 2022 |
| 8 | 【样本】：动脉组织 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Free Radical Biology and Medicine | 8.1 | 2021 |
| 9 | 【服务】：数据分析 原文链接【点击查看】 | Chemosphere | 8.9 | 2021 |
| 10 | 【服务】：在线分析工具 原文链接【点击查看】 | Aging-US | 5.9 | 2021 |
| 11 | ...... |
生信分析，作为研究和发文章的方法受到很多人的青睐。所以，过去一段时间，这类文章如雨后春笋般涌现，因为这个方法简单，导致出现了很多注水文章，因此，让一些同学望而却步。 其实，生信分析只是一种手段、一种方法、一种思路。好的分析和严谨的验证，依旧能做出好的成果，关键在于如何去利用好工具。 用生信分析数据挖掘，发文章，依然不乏有好文章出现，重要的是新的 idea。此外，生信分析也是一个寻找课题的好思路，对于没有自己测序结果或者只有临床数据的人来说，结合生信分析做课题是不错的选择。 首先，来看看下面几篇
1. 生信分析文章范例解读 最近在检索文献时发现了 10 月有一篇生信文章，做的是关于三阴性乳腺癌中相关 ceRNA 差异表达谱的综合分析，于 2018 年 10 月 11 日发表在《Cellular physiology and biochemistry》杂志上，IF = 5.5。 由于小编就是做三阴性乳腺癌 non-coding RNA 的相关研究，一直都有关注 ceRNA 的研究，类似这篇文章的工作量投稿分数应为 3-5 分，而此文竟然突破 5 分门槛。 仔细阅读发现，原来这篇文章与常规
今天小编为你介绍常用的生信分析工具，这对你撰写研究方案和 SCI 文章写作很有帮助哦！1. solQTL（了解分析茄科、菊科的表型和基因型）网站链接：http://solgenomics.net/qtl/solQTL 是番茄基因组测序计划的基因组信息资源门户网站数据库 SGN (http://solgenomics.net) 的子模块。在 solQTL 上可看到全基因组 QTL 图谱的很多参数资料：同时，还能清楚看到染色体每个位点：目前的植物数据库 Gramene (http://www
技术资料