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伯豪生物生物信息学分析
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转录因子分析及网络构建介绍转录因子与基因表达调控区域的特异性结合是基因表达的重要调控方式。针对特定转录因子的实验，可对差异基因进行转录因子结合位点的 motif 分析，从而推测差异基因中有哪些基因可能直接受该转录因子调节。后结果会用统计学方法进行检验，找到调控目标生物性状，统计学上有显著差别的转录因子。找到差异的转录因子及其调控的靶基因，我们可以构建 TF-network，从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因，系统的研究转录因子与基因的调控关系。
基因相互作用网络图介绍基因网络是一组基因的集合体，这些基因通过相互协作来控制生物体重要的生命过程。我们将客户关注基因进行基于实验验证，其他亲缘物种数据库检索、文献挖掘等多种信息进行基因互作网络的构建，找到关键核心基因。
共表达网络构建根据基因表达信号值的动态变化，计算基因间的共表达关系，得到基因间的表达调控关系及调控方向，从而构建基因的表达调控网络。利用共表达网络图，研究者可通过分析基因调控能力，获得样本随实验变化的核心调控基因。
加权基因共表达网络分析（WGCNA）寻找协同表达的基因模块（module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中的核心基因。
microRNA 与靶基因网络图介绍将显著性功能与显著性 Pathway 所包 含的靶基因取交集后与 microRNA 构建 microRNA 靶基因调控网络，可以在全局的水平上直观的反应基因之间的相互关系，同时反映了基因调控网络的稳定性。根据网络中 microRNA 的位置函数计算出 microRNA 在网络中的关系强度，即 microRNA 的网络特征值。特征值高 microRNA 处于网络的枢纽性地位，该 microRNA 调控能力强，对网络结构和样本性状有重要的调控价值，同时从网络中也可以得到被 microRNA 调控的关键靶基因。
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Mr chong
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2023.03.20-2023.05.31
2023.03.13-2023.05.15
2023.02.15-2023.04.30
