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研载生物科技
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蛋白互作网络（PPI）
蛋白互作网络（PPI）
1 分析目的通过mRNA间的协同表达模式，分析mRNA间的相互作用，寻找核心的mRNA
2 数据来源
显著差异表达mRNA表达谱
3 分析方法
对上述差异mRNA，我们使用STRING数据库[9]构建相互作用网络，并根据基因的连接度确定其中的关键基因
4 交付文件
（1）PPI网络信息（Excel）
（2）PPI网络图
5分析结果示例图
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联系人：刘经理
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文献和实验，他们将所得的差异的甲基化基因与HPRD以及BIOGRID数据库进行比对分析，构建了蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction , PPI)网络。据报道，在网络中处于中心地位的基因较周围的基因具有更关键的细胞学功能。从PCOS-NIR和PCOS-IR病人的PPI网络图中，可以发现甲基化基因CEBPB, GOT1, GET4, ODC1 以及C12orf44形成了一个局部的网络结构（Figure 3A）。在PCOS病人与正常人的PPI网络图中，甲基化基因GSK3A, HMGA
蛋白抗体-proteinA/G小珠”复合物，纯化该复合物凝胶电泳分离蛋白，应用质谱分析鉴定靶蛋白的结合蛋白。 免疫共沉淀与质谱结合，不仅能验证已知蛋白的相互作用，而且还可以鉴定与目标蛋白互作的未知蛋白，为科学研究提供全新的实验思路。北京百泰派克生物科技有限公司提供蛋白互作，GST pull down，免疫共沉淀及IP-MS相关服务，欢迎垂询！ 资料来源：网络资料 图片来源：百泰派克生物【biotech-pack】
了 2 张表格。 （1）表 2：这里作者罗列了一堆与 UBE2C 表达正相关和负相关的基因，以及他们的结合位点。 图 6（来源：文献表 2） （2）表 3：这里作者选择了几个 UBE2C 相关重点基因，详细分析了一下。 图 7（来源：文献表 3） 结果四：UBE2C 蛋白互作网络 这一部分结果包含了图表各一张。 （1）图 5：熟悉的蛋白互作图，蓝色代表驱动家族成员，红色代表参与比较重要的细胞过程的分子，绿色是抑癌基因。 图 8（来源：文献图 5） （1）表 4：KEGG 通路分析，包含
