数据挖掘之TCGA

技术概述

癌症基因组图谱联盟（TCGA）是美国国立卫生院（NIH）和美国人类基因组研究院（NHGRI)共同发起和资助的大科学计划。目前，TCGA计划已经落定，但是基于TCGA里33种不同癌症类型，11000多个肿瘤的Pan-cancer研究如火如荼。2018年9 月，美国华盛顿召开TCGA和癌症多组学研究的会议，众多科学家仍然在继续挖掘TCGA给我们留下的宝贵财富。

TCGA结果可视化

图1：癌症病人按照TCGA的转录组数据进行聚类分析，聚类之前采用智预自主开发的特征值工程得到的量化指标。A，gap统计量确定聚类数目；B，k均值聚类将病人分为四大类。

图2：生存曲线分析

图3：突变类型分析

图4：top突变可视化

图5：免疫细胞浸润可视化
 

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