microRNA靶基因分析

mciroRNA靶基因分析
1．通过TargetScan, Mirbase, Miranda预测microRNA靶基因。
2．三个软件预测的前200个靶基因，两两之间取交集选取共同靶基因。
3．每个软件前50个靶基因与另外两个软件预测的所有靶基因相比，选取共同靶基因。
4．三个软件预测的前10个靶基因，如不在基因列表之内的，则加入列表中。
5．根据第4步得到的靶基因进行显著性GO功能集分析和显著性Pathway分析,将GO和Pathway所包含的靶基因取交集。

6．所得靶基因根据三个软件总得分排序(各自得分做标准化相加)。