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microRNA靶基因分析
1．通过TargetScan, Mirbase, Miranda预测microRNA靶基因。
2．三个软件预测的前200个靶基因，两两之间取交集选取共同靶基因。
3．每个软件前50个靶基因与另外两个软件预测的所有靶基因相比，选取共同靶基因。
4．三个软件预测的前10个靶基因，如不在基因列表之内的，则加入列表中。
5．根据第4步得到的靶基因进行显著性GO功能集分析和显著性Pathway分析,将GO和Pathway所包含的靶基因取交集。
6．所得靶基因根据三个软件总得分排序(各自得分做标准化相加)。
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文献和实验【讨论】MicroRNA与靶mRNA不完全互补能否导致后者降解
出自哪儿？能够说清楚点吗？ 有这个印象 但是出处确实想不到了 dnazyme 楼主的这个概括太一般化，但是实际情况却更复杂。 请参考文献： The complexities of microRNA regulation: mirandering around the rules （The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, Volume 42, Issue
jiangyanwen 如何根据靶基因预测microRNA? 除了现有的几个公认的网站之外，有没有更准确的方法啊？请教请教！ zhujoker 如果有这么简单的话这方面的文章就不值，就如蛋白质相互作用，如果预测的60%准确，那么情况就简单多了 dujiaoshou 我也想知道，谢谢。 liuxinfanjian TargetScan
相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 1 CleaveLand:一个基于mRNA降解组数据预测MicroRNA 靶标的工具。网址：https://homes.bio.psu.edu/people/faculty/Axtell/AxtellLab/Software.html 2 miRGen：MicroRNA 基因和microRNA靶标数据库。网址：http://www.diana.pcbi.upenn.edu
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