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生物信息学分析
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北京青莲百奥生物科技有限公司
生物信息学是一门正在迅速兴起的交叉学科,位于生物学、计算机科学、数学等多个研究领域的交叉点上。蛋白质组生物信息学是蛋白质组学研究中不可或缺的分析工具,通过凝胶电泳、质谱等技术产生的海量数据必须依靠生物信息学进行分析处理。此外,从庞杂的实验数据中提取对生物学研究有意义的信息也是蛋白质组生物信息学的主要功能。
常用凝胶图像识别及分析软件
PDQUEST 7.0 Decyder 2D(GE)
常用质谱数据分析软件
Proteome Discoverer MaxQuant
常用数据库
NCBInr;Swiss-Prot;TrEMBL;PPI;GO(GENE ONTOLOGY);KEGG;STRING
数据分析项目汇总

聚类热图及差异蛋白筛选

功能分析

数据集交盖度分析

理化性质分析

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文献和实验基因芯片分析生物信息学 基因 芯片或基因微阵列是将很多(数千或数万个)寡核苷酸或DNA作为探针,密集排列于玻片等固相支持物上,将待分析样品标记与微点阵杂交并进行检测。 根据杂交信号强弱及探针位置和序列,可以确定靶DNA的表达情况以及突变和多态性存在与否等。芯片技术的突出特点是高度并行性、高通量、微型化和自动化等,被广泛用于基因转录情况分析、不同基因型细胞的表型分析以及基因诊断、药物设计等领域。 在微阵
生物信息学与遗传致病因子分析 自从人类基因组 测序完成后,对于人类“健康”与“疾病”相关基因的研究已经成为当今生物医学研究的最新趋势。借助生物信息学手段寻找、定位致病基因,并对基因本身及其产物的结构分析与功能注释等,为致病基因的研究提供了新的途径。 寻找致病基因可以通过连锁作图的方法进行定位,然后对定位的核酸序列进一步分析确定目标基因;可以依据文献,通过同源比对(BLAST)进行基因的克隆;也可以通过对差异表达的表达序列标签数据进行分析,从而发现可能的新的
人类基因组研究已进入一个重要时期,2000年将获得人类基因组的全部序列,这是基因组研究的转折点和关键时刻,意味着人类基因组的研究将全面进入信息提取和数据分析阶段,即生物信息学发挥重要作用的阶段。到1999年12月15日发布的第115版为止,GenBank中的DNA碱基数目已达46亿5千万,DNA序列数目达到535万;其中EST序列超过339万条; UniGene的数目已达到7万个;已有25个模式生物的完整基因组被测序完成,另外的70个模式生物基因组正在测序当中;到2000年1月28日为止,人类基因组已有16










