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miRNA测序
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百趣生物医学科技有限公司
产品介绍
miRNA是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA(ncRNA),其长度约为18~25nt。miRNA可在转录后水平与mRNA(靶基因)以完全匹配或不完全匹配的方式结合,从而抑制mRNA翻译或者促进mRNA剪切降解进而调控基因表达,发挥其生物学调控功能。
miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用,参与许多生命过程,如细胞增殖、细胞凋亡、脂肪代谢和细胞分化等。通过对miRNA进行测序及析,可以深入挖掘基因表达调控网络,具有重要的生物学意义。
技术优势
◉ miRNA测序技术能够一次性生成上百万条miRNA序列,极大地提高了测序的效率和准确性
◉ 快速鉴定特定条件下表达的已知miRNA,并发现新的miRNA,同时研究不同条件下miRNA的表达差异
◉ 适用于多种生物样本,包括动物、植物、微生物等
样本要求
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动物组织 |
实质脏器组织≥100 mg(脂肪、皮肤、骨头等RNA含量较低组织≥1 g) |
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植物组织 |
嫩叶根茎花果实≥500 mg;种子≥2 g |
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动物细胞 |
≥10⁶个 |
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人全血PAXgene采血管 |
≥2管,按照PAXgene采血管使用说明操作即可 |
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真菌菌体/菌丝 |
≥10⁷个/300mg |
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全血trizol法 |
新鲜采集≥5 ml |
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外泌体 |
≥1×10⁹个/30μg或100 μL(密度为10¹⁰个/mL 的体积要求) |
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RNA |
总量≥2 μg,浓度≥100 ng/μL,体积≥20 μL |
应用方向
◉ 疾病研究:挖掘疾病的 miRNA 分子标志物,用于疾病早筛、分型及预后评估,同时探索 miRNA 在疾病发生发展中的调控机制,助力靶向药物研发
◉ 基础生命科学研究:解析miRNA 在细胞分化、凋亡、个体发育等过程中的表达调控网络,发现新功能 miRNA 及其靶基因
◉ 农业育种研究:鉴定作物、畜禽中响应干旱、病虫害等逆境胁迫的 miRNA,辅助分子育种
◉ 药物研发:监测药物处理后 miRNA 的表达变化,评估药物疗效与作用靶点,同时分析药物对机体的潜在毒性。
1. On the trail of blood doping—microRNA fingerprints to monitor autologous blood transfusions in vivo.2020.American Journal of Hematology【IF=13.27】
2. MicroRNAs behave differently to drought stress in drought-tolerant and drought-sensitive grape genotypes.2023.Environmental and Experimental Botany【IF=8.78】
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文献和实验的小分子――筛选一定大小的RNA分子,连接到3'和5'的适配子(adapters),逆转录并通过PCR扩增、亚克隆并测序。miRNA前体在基因组上的定位和聚类是通过向基因组数据库查询进行。这个方法有助于判断miRNAs是否是mRNAs、tRNAs、rRNAs等分子的降解产物。 有的实验室通过一种RNA folding program 'mfold'来判断C. elegans和C. briggsae之间的高度保守区域是否含有潜在的miRNA前体,然后用Northern Blots的方法来确定
案例:通过深度测序分析乳腺癌中 microRNA 的序列和表达 背景: microRNAs 调控很多对肿瘤发生非常重要的基因。乳腺癌中很多 microRNAs 是下调的,但系统的乳腺癌中 microRNA 的表达分析还没有被报道。 目的: 利用 Illumina HiSeq2000 测序平台对不同类型乳腺癌组织和细胞进行测序,分析其 microRNAs 表达差异。 结果:通过对 11 个正常乳腺组织,17 个非转移
一、miRNA的靶基因寻找研究表明,一个基因可以受多个miRNA调控,而一种miRNA又可以参与调控多个靶基因,据预测,至少有30%的人类基因是miRNA的靶基因。这就足以显示出miRNA群体的重要性。而在人类疾病中多不同程度的表现出大量miRNA的上调和下调,这也足以显示miRNA在疾病发生过程中占据着非常重要的作用。而探讨miRNA的功能作用中最重要的一步就是高效准确的寻找到其所调控的靶基因。目前寻找靶基因主要是从以下两个方面入手。1.生物信息学方法miRNA靶基因的预测主要是根据生物
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