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北京青莲百奥生物科技有限公司
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转录组测序服务

技术原理
10x Genomics Chromium™系统的关键技术是利用上百万独特的Barcode标记不同的样品(长链DNA分子/单细胞)。首先,含有Barcode序列的Gel beads与样品和酶的混合物混合,然后与油表面活性剂结合形成GEMs(Gel Bead-In-Emulsions,意为包裹Gel beads,样品以及酶的混合物的油滴)。收集GEMs 流到储液器,Gel beads溶解释放Barcode序列,开始对样本进行标记。将每个液滴中含有Barcode 信息的产物混合,构建标准测序文库上机测序。

图片来源10x Genomics Chromium Singelcell 3’ solution Application
实验路线

技术优势

10x Genomics转录组测序优势:
超高通量:单个样本细胞检测数可达1000-10000个;
项目周期短:一天内即完成从细胞悬液到cDNA文库构建所有的测序准备工作;
细胞捕获效率高:单个细胞捕获效率高达65%,可以准确鉴别稀有细胞类型;
真正的单细胞测序:通过油滴-barcode-单细胞的对应关系,实现真正意义上的单细胞测序;
测序平台兼容度广:与Illumina各种型号的平台高度兼容。
应用方向

生信分析

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文献和实验单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域,但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题,比如: 1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液,比如已经在-80℃冻存的样本; 2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获,比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等,由于直径过大,超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径; 3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失,比如脑部的新生神经元、肾脏的肾小球足细胞和肾小球系膜细胞等都会在单细胞
tumorigenesis by restricting hepatocyte-driven macrophage activation and inflammation 发表期刊:Immunity 影响因子:43.474(2022 年最新数据) 2.实验基础信息 样本信息: 对照组:WT 小鼠 实验组:除 WT(untreated)外,其它组小鼠(雄性)均出生后两周开始注射 DEN,后期每周注射 CCl4 以诱导肝癌的发生。 单细胞捕获平台:10X Genomics 单细胞实验分组:Miz1∆hep:Miz
进程 发表时间:2019年4月 发表期刊:Science 影响因子:47.724 研究物种:玉米雄蕊 植物不会像动物那样从早期发育中保留生殖细胞谱系,而是按照需求生成生殖细胞。减数分裂是一个复杂的过程,在有性繁殖过程中起着关键的作用,染色体数目减半并通过重组产生新的等位基因组合。利用单细胞测序技术,从细胞层面上更加深入的解析这个过程的发生发展,本研究对玉米顶部花药中的体细胞和发育中的生殖细胞进行单细胞测序,分析研究减数分裂过程中细胞转录组的变化情况。 图4玉米减数分裂的发育流程(图片
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