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miRNA芯片数据发掘分析
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上海英拜生物科技有限公司
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二、microRNA靶基因预测
“TargetScanS”,“miRanda (miRBase)”,“miRGen”等数据库预测差异microRNA的所有靶基因。
- 靶基因GO分析
- 靶基因pathway分析
- 构建MicroRNA与基因的调控网络
- microRNA 、靶基因、转录因子调控网络
- microRNA启动子分析及甲基化位点分析
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文献和实验pianpianqiwu812 求助各位老师,近期我做了6张miRNA芯片,实验组3张,对照组3张,公司给我的数据只有相对值,没有P值。原因是芯片数量少,不需要做统计学分析。这种说法是否对?还有就是在计算差异倍数时是用实验组相对值分别除以对照组的相对值,倍数在2倍以上的入选。这样计算是否对,还是倍数计算也是要有相关软件的?我在这方面真是只菜鸟,不懂的很多,公司说的我感到有些可疑。:( zhujoker 这个你在做的时候就应该
刚才在网上看到的,不知道是不是有人发过了。 网址:http://www.csc.fi/oppaat/siru/ 下载地址:http://www.csc.fi/oppaat/siru/siruwww.pdf 分部分下载地址: Part I http://www.csc.fi/oppaat/siru/sirupartI.pdf PartII http://www.csc.fi/oppaat/siru/sirupartII.pdf PartIII http://www
今天给大家介绍一种简单快速的基因芯片数据分析网站GCBI 基因云平台(www.gcbi.com.cn),可以让科研人员及医生低门槛并且快速的使用生物信息学进行基因相关的研究。 分析思路 先以表达谱数据为例介绍基本的分析思路: 1. 差异基因筛选: 对实验组和对照组进行差异基因筛选,筛选出与实验因素(可以是疾病、干扰或过表达等)相关的差异表达基因。 2. 差异基因功能与通路分析: 对差异基因基于 GeneOntology 和 KEGG 数据库进行显著










