CHIRP seq实验

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      上海典西生物有限公司

    • 服务名称

      CHIRP又称RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin isolation by RNA purification),该方法采用设计与目标RNA序列反向互补的生物素探针组,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段或蛋白质就会附在到磁珠上,最后把染色体片段或蛋白质做高通量测序或质谱分析,这样会明确目标RNA能够结合到基因组的哪些区域。CHIRP常用来检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。

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    服务介绍

             CHIRP又称RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin isolation by RNA purification),该方法采用设计与目标RNA序列反向互补的生物素探针组,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段或蛋白质就会附在到磁珠上,最后把染色体片段或蛋白质做高通量测序或质谱分析,这样会明确目标RNA能够结合到基因组的哪些区域。CHIRP常用来检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。

    公司优势

           1.   技术技巧长期积累,技术经验丰富;

             2.  专业的生物信息学分析;

    客户提供 

             1. 提供LncRNA基因名称,序列信息及种属来源;

             2. 提供细胞名称及培养条件(活细胞量:10E7)

    最后交付

             完整的实验报告包括实验步骤,探针组序列,高通量测序数据及分析,质谱鉴定数据及分析。

    参考文献

             1.  Systematic discovery of Xist RNA binding proteins. Cell 161(2):404-416(2015).

              2.  Genomic maps of long noncoding RNA occupancy reveal principles of RNA-chromatin interactions. Mol Cell 44(4):667-678 (2011).

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