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上海典西生物有限公司
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CHIRP又称RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin isolation by RNA purification),该方法采用设计与目标RNA序列反向互补的生物素探针组,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段或蛋白质就会附在到磁珠上,最后把染色体片段或蛋白质做高通量测序或质谱分析,这样会明确目标RNA能够结合到基因组的哪些区域。CHIRP常用来检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。
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服务介绍
CHIRP又称RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin isolation by RNA purification),该方法采用设计与目标RNA序列反向互补的生物素探针组,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段或蛋白质就会附在到磁珠上,最后把染色体片段或蛋白质做高通量测序或质谱分析,这样会明确目标RNA能够结合到基因组的哪些区域。CHIRP常用来检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。
公司优势
1. 技术技巧长期积累,技术经验丰富;
2. 专业的生物信息学分析;
客户提供
1. 提供LncRNA基因名称,序列信息及种属来源;
2. 提供细胞名称及培养条件(活细胞量:10E7)
最后交付
完整的实验报告包括实验步骤,探针组序列,高通量测序数据及分析,质谱鉴定数据及分析。
参考文献
1. Systematic discovery of Xist RNA binding proteins. Cell 161(2):404-416(2015).
2. Genomic maps of long noncoding RNA occupancy reveal principles of RNA-chromatin interactions. Mol Cell 44(4):667-678 (2011).
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