RNA Pull Down MS实验

服务介绍

           RNA pulldown采用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆/胞核/全蛋白提取液进行孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白或质谱鉴定RNA结合蛋白的种类。常用于LncRNA基因调控的转录因子。

公司优势

        1.  技术技巧长期积累，技术经验丰富，并建立有自己的lncRNA调控转录因子的数据库；

        2.  专业的生物信息学分析；

        3.  具有大量的Western blot验证进口抗体现货，待客户挑选出感兴趣的3-5个RNA结合蛋白后，公司可免费提供现有抗体进行RNA结合蛋白的Western blot验证。

客户提供 

        1.  提供lncRNA基因的名称，序列（确定该序列是否有通过实验验证）及lncRNA基因的定位（即确定胞浆/胞核/全蛋白提取液进行RNApulldown实验）；

        2.  提供lncRNA基因的过表达质粒；

        3.  提供细胞（活细胞量：3X10E7）；

最后交付

        完整的实验报告包括实验步骤，sense和antisense探针序列，SDS-PAGE银染图，sense组质谱数据，antisense组质谱数据，Differential proteins及GO功能分析

参考文献

      1.  Silencing of the mRNA-binding protein HuR increases the sensitivity of colorectal cancer cells to ionizing radiation through upregulation of caspase-2. Cancer Lett 393:103-112(2017). 

      2.  The long noncoding RNA ASNR regulates degradation of Bcl-2 mRNA through its interaction with AUF1. Sci Rep 6:32189 (2016).