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上海典西生物科技有限公司
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RNA pulldown实验
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询价
服务介绍
RNA pulldown采用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆/胞核/全蛋白提取液进行孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白或质谱鉴定RNA结合蛋白的种类。常用于LncRNA基因调控的转录因子。
公司优势
1. 技术技巧长期积累,技术经验丰富,并建立有自己的lncRNA调控转录因子的数据库;
2. 专业的生物信息学分析;
3. 具有大量的Western blot验证进口抗体现货,待客户挑选出感兴趣的3-5个RNA结合蛋白后,公司可免费提供现有抗体进行RNA结合蛋白的Western blot验证。
客户提供
1. 提供lncRNA基因的名称,序列(确定该序列是否有通过实验验证)及lncRNA基因的定位(即确定胞浆/胞核/全蛋白提取液进行RNApulldown实验);
2. 提供lncRNA基因的过表达质粒;
3. 提供细胞(活细胞量:3X10E7);
最后交付
完整的实验报告包括实验步骤,sense和antisense探针序列,SDS-PAGE银染图,sense组质谱数据,antisense组质谱数据,Differential proteins及GO功能分析
参考文献
1. Silencing of the mRNA-binding protein HuR increases the sensitivity of colorectal cancer cells to ionizing radiation through upregulation of caspase-2. Cancer Lett 393:103-112(2017).
2. The long noncoding RNA ASNR regulates degradation of Bcl-2 mRNA through its interaction with AUF1. Sci Rep 6:32189 (2016).
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文献和实验,只要互作蛋白间具有相互结合的结构域基础即可实验证明;Co-IP 实验是细胞内高表达目的蛋白,并通过 IgG 球珠-抗体-蛋白复合物体系,分离出互作的蛋白复合物,是细胞内的体内反应结合。2. GST pull-down 实验优点① 可验证蛋白质-蛋白质之间的直接互作。② GSH 谷胱甘肽偶联球珠亲和力强,洗脱纯度高。3. GST pull-down 实验缺点① 验证互作是在试管中进行的生化反应,不能够完全反应细胞内蛋白真实互作状态。② 融合表达的 GST 标签,肽链较长,可能会改变原目的蛋白的原有的折叠结构。
qiubiaodsg 我最近在做pull down 实验,先用western blot 标记的是被拉的蛋白,结果片子上是一片白板,连作为对照的input(只有被拉的蛋白)都没曝出来,请各位高手知道一下吧,谢谢。本人western 没有问题。 dianaofyezi 如果连对照都没有出来,就首先应该考虑程序流程的问题,无论是否发生了pull down,起码对照应该成立不是么?然后再考虑的是相互作用的蛋白的问题。
非编码RNA(Non-coding RNA)是指不编码蛋白质的RNA,包括miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA等。非编码RNA发挥功能的方式很多,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种细胞活动,主要包括基因的激活和沉默,RNA的剪接、修饰和编辑,蛋白质的翻译等。 1. miRNA:miRNA是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。 图
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