Chip-seq实验

服务介绍

       ChIP-Seq实验是将染色质免疫共沉淀ChIP与第二代测序相结合的技术。通过特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。ChIP-Seq技术常用于在全基因组范围内分析与组蛋白、转录因子等特异结合的DNA位点信息，且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

公司优势

       1.   技术技巧长期积累，技术经验丰富；

       2.  专业的生物信息学分析；

客户提供 

      1.  提供转录因子或组蛋白的名称及相应的ChIP级抗体；

      2.  确定实验分组及处理方式；

      3.  提供组织细胞（a.组织大于500mg，活细胞量：10E7；b.由公司提供甲醛进行固定；c.样品固定前请咨询技术）

最后交付

     完整的实验报告包括实验步骤，实验数据及生物信息学分析包括测序数据质量评估，与参考基因组比对，peak峰calling，motif分析，peak峰相关基因注释，差异peak分析，相关基因GO，KEGG富集分析等；

参考文献

      1. Role of ChIP-seq in the discovery of transcription factor binding sites, differential gene regulation mechanism, epigenetic marks and beyond. Cell Cycle 13(18):2847-2852(2014).

      2. Liver ChIP-seq analysis in FGF19-treated mice reveals SHP as a global transcriptional partner of SREBP-2. Genome Biol 16:26(2015)8.