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新物种De novo测序
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晶能生物
根据物种基因组的复杂度，特别是重复区域的大小和数量等信息，科学的制备各种长度插入片段的测序文库，合理的使用不同的高通量测序技术，能够高效经济的完成高等动植物的基因组图谱绘制。
晶能优势：
1） 有着丰富的mate-pair文库构建经验。
2） 拥有Hiseq 3000，为客户提供更准确和更大通量的实验数据。
技术路线：
生物信息学分析：
样本要求：
1） 样品总量：≥ 30ug。
2） 样品浓度：≥ 50ng/ul，样品浓度越高越好。
3） 样品纯度：OD值260/280应在1.8～2.0。
4） 样品质量：基因组完整、无降解。
5） 样品包装：用封口膜密封样品，DNA低温运输（-20℃）。
应用案例：
Genome sequence and analysis of the tuber crop potato.
Nature. 2011 Jul 10;475(7355):189-95.
研究人员使用纯合的加倍单倍体马铃薯克隆进行高通量测序。组装得到86％的基因组，并预测到39,031个蛋白编码基因。同时研究人员还将马铃薯的杂合二倍体克隆测序，发现基因会频繁发生各种潜在的有害突变，这可能是导致近交衰退的一个原因。进一步研究表明基因家族扩展，组织特异性表达，招募基因进入新信号通路都导致了块茎发育的进化。马铃薯基因组序列的获得为这个重要农作物的遗传改良提供了一个强有力的平台。
参考文献：
Potato Genome Sequencing Consortium. Genome sequence and analysis of the tuber crop potato[J]. Nature, 2011, 475(7355): 189-195.
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