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北京青莲百奥生物科技有限公司
- 服务名称:
蛋白组转录组关联服务
- 规格:
6个样本起
蛋白质组是生物体最终的功能执行体,而转录组是连接基因组和蛋白质组的中间模块。生物体往往通过基因的转录调控基因表达,同时也通过翻译调控以及翻译后的调控进一步对蛋白质的表达进行调节。当前研究表明转录组和蛋白组的相关系数往往只有 0.4 左右,表明其间的翻译后调控对蛋白质的表达具有非常重要的作用。
因此,当前的研究越来越倾向于同时检测转录组和蛋白组的表达水平,这种研究能充分利用转录组和蛋白组研究的差异性和互补性,对基因的表达水平进行全方位的衡量,以获得基因表达各个步骤表达和调控的全景图, 发掘常规单个组学未能发现的新结果。
联合分析研究思路

应用领域
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基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
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生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
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微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体 - 宿主相互作用研究等;
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食品安全:食品储藏及加工条件优化,功能性食品开发,食品安全监测等。
联合分析图例展示

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文献和实验高分辨率转录组和蛋白组的整合研究
培养和细菌、酵母、小鼠以及人类的整体动物模型的mRNA和蛋白质丰度情况,可以实现转录物和蛋白质表达的整体定量分析(如表1)。在蛋白组学分析过程中,一些研究选择了双向凝胶电泳(2-DE)分析蛋白质混合物。要么是对不同的凝胶染色,要么是让不同的细胞与不同的染料相结合,通过斑点染色亮度可以看到蛋白质的亮度。随后用质谱仪对分离出的定量凝较斑点进行鉴定,与转录组学分析不同的是,双向凝胶电泳分析的鉴定结果与定量分析是散耦合(de-coupled)。双向凝胶电泳的一大优点是,它能将翻译后已修改的蛋白质分解为一连串的斑
炎细胞因子及淋巴细胞的增殖能力, BHLHE40+ 中性粒细胞的高浸润也与 PDAC 不良预后相关,说明 BHLHE40 是驱动中性粒细胞向促肿瘤和免疫抑制亚型分化的关键调控因子。 Summary 总的来说,研究者利用单细胞测序、空间转录组测序、免疫荧光、免疫组化、代谢组、蛋白组、转录组分析等多种技术手段,揭示了胰腺导管腺癌中中性粒细胞的作用。鉴定出了一个中性粒细胞的促肿瘤亚群—TAN-1,揭示了 TAN 中高糖酵解活性与促肿瘤功能之间的关联,并证明了缺氧和 ER 应激诱导的 BHLHE40 激活可驱动TAN
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